CENTRE DE RESONANCE MAGNETIQUE DES SYSTEMES BIOLOGIQUES

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Transcription de la présentation:

CENTRE DE RESONANCE MAGNETIQUE DES SYSTEMES BIOLOGIQUES UMR 5536 CNRS / Université Victor Segalen Bordeaux 2 RATTACHEMENT CNRS : DEPARTEMENT SCIENTIFIQUE PRINCIPAL : « Vivant » Demande de rattachement secondaire au département « ST2I » (accueil d’un CR2 issu de ce département) SECTION DU COMITE NATIONAL : 30

UNE FORTE INTERDISCIPLINARITE (Chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs) BIOLOGISTES MOLECULAIRES 2 BIOCHIMISTES 7 PHYSIOLOGISTES 2 PHYSICIENS (RMN) 4 ELECTRONICIENS 2 HOSPITALO – UNIVERSITAIRES 5

UNE RECHERCHE EN BIOLOGIE ET MEDECINE UTILISANT LES OUTILS DE LA RESONANCE MAGNETIQUE NUCLEAIRE SPECTROMETRIE IMAGERIE INFORMATION METABOLIQUE ELEVEE  FAIBLE RESOLUTION SPATIALE INFORMATION MORPHOLOGIQUE ET FONCTIONNELLE ELEVEE  RESOLUTION SPATIALE ELEVEE

PRINCIPALES MISSIONS DE L’UNITE  REALISER DES RECHERCHES EN SCIENCES DE LA VIE CO-PILOTER UNE PLATEFORME OPERATIONNELLE RIO EN RMN in vivo

LES INSTRUMENTS RMN DE LA PLATEFORME R.I.O Open Viva Biospec WB 400 DRX 500 9.4T 11.6T 0,2T 4.7T Intensité du champ magnétique Imagerie Spectrométrie

I Bourdelle-Marchasson ORGANIGRAMME DE LA CONTRACTUALISATION 2002-2006 Equipe 1 « Energétique et métabolisme » P Canioni M Merle JF Chateil P Diolez I Bourdelle-Marchasson L Arsac Equipe 2 « Nutrition Energétique et Compartimentation métabolique » JL Gallis MC Beauvieux H Gin V Rigalleau Equipe 3 « IRM et SRM De l’animal génétiquement Modifié » JM Franconi AK Bouzier-Sore G Clofent-Sanchez MJ Jacobin E Parzy E Thiaudière P Voisin V Bouchaud P Canioni Directeur JM Franconi Directeur Adjoint M Legal Accueil bibliothèque F Lastère Gestion, Secrétariat de direction - RMN haute Résolution G Raffard E Besançon RMN 47/50 M Biran Imagerie 0.2T G Raffard Animalerie S Sanchez Informatique réseaux H Valeins K Viaud . S SERVICES COMMUNS

LES IDEES QUI INSPIRENT LE PROJET UNE VOLONTE D’ADOPTER UNE DEMARCHE INTEGRATIVE EN SCIENCES DE LA VIE UNE EVOLUTION VERS LES EXPLORATIONS IN VIVO (SUR LE PETIT ANIMAL) UN LIEN FORT AVEC LES TECHNIQUES DE RMN Utiliser les potentialités des deux techniques (SRM,IRM) Optimiser les outils existants Développer de nouveaux outils

SPECTROMETRIE IMAGERIE LA DEMARCHE DE BIOLOGIE INTEGRATIVE CELLULE ORGANITE ORGANE ORGANISME IMAGERIE MOLECULE

L’IRM DU PETIT ANIMAL VIVANT Voxel : 1 x 1 x 10 = 10 mm3 Voxel : 0.165 x 0.165 x 0.165 = 0.0045 mm3 4000 fois plus petit Souris 20 g Humain 80Kg

LE DEVELOPPEMENT DE NOUVEAUX OUTILS ANTENNES OUTILS D’ANALYSE DU METABOLISME AGENTS DE CONTRASTE SEQUENCES

LA METHODE SUIVIE ADOPTER UNE DEMARCHE EN PROJET BENEFICIER DU SOUTIENT D’UN CONSULTANT FINANCE PAR LE SERVICE DE FORMATION CONTINUE DU CNRS « cabinet trajectoire »

LES GRANDES ETAPES DU PROJET ( un langage et une méthode de travail commune) CADRAGE DIAGNOSTIC Analyse externe Analyse interne Analyse forces faiblesses OBJET MOTIFS OBJECTIFS PLAN D’ACTION CALENDRIERS MOYENS RESISTANCES COMMUNICATION MOBILISATION OBJECTIFS TRANSVERSAUX COMMUNS

« TIMING » DE LA PREPARATION DU PROJET DE L’UMR 5536 ELLE S’INSCRIT DANS LA DEMARCHE QUALITE DEBUTEE EN JANVIER 2003 4 mars 4 avril 8 septembre 11 octobre 10 mars REUNION PRESENTATION BILAN Identification du groupe projet Première réunion projet Dernière réunion projet Première rencontre avec D. DUPRAT Réunions avec le formateur-consultant

(organisation d’une réunion de travail) LA METHODE DE TRAVAIL (organisation d’une réunion de travail) Définition des objectifs de la réunion 2) Examen des productions transmises Formation sur un point particulier 4) Commandes de production pour la réunion suivante 5) Définition de la date de la réunion suivante PRODUCTIONS COMMANDES Compte-rendus de réunions

RESULTATS : CE QUI CHANGE PROJET AVANT PROJET APRES Objet  résumé Motifs pourquoi ?, état de l’art Objectifs généraux Objectifs spécifiques quoi ? Opérationnels éléments livrables Plan d’action comment ? Moyens mobilisés avec qui ? Emploi du temps quand ? Analyse des risques Évaluation-bilan Plan de communication

EXEMPLE DE PLAN D’ACTION WP Lots d’actions Actions Ressources spécifiques € Partenaire Délivrables (autre que publi…) 1. Déterminat. des modèles biologiques Utilisation de microglies transfectées par un gène suicide + promoteur thermosensible Caractérisation de l’expression du transgène dans les microglies transduites par cytométrie et biochimie   P. Voisin + 3 6 mois Histogramme de fluorescence Tester l’effet du gancyclovir sur les microglies exprimant le transgène Courbe de viabilité cellulaire Culture de neurones et d’astrocytes Définition des conditions de culture et caractérisation immunocytochimique A.K. Bouzier-Sore + 2 3 mois Institut de Physiologie Lausanne, Suisse Image microscopique Développement et validation des modèles d’athérosclérose et de thrombose Validation du modèle lapin sous régime hyperlipidémiant G. Clofent-Sanchez +3 9 mois Inserm U.441 Lapin obèse Validation du modèle souris ApoE Karlheinz P, Australie Souris obèse

L’ORGANIGRAMME SCIENTIFIQUE DE L’UNITE UTILISER LES OUTILS RMN POUR COMPRENDRE LE FONCTIONNEMENT DES SYSTEMES BIOLOGIQUES (DEMARCHE INTEGRATIVE) AMELIORER DEVELOPPER LES OUTILS IDENTIFIER ET CARACTERISER LES DYSFONCTIONNEMENTS (DIAGNOSTIQUES) PROPOSER DES SOLUTIONS (THERAPEUTIQUES) FAVORISER LE TRANSFERT VERS LA CLINIQUE

IDENTIFICATION D’OBJECTIFS TRANSVERSAUX INTERET Contrôle métabolique de la fonction Contractile( C M F C) Nutrition, Maladies Nutritionnelles, Vieillissement et Métabolisme Energétique   Métabolisme du Cerveau Sain ou Pathologique Concepts et Soutien Méthodologiques (CSM)   Athérôme, microglie imagerie (A M I) Caractériser le processus de myélinisation démyélinisation SP1 SP1 SP1 SP1 Imager sélectivement des populations cellulaires OBJECTIFS TRANSVERSAUX SP2 SP2 SP2 SP2 Caractériser les processus métaboliques liés au Vieillissement cérébral, SP3 Proposer de nouvelles stratégies diagnostiques SP3 Cibler la plaque d’athérôme instable SP3 SP3 Décrire les effets pathologiques musculaires liés à l’âge et aux conditions hypoxemiantes SP4 SP4 SP4 SP4 OBJECTIFS SPECIFIQUES DES COMPOSANTES

Comprendre les mécanismes de systèmes biologiques intégrés ORGANIGRAMME FONCTIONNEL   OBJECTIFS : Utiliser les potentialités de la RMN OBJECTIFS TRANSVERSAUX    COMPOSANTES THEMATIQUES Comprendre les mécanismes de systèmes biologiques intégrés Proposer de nouvelles stratégies diagnostiques Proposer de nouvelles stratégies thérapeutiques Développer de nouveaux outils et de nouvelles méthodes Concepts et Soutien Méthodologiques (CSM)   Détecter des métabolites dilués pour l’étude de la fonction contractile Imager sélectivement des populations cellulaires Concevoir de nouvelles méthodes pour améliorer le signal, la résolution et le contraste en RMN. Imager et caractériser les vaisseaux Athérôme, microglie imagerie (A M I)   Utiliser des agents de contraste pour localiser des métabolites spécifiques Cibler la plaque d’athérôme instable Utiliser les cellules microgliales comme vecteur pour de nouvelles thérapies cellulaires ou géniques Proposer de nouveaux agents de contraste intelligents Contrôle métabolique de la fonction Contractile( C M F C)   Décrire de façon intégrative les mécanismes de la contraction musculaire et myocardique Décrire les effets pathologiques musculaires liés à l’âge et aux conditions hypoxemiantes Appliquer l’analyse modulaire du contrôle aux thérapeutiques cardiaques Evaluer les effets de la nutrition et de l’entraînement physique sur le vieillissement de la fonction musculaire Développer de nouvelles méthodes d’analyse de la bioénergétique basées sur l’analyse du contrôle modulaire. Métabolisme du Cerveau Sain ou Pathologique   Comprendre le couplage entre l’activité cérébrale et le métabolisme énergétique Caractériser le processus de myélinisation démyélinisation Développer la spectrométrie HRMAS pour établir le lien entre la spectrométrie haute résolution sur extraits et la spectrométrie in vivo.   Nutrition, Maladies Nutritionnelles, Vieillissement et Métabolisme Energétique   -Comprendre l’effet sur le métabolisme cérébral de la carence en vitamine A. -Déterminer le rôle du métabolisme énergétique dans le déterminisme de l’insulino résistance.   -Caractériser les processus métaboliques liés : i)au Vieillissement cérébral, ii)au développement de l’insulinoresistance hépathique Déterminer les équilibres entre nutriments permettant de limiter le développement des maladies d’origine nutritionnelles Utiliser la spectrométrie RMN du deutérium pour quantifier l’eau produite par la respiration hépatique.  

Philippe Diolez CR1 CNRS POUR LA NOUVELLE CONTRACTUALISATION     « Imagerie de Résonance Magnétique Fonctionnelle et Interventionnelle »   « RMN in vivo Expérimentale et Clinique »   « Bioénergétique Cellulaire »   « Métabolisme Hépatique : Compartiments Cellulaires et Hypothermie» Accueil - Bibliothèque   Michèle Le Gall Aux.   Informatique & Réseau Animalerie   « Interactions Métaboliques dans les Cellules du Système Nerveux Central »   Plateforme Instrumentale RMN Responsable technique : Gérard Raffard     Philippe Diolez CR1 CNRS Michel Merle CR1 CNRS Sébastien Serres, Doct.   qualité Henri Valeins IE Henri Valeins IE     secrétariat de direction gestion, Fabienne Lastère AI Jean-Michel Franconi PR2 directeur proposé   SERVICES COMMUNS   Stéphane Sanchez AJT   Karine Viaud AI Infrastructure (entretien)     Open Viva 0,2 T SIEMENS M. Merle   A.-K. Bouzier , C. Maurange F. Poulletier de Gannes N. Rousse A. Vekris P. Voisin J.-L. Gallis I. Bourdel-Marchasson M.-C. Delmas-Beauvieux T. Durand G. Vidal Ph. Diolez F. Bergé N. Leducq P. Canioni B. Quesson E. Thiaudière C. Moonen N. Grenier O. Hauger R. Jones T. Loenneker M. Ries H. Trillaud F. Vimeux J. de Zwart ORGANIGRAMME PROPOSE POUR LA NOUVELLE CONTRACTUALISATION EQUIPE PROJET UNIQUE Responsable : J-M. Franconi Thématique : Arthérosclérose,microglie et imagerie : Animateur : J-M. Franconi G. Clofent-Sanchez (CR1 CNRS), A-K. Bouzier-Sore (CR2 CNRS), P. Voisin (MCUHC), M-J. Jacobin-Valat (IR2 CNRS),V Bouchaud P. Mellet (IR IFR) Thématique : Concept et soutien en méthodologie RMN : Animateur : E. Thiaudière (MCU) E. Parzy (MCU), M. Biran (IR CNRS), S. Miraux (CR2 CNRS), J-M. Franconi (PU) Thématique : Contrôle métabolique de la fonction contractile : Animateur : P Diolez (CR1 CNRS) L. Arsac (MCU), I. Bourdel-Marchasson (PU/PH), V. Arsac-Desquodt (MCU) Thématique : Intéractions métaboliques dans le système nerveux : Animateur : M. Merle (CR1 CNRS) J-F. Chateil (PU/PH), P. Canioni (PU) Thématique : Maladies nutritionnelles et imagerie métabolique : Animateur : J-L. Gallis (CR1 CNRS) M-C. Beauvieux (MCU/PH), H. Gin (PU/PH), V. Rigalleau (PU/PH) Directeur proposé : J-M. Franconi (PU) Gestion Secrétariat de direction : F. Lastère AI Qualité : H. Valeins IE , - Hygiène et Sécurité : M. Biran IR V. Bouchaud T Plateforme Instrumentale RMN Informatique et réseau : H. Valeins IE K. Viaud AI Accueil, bibliothèque : M. Legall Aux Animalerie : S. Sanchez AJT Responsable technique : G. Raffard Spectromètre 11.6T : E. Besançon IE Spectromètre imageur 9.4T : G. Raffard IE Spectromètre imageur 4.7T : M. Biran IR Imageur corps entier 0.2T : P. Massot IE . SERVICES COMMUNS

LES PRINCIPALES DIFFICULTES UNE CHARGE DE TRAVAIL EN PLUS  Difficulté de réaliser les productions à heure et à temps  Des réunions difficiles à programmer UN CHANGEMENT DE CULTURE IMPORTANT Difficulté de programmer les résultats de la recherche Des craintes pour l’indispensable « liberté » du chercheur Les difficultés à travailler en équipe La peur que la démarche soit mal vue par l’institution chargée de nous évaluer

LES APPORTS DE LA DEMARCHE PROJET POUR LA FORMATION  Tous les responsables des groupes thématiques ont reçu une formation de base au « management de projet »  Bonne préparation pour la participation aux réseaux et projets financés (ANR) DANS L’ORGANISATION DE L’UNITE Le laboratoire s’est structuré autour d’une équipe unique avec des objectifs transversaux communs. Amélioration de la communication interne. POUR LA COMMUNICATION  Amélioration de la visibilité du laboratoire POUR L’EVALUATION Mise en place d’outils d’auto-évaluation

EN CONCLUSION DEMARCHE EN PROJET DEMARCHE QUALITE POLITIQUE SCIENTIFIQUE DU LABORATOIRE DEMARCHE QUALITE POLITIQUE ORGANISATIONNELLE DU LABORATOIRE

L’ensemble des personnes du RMSB REMERCIEMENTS L’ensemble des personnes du RMSB Collaborations (ICMCB,IECB, IFR 4,…) L’Université Victor Segalen Bordeaux II Le service de Formation continue du CNRS Le programme IPA, La région Aquitaine www.rmsb.u-bordeaux2.fr