Protéine
TRANSCRIPTION TRADUCTION
Les protéines Essentielles pour la cellule Rôle structural Role fonctionnel Mobililité cellulaire Transport moléculaire Métabolisme (enzyme = catalyse des réactions chimiques) Régulation,...
Les protéines sont des polymères d’acides aminés
20 acides aminés naturels
Les acides aminés peuvent être classés selon différents critères physico-chimiques degré d'hydrophobie (caractère aliphatique), charge, capacité à échanger des liaisons hydrogène,… relations physico-chimiques existant entre les 20 acides aminés naturels 1D 3D
Les propriétés structurales et fonctionnelles des protéines dérivent des propriétés chimiques de la chaîne polypeptidique Folding problem
linéaire Alpha Helix & Beta Strand globulaire
Repliement de la chaîne polypeptidique (fold) Conformation native = conformation préférentielle stable
Organisation en domaines structuraux et fonctionnels Taille des protéines : ~ 60 aa 3 000 aa moyenne: 300 aa Les chaînes polypetidiques de plus de 200 résidus peuvent se replier en deux ou plusieurs blocs = domaines N-term. C-term. Domaine 1 Domaine 2
Comparaison de séquences pour inférer des connaissances % identité Identité de séquence = identité de structure 3D = identité de fonctions 100 90 80 70 Comparaison de séquences pour inférer des connaissances 60 50 40 30 Alignement de séquences (A. Viari) 20 10
His Cys His Cys Exemple de motif: site de fixation d ’un ion (sphère grise) : résidus C C H H Les acides aminés constituant le motif ne sont pas contigus sur la séquence primaire
Evènement de SPECIATION
Evènement de DUPLICATION