Examen cytobactériologique urinaire (ECBU) 18 juin 2009 Michelle BOYER

L’examen cytobactériologique urinaire (ECBU) est l’analyse bactériologique la plus fréquemment pratiquée au laboratoire.

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Indications Situations d’infection urinaire (IU) sauf cystites aiguës simples d’évolution favorable. Dépistage des colonisations: grossesse, chirurgie urinaire.

NOMENCLATURE DES ACTES DE BIOLOGIE MEDICALE = 18€90

Etapes de l’ECBU: Prélèvement, conservation Examen direct (cellules, bactéries) Culture, compte de germes.

1- Prélèvement, conservation

L’urine est normalement stérile. Facilement contaminée par la flore commensale. Toilette, élimination du 1er jet. Flacon stérile Temps de stase ( au moins 4h)

Problème des patients incontinents Recueil chez l’enfant: milieu de jet, poches (= collecteur) à urines, moins de 30 mn

2h à température ambiante Jusqu’à 48h en flacon + borate Sinon: Modification du compte de germe Altération des cellules

2 - Examen direct Cytologie - bactériurie

Etape capitale pour le dépistage et le diagnostic rapide (Afssaps) Résultat en urgence ( Pédiatrie)

Leucocyturie et hématurie: mesure microscopique ou automatique

Mesure quantitative Le seuil normal de la leucocyturie est de: 10/mm3 ou 104/ml Si le comptage est automatisé, normes fabricant: ex: 25/mm3 adulte, 10/mm3 enfant

Le seuil de l’hématurie est de: 10/mm3 ou 104/ml Si le comptage est automatisé, normes fabricant: ex: 20/mm3 adulte, 10/mm3 enfant

Autres éléments: Résultat semi-quantitatif Cellules épithéliales cristaux Cylindres Parasites

Résultat semi-quantitatif Bactériurie: Résultat semi-quantitatif Par microscopie (coloration de Gram) ou automate + microscopie

Le seuil de détection est de 105 UFC/ml identique pour les 2 techniques (microscopique ou automatique) La coloration de Gram donne une orientation sur le type de bactérie

Exemples: Bacilles gram négatif polymicrobien

La présence de bactéries: Si + : ≥ 105 UFC/ml → Gram pour orientation du traitement Si - : < 105 UFC/ml, mais IU possible! Si flore variée (± cellules épithéliales): contamination

La présence de leucocytes: en faveur d’une IU si ≥ 10/mm3 ou ≥ 104 /ml +/- cylindres leucocytaires et amas de leucocytes ( pyurie)

Mais… La leucocyturie peut être absente au cours d’authentiques IU: - prélèvement très précoce - patients neutropéniques - enfant de moins de 3 mois - lyse des leucocytes (conservation)

Inversement… La leucocyturie peut être présente et non spécifique d’IU: ex: urétrite, vulvo-vaginite, maladie inflammatoire (Kawasaki), porteur de sonde, vessie neurologique…

L’absence de leucocyturie et de bactériurie a une excellente valeur prédictive négative ( proche de 100%) La valeur prédictive positive est médiocre.

3 - Culture, identification, numération, antibiogramme

La culture est nécessaire pour: Préciser l’espèce bactérienne (IU mono ou bimicrobienne) Réaliser l’antibiogramme

Palmarès des bactéries ( CH de Roanne): Escherichia coli 50% Enterococcus sp. 10% Proteus mirabilis 5% Klebsiella pneumoniae 5%

La numération de germes en UFC/ml est nécessaire à l’interprétation. Plusieurs seuils en fonction de la forme clinique et de l’espèce bactérienne.

≥ 103 UFC/ml: cystites aiguës à E ≥ 103 UFC/ml: cystites aiguës à E.coli et autres entérobactéries ou Staph. saprophyticus. ≥ 105 UFC/ml: cystites à autres bactéries ( entérocoque) ≥ 104 UFC/ml: pyélonéphrites et prostatites

Interprétation de l’ECBU: doit prendre en compte L’état clinique du patient (enfant < 3mois, personne âgée…) Les conditions de réalisation du prélèvement. L’existence d’une antibiothérapie.

Cas particuliers: Symptômes urinaires + bactériurie à l’examen direct + culture stérile: → UI décapitée ( traitement ATB) → bactérie difficile à cultiver (ex:anaérobie)

Si la leucocyturie est présente + absence de bactériurie à l’examen direct + culture stérile: → tuberculose → traitement antibiotique

Prudence: Si la leucocyturie est absente et la bactériologie significative: → IU chez le jeune enfant, → IU chez le neutropénique, → IU lorsque le prélèvement est très précoce

→ contamination vaginale Très souvent: Chez une femme: nombreuses cellules épithéliales + bacilles Gram positif (lactobacilles) à l’examen direct + culture (103 ou 104 UFC/ml) flore polymorphe : → contamination vaginale