Tests de comparaison de pourcentages

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Transcription de la présentation:

Tests de comparaison de pourcentages Docteur Alexandrine Lambert > Faculté de Pharmacie

Comparer deux pourcentages Variable qualitative dichotomique (Présence/Absence, Malades/Non malades, Décès/Survie, …)  est le pourcentage (inconnu) d’individus présentant la caractéristique dans la population  est estimé par le pourcentage p observé sur un échantillon de taille n dont k individus présentent la caractéristique

Comparer deux pourcentages Comparaison de deux pourcentages dans le cas des grands échantillons. Comparaison d’un pourcentage observé à un pourcentage théorique Comparaison de deux pourcentages observés Échantillons indépendants Échantillons appariés

Comparer deux pourcentages Comparaison de deux pourcentages dans le cas des grands échantillons. Comparaison d’un pourcentage observé à un pourcentage théorique Comparaison de deux pourcentages observés Échantillons indépendants Échantillons appariés

Comparer un pourcentage à une valeur théorique Problème : déterminer si un pourcentage observé p sur un échantillon de taille n est différent d’une valeur théorique th Comparer  à th Population  (inconnu) Population de référence th (connu) Échantillon p

Comparer un pourcentage à une valeur théorique Formuler une hypothèse Hypothèse nulle H0  = th où  est le pourcentage de la population dont est issu l’échantillon Hypothèses alternatives H1 Test bilatéral :  ≠  th Test unilatéral à gauche ou à droite :  <  th ou  >  th

Comparer un pourcentage à une valeur théorique Fixer le risque α Choisir la statistique Test du χ2 de conformité (loi du X2) Test z (loi normale) Conditions d’application : n. th ≥ 5 et n.(1- th) ≥ 5 (cas des grands échantillons)

Comparer un pourcentage à une valeur théorique  Test du χ2 de conformité Calculer la valeur χ2 prise par la statistique du test Tableau Conditions d’application : C1 ≥ 5 et C2 ≥ 5 Sous H0 la statistique suit une loi du X2 à 1 ddl Effectifs observés O1 = n.p O2 = n.(1-p) n Effectifs calculés C1 = n.th C2 = n.(1-th) 8

Comparer un pourcentage à une valeur théorique  Test du χ2 de conformité Confronter à la valeur seuil Lecture de la valeur seuil dans la table de la loi du 2 Test bilatéral : on rejette H0 au risque  si En pratique, si  = 5%, Si : rejet de H0 Si : non rejet de H0

Comparer un pourcentage à une valeur théorique Exemple 1 En France, 7% des personnes hospitalisées contractent une infection nosocomiale dans l'établissement où elles sont soignées. Sur un échantillon de 250 personnes soignées à l’hôpital H, 28 ont contracté une infection nosocomiale. Le pourcentage observé sur l’échantillon diffère-t-il de la référence nationale au risque α = 5% ?

Comparer un pourcentage à une valeur théorique Test du χ2 : exemple 1 Données : Hypothèses : H0 :  = 0,07 ; H1 :  ≠ 0,07 Calcul Conditions d’application vérifiées : C1 ≥ 5 et C2 ≥ 5

Comparer un pourcentage à une valeur théorique Test du χ2 : exemple 1 Lecture 3,84 : rejet de H0 On montre, au risque 5%, une différence significative entre le pourcentage de personnes hospitalisées contractant une infection nosocomiale à l’hôpital H et dans l’ensemble du pays (p < 0,01).

Comparer un pourcentage à une valeur théorique  Test z Calculer la valeur z prise par la statistique Z Sous H0, Z suit une loi normale centrée réduite Conditions d’application : n.th ≥ 5 et n.(1- th) ≥ 5 Équivalence entre χ2 et test z : χ2 = z2 χ2 à 1 ddl est le carré d’une loi normale centrée réduite Équivalent à C1 et C2 ≥ 5

Comparer un pourcentage à une valeur théorique Test z Confronter z à la valeur critique zα Test bilatéral : on rejette H0 si |z|≥ zα Test unilatéral : si H1 s’écrit  > th, on rejette H0 si z ≥ z2α si H1 s’écrit  < th, on rejette H0 si z ≤ -z2α Pour un même risque d’erreur, les valeurs seuil du 2 sont donc les carrés des valeurs seuil de z : 21,=(z)2 (3,84 =1,962)

Comparer un pourcentage à une valeur théorique Test z : exemple 1 Données : Hypothèses : H0 :  = 0,07 ; H1 :  ≠ 0,07 Calcul Conditions d’application vérifiées : 250 x 0,07 ≥ 5 et 250 x 0,93 ≥ 5

Comparer un pourcentage à une valeur théorique Test z : exemple 1 Lecture z = 2,60 ≥ z0,05 =1,96 : rejet de H0 Degré de signification lu dans la table : p < 0,01 (même conclusion que test précédent)

Comparer deux pourcentages Comparaison de deux pourcentages dans le cas des grands échantillons. Comparaison d’un pourcentage observé à un pourcentage théorique Comparaison de deux pourcentages observés Échantillons indépendants Échantillons appariés

Comparer 2 pourcentages observés - Échantillons indépendants - Problème : comparer 2 proportions (p1 et p2) dans 2 groupes indépendants de tailles n1 et n2 Comparer 1 à 2 Population 1 Population 2 Échantillon p1 Échantillon p2

Comparer 2 pourcentages observés - Échantillons indépendants - Formuler une hypothèse Hypothèse nulle H0 Les 2 échantillons sont issus de la même population ayant comme pourcentage0 1 = 2 (= 0) où 1 et 2 pourcentages de la population dont sont issus les échantillons 1 et 2 Hypothèses alternatives H1 Test bilatéral : 1 ≠ 2 Test unilatéral : 1 < 2 ou 1 > 2

Comparer 2 pourcentages observés - Échantillons indépendants - Fixer le risque α Choisir la statistique : Test du χ2 (loi du χ2) Test z (loi normale) Conditions d’application : n1. 0 ≥ 5 et n1.(1- 0) ≥ 5 n2. 0 ≥ 5 et n1.(1- 0) ≥ 5

Comparer 2 pourcentages observés - Échantillons indépendants -  Test du χ2 Calculer la valeur χ2 prise par la statistique Tableau de contingence (tableau à 4 cases) Conditions d’application : Cij ≥ 5 Sous HO la statistique suit une loi du X2 à 1 ddl Effectifs calculés sous H0 :

Comparer 2 pourcentages observés - Échantillons indépendants -  Test du χ2 : Remarques Dans le cas des tableaux de contingence à 4 cases, il est possible d’utiliser la correction de continuité, surtout lorsque les valeurs attendues sont faibles (en pratique Cij < 5) Petits échantillons : test exact de Fisher (hors programme)

Comparer 2 pourcentages observés - Échantillons indépendants -  Test du χ2 Confronter à la valeur critique Lecture de la valeur seuil dans la table Test bilatéral : Si : rejet de H0 Si : non rejet de H0

Comparer 2 pourcentages observés - Échantillons indépendants - Exemple 2 On désire comparer l’efficacité de deux traitements T1 et T2 sur 100 patients atteints d’une maladie M. On tire au sort 2 deux groupes de 50 patients, un groupe est soumis à T1, le second à T2. Le pourcentage de guérison chez les patients soumis à T1 est de 30%, chez ceux soumis à T2 de 40%. Le taux de guérison est-il différent entre les 2 traitements ?

Comparer 2 pourcentages observés - Échantillons indépendants - Test du χ2 : exemple 2 Données : Hypothèses : H0 : 1 = 2 ; H1 : 1 ≠ 2 Calcul Conditions d’application vérifiées : Cij ≥ 5

Comparer 2 pourcentages observés - Échantillons indépendants - Test du χ2 : exemple 2 Lecture 3,84 : H0 acceptable. On ne met pas en évidence, au risque 5%, de différence significative entre les taux de guérison avec les 2 traitements

Comparer 2 pourcentages observés - Échantillons indépendants -  Test z Calculer la valeur z prise par la statistique Z p0 est l'estimation de la proportion commune π0 Z suit une loi normale centrée réduite Conditions d’application : n1. π0 ≥ 5 et n1.(1- π0) ≥ 5 n2. π0 ≥ 5 et n2.(1- π0) ≥ 5 avec χ2 = (z)2 Х2 à 1 ddl est le carré d’une loi normale centrée réduite Cij ≥ 5

Comparer 2 pourcentages observés - Échantillons indépendants - Test z Confronter z à la valeur critique zα Test bilatéral : on rejette H0 si |z|≥ zα Test unilatéral : si H1 s’écrit π1 > π 2, on rejette H0 si z ≥ z2α si H1 s’écrit π 1 < π 2, on rejette H0 si z ≤ -z2α

Comparer 2 pourcentages observés - Échantillons indépendants - Test z : exemple 2 Données : Hypothèses : H0 : 1 = 2 ; H1 : 1 ≠ 2 Calcul Conditions d’application vérifiées : 50 x 0,35 ≥ 5 et 50 x 0,65 ≥ 5

Comparer 2 pourcentages observés - Échantillons indépendants - Test z : exemple 2 Lecture z = 1,05 < z0,05 = 1,96 : H0 acceptable (Même conclusion que le test précédent)

Comparer deux pourcentages Comparaison de deux pourcentages dans le cas des grands échantillons. Comparaison d’un pourcentage observé à un pourcentage théorique Comparaison de deux pourcentages observés Échantillons indépendants Échantillons appariés

Comparer 2 pourcentages observés - Séries appariées - Variable aléatoire qualitative dichotomique Cas des grands échantillons Individus de 2 échantillons liés Présence d’une caractéristique sur les mêmes sujets Présence d’une caractéristique chez des sujets appariés Problème : on s’intéresse aux taux de guérison chez des sujets ayant reçus un traitement T1 et des sujets appariés ayant reçus un traitement T2 : on cherche à comparer p1 et p2 les taux de guérison avec T1 et T2.

Comparer 2 pourcentages observés - Séries appariées - Formuler une hypothèse Hypothèse nulle H0 π1 = π 2 où π1 et π2 pourcentages inconnus des 2 populations d’où sont issus les échantillons Hypothèses alternatives H1 Test bilatéral : π1 ≠ π2 Test unilatéral : π1 < π2 ou π1 > π2

Comparer 2 pourcentages observés - Séries appariées - Tableau des valeurs Pour tenir compte de l’appariement, il faut faire apparaître quels sont les sujets qui appartiennent aux mêmes paires. Pour chaque paire d’individus, on peut observer, selon s’il y a présence (+) ou absence (-) du caractère étudié, l’une des 4 configurations possibles. Échantillon 1 Échantillon 2 Nombre de paires + a - b c d

Comparer 2 pourcentages observés - Séries appariées - Les paires concordantes n’apportent pas d’information sur la liaison entre le traitement et la guérison. On doit donc se fonder sur la répartition des paires discordantes. Si l’hypothèse H0 est vraie, il doit y avoir autant de paires discordantes du type +- que de type -+ Tester H0 revient donc à tester si le pourcentage observé de paires -+ est significativement différent de la valeur théorique 0,5.

Comparer 2 pourcentages observés - Séries appariées - Fixer le risque α Choisir la statistique Test du χ2 de McNemar (loi du X2) Test z (loi normale) Conditions d’application

Comparer 2 pourcentages observés - Séries appariées -  Test de McNemar (χ2) Calculer la valeur χ2 prise par la statistique Conditions d’application : La statistique suit une loi du X2 à 1 ddl

Comparer 2 pourcentages observés - Séries appariées -  Test de McNemar (χ2) : remarques Il est possible d’utiliser la correction de continuité, surtout lorsque les valeurs attendues sont faibles

Comparer 2 pourcentages observés - Séries appariées -  Test de McNemar (χ2) Confronter à la valeur critique Lecture de la valeur seuil dans la table Test bilatéral : on rejette H0 si Si : rejet de H0 Si : non rejet de H0

Comparer 2 pourcentages observés - Séries appariées -  Test z Calculer la valeur z prise par la statistique Z Z suit une loi normale centrée réduite Conditions d’application : b+c ≥ 10 χ2 = (z)2 Х2 à 1 ddl est le carré d’une loi normale centrée réduite

Comparer 2 pourcentages observés - Séries appariées - Test z Confronter z à la valeur critique zα Test bilatéral : on rejette H0 si |z|≥ zα Test unilatéral : si H1 s’écrit π1 > π2, on rejette H0 si z ≥ z2α si H1 s’écrit π1 < π2, on rejette H0 si z ≤ -z2α

Comparer 2 pourcentages observés - Séries appariées - Exemple 3 On désire comparer l’efficacité de deux traitements T1 et T2 chez 100 patients atteint d’une maladie M. Les deux traitements sont administrés aux patients. L’ordre d’administration des 2 traitements est tiré au sort en ménageant une période dite de wash-out entre les 2 administrations. Les résultats sont les suivants : Le taux de guérison est-il différent entre les deux traitements ?

Comparer 2 pourcentages observés - Séries appariées - Test de McNemar : exemple 3 On cherche à comparer les pourcentages observés : Hypothèses : H0 : π1 = π2 ; H1 : π1 ≠ π2 Conditions d’application vérifiées : nombre de paires discordantes = 16 + 6 = 22 ≥ 10

Comparer 2 pourcentages observés - Séries appariées - Test de McNemar : exemple 3 Lecture 3,84 : H0 rejetée On montre, au risque 5%, une différence significative entre les taux de guérison avec les 2 traitements (p<0,05).