Les champignons microscopiques et les infections qu'ils provoquent … Françoise Dromer, Mycologie Moléculaire, CNRS FRE2849 CNR Mycologie et Antifongiques, Institut Pasteur

Les champignons Organisme eucaryote Règne à part Développement par filaments ramifiés (thalle) parfois unicellulaire (levure) Aérobie stricte Reproduction asexuée ou sexuée Peu de champignons pathogènes chez les mammifères non immunodéprimés ≈ 100 000 espèces de champignons ≈ 150 pathogènes chez l'homme

Diversité des sources d'infection Source exogène : ENVIRONNEMENT Prévalence élevée de l'infection dans les zones endémiques (AC+++) Incidence faible de la maladie sauf immunodépression ou inoculum massif Transmission dans les piscines, saunas, salles de bain Source endogène : TUBE DIGESTIF, PEAU Incidence faible sauf rupture des barrières naturelles (KT, prothèses, chimiothérapie), déséquilibre de l’écologie microbienne (antibiotiques) Immunodépression Infections nosocomiales

Diversité des facteurs prédisposants aux infections fongiques systémiques Réanimation Chirurgie Neutropénie Cardiaque Rénale VIH Pulmonaire Hépatique Mycoses systémiques CGD Transplantation Corticoïdes Brûlures N-nés

Diversité des infections produites infections superficielles infections profondes Onychomycose Cryptococcose Aspergillose invasive "Pied d'athlète"

Diversité par le type de champignon responsable FILAMENTEUX Aspergillus Rhizopus Candida Cryptococcus neoformans LEVURES DIMORPHIQUES Histoplasma capsulatum

La malédiction des Pharaons

Les champignons responsables en partie de l'extinction des dinosaures ??? Ere tertiaire : Déforestation globale Prolifération des spores fongiques (fonction de dégradation) Aérosols massifs Survie des mammifères (sang chaud) Disparition des dinosaures (sang froid) ??? Arturo Casadevall: "fungal virulence, vertebrate endothermy, and dinosaur extinction: is there a connection?" in Fungal Genetics and Biology 2004

Quelques chiffres Septicémies à levures : Cryptococcose : 27 hôpitaux en Ile de France > 1400 épisodes en 3 ans 37% de décès à J30 Cryptococcose : 2-30% des patients SIDA (Afrique – Sud est asiatique) 100% décès sans traitement 20% avec traitement

Les champignons que l'on connaît … Les champignons utiles dans l’agro-alimentaire et en médecine Fromages : Penicillium camembertii – Geotrichum candidum –Saccharomyces cerevisiae Pénicilline – Penicillium notatum Cyclosporine – Trichoderma polysporum Les champignons néfastes par les toxines : aflatoxine ++ http://www.mycolog.com/fungi.htm

Pourquoi les mycoses sont-elles rares malgré la fréquence des spores fongiques dans l'environnement ? Température corporelle > température de croissance optimale de la plupart des champignons Ex : souris / lapin et C. neoformans Traits de virulence rarement combinés : capsule, mélanine, filamentation, thermotolérance : C. neoformans vs Cryptococcus sp. Pression de sélection par les prédateurs de l'environnement permet la survie chez l'hôte "animal" : Ex : champignons de l'environnement et amibes du sol Défenses immunitaires de l'homme probablement adaptées : Mais …

Les apprentis sorciers ? Apparition / “création” de nouveaux facteurs de risque : Infection par le VIH : CAOP, cryptococcose, histoplasmose, aspergillose Chirurgie lourde, transplantation d’organes Traitement antibiotiques : déséquilibre des écosystèmes digestifs Les voyages : mycoses d’importation en métropole Un constat, les hommes sont plus susceptibles aux infections fongiques : Hormones ? Mode de vie ? Susceptibilité génétique

Les apprentis sorciers ? Mycoses des muqueuses liées à l’utilisation d’antibiotique : Candidose du TD, muguet, vaginite Déséquilibre écosystèmes Emergence de nouveaux champignons pathogènes résistants à certains antifongiques => découverte de la résistance aux antifongiques : Pas d'échange génétique Rôle des biofilms Etude des mécanismes de résistance …

La mycologie n'est plus poussiéreuse La mycologie n'est plus poussiéreuse ! Les outils moléculaires sont disponibles Génomes de x champignons pathogènes séquencés Nombreuses découvertes importantes : Analyse des marqueurs de virulence, nouveaux modèles : drosophiles, nématodes, amibes Voies de biosynthèse => antifongiques nouveaux Identification des antigènes de surface = > tests diagnostiques Identification de nombreux mécanismes immunitaires Identification de protéines inconnues chez les eucaryotes supérieurs

Variabilité antigénique au cours de l'infection 5 min 24 hrs 48 hrs 6 hrs

L'enjeu principal : une amélioration du pronostic des mycoses invasives Des tests de diagnostic plus performants Des antifongiques plus efficaces La mise au point de vaccins, L'utilisation de thérapies immunomodulatrices ? => Un intérêt plus grand de la communauté scientifique, médicale et des pouvoirs publics