Présentations BIN1001
Parler à l’oral Montrer que le sujet est maîtrisé! Ton/Force de la voix Quelques petits conseils : Attention au vocabulaire employé Ne pas lire vos notes Regardez l’auditoire le plus possible
Organiser votre présentation Sections: Introduction au sujet (votre motivation, définitions de concepts, exemple introductif…) Annoncer le plan de votre présentation 2 ou 3 parties (exemple: aspects biologiques, aspects informatique, aspects bio-informatiques) Conclusion et ouverture générale
Organiser votre présentation Contenu Expliquer les notions difficiles Citer TOUTES vos sources Travailler en équipe Ne pas se répéter Liens logiques entre les idées et les parties
Support de présentation (PowerPoint) Texte: Attention à la quantité de texte Choix de taille du texte Choix de la police et des couleurs Diapositives: choix du fond (modèle) Figures: Taille des images / tableaux Légendes, axes, titres bien indiqués
Exercices sur les matrices de points, BLAST et FASTA TP4 Exercices sur les matrices de points, BLAST et FASTA
Dotplot Description : Un dotplot est un représentation graphique des régions de similitude entre deux séquences Les séquences sont placés sur les axes d’une matrice. Partout où il y a une similitude entre les séquences un point est placé dans la matrice.
Dotplot Dans les régions où les deux séquences ont beaucoup de similitude, des points s’alignent pour former les lignes diagonales. Régions locales de similitude = longues lignes diagonales Des répétitions = lignes diagonales parallèles Insertions ou suppressions = discontinuités dans les lignes diagonales
EMBOSS dottup: Dessine un dotplot à partir de mots exacts. dotpath: Dessine un dotplot à partir de mots exacts qui ne se chevauchent pas. dotmatcher: Dessine un dotplot à partir de mots avec un score supérieur à un certain seuil
Utilisation % dottup Displays a wordmatch dotplot of two sequences Input sequence: seq1 Second sequence: seq2 Word size [10]: 10 Graph type [x11]:
Devoir 2 Remise avant le 23 février 2007 à 17h00 remise bin1001 devoir2 votreFichier