« Atelier méthodologique » Réseau IGEC Interaction Génotype Environnement Conduite (GAP – EA – MIA) le 9 mars 2010 Organisé par Nadine Hilgert (MIA Montpellier) et la cellule d’animation IGEC) Arnaud GAUFFRETEAU Céline RICHARD-MOLLARD Pierre ROUMET Hervé MONOD

Les 3 axes de travail du réseau Axe « Bases de Données » Axe « Phénotypage et Caractérisation du Milieu » Axe « Statistiques, Modèles et Modélisation » Objectif d’animation technique et scientifique autour des IGEC.

Axe « statistiques, modèles et modélisation » Les méthodes nécessaires à la modélisation du fonctionnement de la plante en fonction du milieu La statistique, pour exploiter les données expérimentales et faire de l’inférence sur les modèles Enjeux importants Animation sur cet Axe : Hervé Monod, Nadine Hilgert (MIA) Besoin très fort exprimé par les membres du réseau …

2 types d’actions : Mise en œuvre et utilisation de méthodologies et d’outils existants Organisation de journées thématiques sur des besoins/attentes exprimées par les membres  autres actions? Développement de méthodologies innovantes Journées « production de connaissance » échange sur les projets et recherches en cours sur un thème précis  montage de projets? maintenir cette distinction?

Journée du 18/06/2009 Le changement d'échelle dans l'étude des IGEC ou comment intégrer des informations et des connaissances à des niveaux d'organisation différents – Utilisation d’approches écophysiologiques et de la modélisation biophysique de la plante pour la détermination de caractères phénotypiques complexes et l’analyse de l’interaction GxE [J. Lecoeur, UMR LEPSE] – Du phénotype au génotype : Interprétation des interactions avec l’environnement en termes d’adaptation [X.Lacaze, UMR DIAPC] – Combinaison de différentes sources d’information par Bayesian melding : Application à la modélisation du LAI [D. Makowski, UMR Agronomie]

Aujourd’hui: Modélisation statistique de courbes de croissance pour l'étude de l'interaction GxExC – Utilisation d’approches écophysiologiques et de la modélisation biophysique de la plante pour la détermination de caractères phénotypiques complexes et l’analyse de l’interaction GxE [Sabine Demottes - UMR SAGAH] – Analyse du développement des pousses feuillées en relation avec des facteurs génétiques et environnementaux : Doit-on se focaliser uniquement sur l'analyse de l'expansion des organes? [Yann Guédon - Virtual Plants, CIRAD] – Modélisation statistique de courbes de croissance, principes et mise en application [Nadine Hilgert - UMR MISTEA] REPAS – Modèle mixte non linéaire, application à la modélisation de processus dynamiques et prise en compte d'effets génotypiques et environnementaux [Hervé Monod - Unité MIA] – Modélisation des interactions entre morphogenèse et relations sources-puits chez le colza cultivé au champ au moyen du solveur GreenLab [Alexandra Jullien - UMR EGC] – Simulation de la dynamique du statut azoté d'une variété de blé tendre entre sortie hiver et floraison : application de la méthode de "filtre particulaire avec interaction" sur le modèle de prédiction Azodyn [Julie Berder - UMR Agronomie]

Objectifs des discussions Matin: – questions de fond sur les méthodes, leur mise en oeuvre – échanges sur les problèmes, les questions, Après-midi: – autres questions du même type – + attentes sur ce type de journées lieu thèmes: modélisation (méthodo, plateformes,...), stat modalités alternatives