Coordonnateur: Will Home

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1 Coordonnateur: Will Home
Les lipides BCM113 Coordonnateur: Will Home

2 Lipides Rôles entreposage d'énergie (TAG)
membranes (phospholipides + stérols) hormones (stéroïdes) vitamines (A, D, E et K) inflammation (prostaglandines) récognition cellulaire (glycolipides) signaux intracellulaires (phosphatidylinosotidols) Les lipides sont insolubles dans l’eau Solvants organiques: acétone, alcool, chloroforme et éther éthylique

3 Séance 6 - Buts Analyser les lipides retrouvés dans le jaune d’œuf et dans les épinards. Familiarisation avec: techniques d’extraction des lipides techniques d’identification des lipides techniques de séparation des lipides Objectifs de la séance sur les lipides : - Extraire des lipides d’un jaune d’œuf. - Déterminer la quantité de lipides dans le jaune d’œuf. - Analyser les extraits lipidiques d’un jaune d’œuf et des feuilles d’épinard sur chromatographie sur couche mince. - Observer les résultats des révélateurs différents sur CCM. - Essayer d’identifier les lipides dans les extraits en comparant leur migration avec celle des standards. - Comparer vos résultats avec la littérature scientifique.

4 Séance 6 - manipulations
Lipides Exercice 1: Extraction (jaune d’œuf) Exercice 2: Quantification Exercice 3: Séparation par CCM (labo sec) Compte rendu Objectifs de la séance sur les lipides : - Extraire des lipides d’un jaune d’œuf. - Déterminer la quantité de lipides dans le jaune d’œuf. - Analyser les extraits lipidiques d’un jaune d’œuf et des feuilles d’épinard sur chromatographie sur couche mince. - Observer les résultats des révélateurs différents sur CCM. - Essayer d’identifier les lipides dans les extraits en comparant leur migration avec celle des standards. - Comparer vos résultats avec la littérature scientifique.

5 Lipides Séparation et analyse hydrophobes
certains ont aussi une partie hydrophile extraction requit l'utilisation des solvants organiques (souvent CHCl3:MeOH:H20) purification/analyse par chromatographie Les lipides sont insolubles dans l’eau Solvants organiques: acétone, alcool, chloroforme et éther éthylique Exemples dans les notes de cours ou livres/cours de biochimie et liens sur le site web

6 Lipides Classification Triglycérides Phospholipides Stéroïdes
Entreposage d’énergie Isolation Membranes cellulaires Membranes cellulaire Messagers chimiques Grande variation structurale, donc une importance très variée dans les organismes Lipides simples: Acides gras: Triglycérides: Lipides composés: Phospholipides: ressemblent aux triglycérides mais contiennent de l’acide phosphorique estérifié avec un alcool Sphingolipides: sphingomyéline  sphingosine remplace glycérol, système nerveux des animaux Glycolipides: système nerveux des animaux Lipoprotéines: transport des produits non-polaires ex.: lipides Dérivés lipidiques: Stéroïdes: chlestérol  précurseur de plusieurs autres stéroïdes; sels biliaires (acide cholique et deoxycholique), testostérone et progestérone Vitamines solubles dans les lipides: A, D, E et K, inclus dans les lipides en raison de leurs propriétés de solubilité

7 Lipides Phospholipides Sérine  phosphatidylsérine
Choline  phosphatidylcholine (lécithine) Groupement peut varier donnant les classes de phospholipides Sont formés d’un glycérol lié à deux acides gras (variables) et à un groupement phosphate ± un autre groupe attaché

8 Lipides Intérêt médical: Maladies Liposomes
Maladies : cholestérol élevé Liposomes : Applications médicales dans la livraison des médicaments (1- attrapper les médicaments, 2- relâcher dans le système) Les liposomes véhiculent des vitamines Maladies Liposomes

9 Exercice 1 Extraction des lipides du jaune d’œuf Vortex
Méthode de Bligh et Dyer Couper une pipette de transfert de plastique pour prélever le jaune d’oeuf Bécher 50 ml à chaque balance, Tarer le tube Falcon 15 ml. Laisser le bécher sur la balance après. Chloroforme déjà 2:1, pipetter sous la hotte 3 rôles du chloroforme: extraire les lipides dénaturer les protéines permet la formation des 2 couches Récupération de la phase chloroforme: utiliser une pipette pasteur en verre + poire longer la parois du tube et traverser l’interphase 99% du MeOH est dans la phase aqueuse

10 Exercice 1 Extraction des lipides du jaune d’œuf Vortex
Méthode de Bligh et Dyer Couper une pipette de transfert de plastique pour prélever le jaune d’oeuf Bécher 50 ml à chaque balance, Tarer le tube Falcon 15 ml. Laisser le bécher sur la balance après. Chloroforme déjà 2:1, pipetter sous la hotte 3 rôles du chloroforme: extraire les lipides dénaturer les protéines permet la formation des 2 couches Récupération de la phase chloroforme: utiliser une pipette pasteur en verre + poire longer la parois du tube et traverser l’interphase 99% du MeOH est dans la phase aqueuse

11 Interphase=protéines Lipides dans chloroforme
Exercice 1 Extraction des lipides du jaune d’œuf ampoule à décanter Interphase=protéines Phase aqueuse Lipides dans chloroforme Méthode de Bligh et Dyer Couper une pipette de transfert de plastique pour prélever le jaune d’oeuf Bécher 50 ml à chaque balance, Tarer le tube Falcon 15 ml. Laisser le bécher sur la balance après. Chloroforme déjà 2:1, pipetter sous la hotte 3 rôles du chloroforme: extraire les lipides dénaturer les protéines permet la formation des 2 couches Récupération de la phase chloroforme: utiliser une pipette pasteur en verre + poire longer la parois du tube et traverser l’interphase 99% du MeOH est dans la phase aqueuse

12 Exercice 1 Extraction des lipides du jaune d’œuf Prélever >1ml
Méthode de Bligh et Dyer Couper une pipette de transfert de plastique pour prélever le jaune d’oeuf Bécher 50 ml à chaque balance, Tarer le tube Falcon 15 ml. Laisser le bécher sur la balance après. Chloroforme déjà 2:1, pipetter sous la hotte 3 rôles du chloroforme: extraire les lipides dénaturer les protéines permet la formation des 2 couches Récupération de la phase chloroforme: utiliser une pipette pasteur en verre + poire longer la parois du tube et traverser l’interphase 99% du MeOH est dans la phase aqueuse

13 Exercice 1 Extraction des lipides du jaune d’œuf extrait lipidique
Méthode de Bligh et Dyer Couper une pipette de transfert de plastique pour prélever le jaune d’oeuf Bécher 50 ml à chaque balance, Tarer le tube Falcon 15 ml. Laisser le bécher sur la balance après. Chloroforme déjà 2:1, pipetter sous la hotte 3 rôles du chloroforme: extraire les lipides dénaturer les protéines permet la formation des 2 couches Récupération de la phase chloroforme: utiliser une pipette pasteur en verre + poire longer la parois du tube et traverser l’interphase 99% du MeOH est dans la phase aqueuse extrait lipidique

14 Exercice 2 Estimation de la quantité de lipides dans le jaune d’œuf
Pipette  remplir - vider – remplir (avec mélange chloroforme/lipide)

15 Exercice 2 Estimation de la quantité de lipides dans le jaune d’œuf
Poids cupule vide # d’équipe 1 ml de lipides dans CHCl3 Hotte (1 heure) Évaporation du CHCl3 Pipette  remplir - vider – remplir (avec mélange chloroforme/lipide) Poids cupule + lipides Calcul % lipides

16 Exercice 3: Chromatographie (CCM)
Vitesse de migration d’une substance Force d’entrainement du solvant Force de rétention (gel de silice) Voir les notes de cours et site web (animation) Choix du matériel: plaque (silice), cuve, support Choix du solvant: solvant mélange de polarités Interactions: intramoléculaires moments dipolaires liens hydrogènes liens ioniques liens covalents etc.

17 Exercice 3 (labo sec) séparation des phospholipides sur CCM
analyse des lipides dans le jaune d’œuf et dans le épinard laboratoire sec, mais vous êtes responsable pour comprendre les manipulations Préparer un modèle sur papier avant le laboratoire. Une plaque/2 équipes – étiqueter # d’équipe + révélateur Déposer les échantillons : volume, espacement Ne pas tenir les eppendorfs dans les mains et fermer les bouchons – évaporation du CHCl3 Déposer 5 ul à la fois, laisser sécher avant d’en mettre plus (déposer 20 ul total)

18 (mettre sous la plaque)
Exercice 3 (labo sec) CCM Modèle sur papier (mettre sous la plaque) 1,5 cm X X X X X X X X X X X X X X X 20 cm ligne d’application de l’échantillon Préparer un modèle sur papier avant le laboratoire. Une plaque/2 équipes – étiqueter # d’équipe + révélateur Déposer les échantillons : volume, espacement Ne pas tenir les eppendorfs dans les mains et fermer les bouchons – évaporation du CHCl3 Déposer 5 ul à la fois, laisser sécher avant d’en mettre plus (déposer 20 ul total)

19 Exercice 3 front de migration
# Équipe, Révélateur front de migration Chromatographie : saturation, temps Solvant ratio 30 :34 :8 :35 = 30 ml chloroforme + 34 ml éthanol+ 8 ml eau+ 35 ml triéthylamine Dans chaque chambre à chromato sous la hotte Solvant: Chloroforme : H2O : Éthanol : Triéthylamine ( : : : )

20 Exercice 3: Résultats des CCM
3 révélateurs: bleu de molybdène, ninhydrine, rhodamine Bleu de molybdène (zinzade) phosphore taches bleues Ninhydrine amines + acides aminés taches violacées Rhodamine tous les lipides taches fluorescentes(UV)

21 Exercice 3 Rf = Distance de migration de la Tache (milieu)
Distance de migration du Solvant A B C D E F G S Après migration et coloration Calcul rapport de front (Rf) et analyses T

22 Exercices 1-3 Sécurité conserver les solutions fermées + sur glace
Chloroforme Matière toxique ayant des effets toxiques immédiats graves Soupçonné d’être cancérigène

23 Exercices 1-3 Sécurité Conserver les solutions fermées + sur glace
Chloroforme Matière toxique ayant des effets toxiques immédiats graves Soupçonné d’être cancérigène

24 Exercices 1-3 Sécurité -pipette de transfert en verre = verre brisé
-composte pour dechets organique (ne pas mettre dans les poubelles de table)

25 Exercices 1-3 Sécurité Centrifuge
-pipette de transfert en verre = verre brisé -composte pour dechets organique (ne pas mettre dans les poubelles de table) Centrifuge -balancer vos tubes (=tube de poids égal en face)

26 Exercices 1-3 Centrifuge - si le rotor n’est pas balancé…
La soucoupe volante vue hier était en fait un rotor débalancé.

27 Exercices 1-3 Centrifuge - 3 modèles peu importe le modèle, 3750 rpm

28 Permettant d’observer le lipide std
Compte rendu Question 5: Lipide Standard Révélateur(s) Permettant d’observer le lipide std (B, N, R**) Jaune d’œuf observé (+,++,+++) Info litt. en % Épinard Info litt. en % PC Rf =____ Utilisez la plaque révélée avec la rhodamine

29 Compte rendu - Q5 et Q7 % relative +++ + ++ jaune d'oeuf

30 Permettant d’observer le lipide std
Compte rendu Question 5: Lipide Standard Révélateur(s) Permettant d’observer le lipide std (B, N, R**) Jaune d’œuf observé (+,++,+++) Info litt. en % Épinard Info litt. en % PC Rf =____ Utilisez la plaque révélée avec la rhodamine

31 Compte rendu Question 7: Révélateur(s) (B, N, R**) Jaune d’œuf Épinard
Permettant d’observer les taches (B, N, R**) Jaune d’œuf présence /absence (-,+,++,+++) Épinard Commentaires, explications, identification possibles, etc. Tache #__ Rf =_____

32 Compte rendu portez attention de clairement identifier les taches en question sur les CCMs (pistes d'oeuf et d'épinard) Question 5 (PC, PE, PI, PS et TAG) Question 7 (avec # du tableau de Q7)

33 Compte rendu pour le calcul du % de lipides dans le jaune d'oeuf, n'oubliez pas d'indiquer d'où viennent les valeurs utilises dans le calcul

34 Titres des figures devrait indiquer ce que vous voulez déterminer (= raison d'être de la figure) Ex. Souvent, on voit: « Chromatographie sur couche mince de différents lipides révélés au bleu de molybdène. » il serait mieux d'écrire: « Détermination des phospholipides présents dans le jaune d'oeuf et dans les épinards. »

35 Légendes des figures c'est ici que vous indiquer qu'est-ce que le lecteur regarde sous forme de texte continu Ex. « Chromatographie sur couche mince de silice d'extraits lipidiques de jaune d'oeuf et d'épinards révélés au bleu de molybdène. » par la suite, il faut indiquer le solvent ainsi que les QUANTITÉS déposées dans chaque piste (et non les ul)

36 Questions? Les lipides BCM113

37 BCM113 Avant 9h lundi le 25 février, remettre: Examen final
comptes rendus corrigés Avant 9h lundi le 25 février, remettre: le compte rendu de la séance 6 les comptes rendus corrigés seront remis sur l’étagère de bois mercredi le 27 en journée Examen final jeudi le 28 février 9h00 à 12h00 local: D (Aduriz à Kaprolat) D (L’Espérance à Whitter)

38 Examen écrit aucune documentation permise aucune cellulaire permise
apporter une calculatrice de base

39 Examen écrit Style des questions: choix multiples
vrai/faux (± explications) réponses courtes (remplir les espaces) développement / analyse / interprétation de résultats autres … (ex. tracer un graphique, calculs)

40 Consulter le site Moodle du cours pour toutes les informations
Examen écrit Contenu des questions: calculs préparation de solutions élaboration de protocoles: connaissance et compréhension des étapes, incluant l’utilisation des instruments. connaissance des réactifs et leurs rôles analyse/interprétation des résultats identification de sources d’erreurs, comment les éliminer et améliorer un protocole Calculs: surtout comme ceux retrouvés dans les comptes-rendus. Élaboration de protocoles: sans les détails précis comme les concentrations et les volumes Consulter le site Moodle du cours pour toutes les informations