Arbre du vivant : 3 Hypothèses

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1 Arbre du vivant : 3 Hypothèses

2 Réverse gyrase des hyperthermophiles
crénoarchaebacterie euryarchaebacterie eubactérie

3 LUCA génome ADN

4 LUCA génome ARN

5 De LUCA à aujourd’hui Gène A Évolution des nouvelles copies
Seconde duplication Évolution des nouvelles copies Gène A Différenciation de la copie Duplication du gène A

6 Ressemblance A C B x x’ Homologie A C B x x’ x’ x’ A C B x’ x x x x
Réversion x Convergence

7 Similitude et Homologie
A C B x x’ réversion A C B x x’ homologie A C B x x’ convergence x’ A B x parallélisme C D

8 Gènes orthologues ou paralogues
1b 2b 3b 1a 2a 3a Avec des gènes orthologues Duplication de gène Arbres de taxons obtenus Avec des gènes paralogues 1a 2b 3a Arbre réel, les gènes a sont orthologues entre eux, les b aussi, mais les a et les b sont paralogues.

9 Réseau Et Arbre T0 T1 T2 T3 T4 N5 N6 N7 N8 Arbre T0 T1 T2 T3 T4 N5 N6

10 Mono, para, polyphylie A C B D E F G C B D B,C et D forment un
groupe monophylétique Ex:mammifères C B D C et D forment un groupe paraphylétique Ex: poissons D et G forment un groupe Polyphylétique Ex:pinnipèdes

11 Qui sont des poissons? Myxines Lamproies Poissons cartilagineux
Poissons osseux Tétrapodes Poissons cartilagineux Poissons osseux Tétrapodes

12 Pinnipèdes Belette Phoque Pinnipèdes Carnivores Otarie Ours Souris
Arbre obtenu avec une séquence protéique partielle de l’a-globine

13 Homologie, paralogie

14 Place des apétales au sein des Angiospermes
Date Interprétation Interprétation des apétales Auteur(s) Le strobile des apétales rappelle celui des gnétales. Ils sont tous deux à sexes séparés primitives Engler et Prantl À partir de 1915 Les Ranales considérées comme ancestrales ont un strobile bisexué évoluées Bessey

15 Éponges 1 Euastrophorida Astrophorida Streptosclerophorida
Tetractinomorpha Spirophorida Sous classe Ordre Sous ordre Famille Pachastrissa Tetractinom. Astrophorida Euastrophor. Calthropellidae Erylus Geodiidae Pachymatisma Penares Ancorinidae Stryphnus Discodermia Streptosclerop Theonellidae Corallistes Corallistidae Poecillastra Pachastrellidae Cynachyrella Spinophorida Tetillidae

16 Éponges 2 Pachastrissa Euastr. Erylus Euastr. Penares Euastr.
Pachymatisma Euastr. Stryphnus Euastr Discodermia Strepto. Corallistes Strepto. Poecillastra Strepto. Cinachyrella Spino.. Strepto

17 Alignement et phylogénie 1
2 3 4 5 6 1 T  A 3 C G 8 2 5 4 6 * 1 A T G A A G G T 1 T  A 3 C G 8 2 5 4 6 * 7 1 T  A 3 C G 8 2 5 4 6 * 2 A T G A A G G T 1 2 3 4 5 6 3 T T A G A A G G A * * G * * A G * * A A G 4 T T C * * A G G * * 1 2 3 4 5 6 5 T C C A G G G C 6 T C C C G G G C Le 3e arbre présenté ici est le consensus des 2 autres .

18 Alignement et phylogénie
Arbres calculés par une méthode de maximum de parcimonie, en utilisant 3 alignements différents pour les séquences des mêmes 6 taxons Alignement Nb d’arbres Lg Lg min Lg Max CI RI 1 12 19 2 3 18

19 Comparaison du monomère P3 de PRD1 (gauche) et du monomère d’hexaèdre de l’Adénovirus (droite).
The two jelly rolls in each subunit are indicated with green and blue, and labeled as V1 and V2 for the PRD1 protein and as P1 and P2 for the Adenovirus protein.

20 Répartition des virus apparentés dans l’arbre universel du vivant.