DZ-LEGUMES : un système d’identification interactive des légumineuses d’Algérie Djouadi Samir, Lebbida F, Noureddine N-E et Amrani S Université des Sciences.

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1 DZ-LEGUMES : un système d’identification interactive des légumineuses d’Algérie Djouadi Samir, Lebbida F, Noureddine N-E et Amrani S Université des Sciences et de la Technologie Houari Boumediène Faculté des Sciences Biologiques Laboratoire de Biologie et de Physiologie des Organismes Equipe Biologie du Sol

2 Introduction Depuis les flores de Quezel et Santa (1962) et d'Ozenda (1995) de nombreux changements de nomenclature et de systématique ainsi que la description de nouveaux taxons ont affecté la flore d'Algérie sans que ces changements n'amènent à l'édition d'une nouvelle flore La situation est telle qu'il est aujourd'hui difficile de se contenter de flores écrites, de surcroît anciennes et incomplètes pour mener à bien un travail d'identification de plantes comme nous en avons eu l'expérience pour le groupe des légumineuses d’Algérie C’est ce qui nous as amené à nous intéresser à l’utilisation des outils moderne de gestion d’information et d’identification taxonomique pour la détermination des légumineuses qui est une tâche difficile avec les flores traditionnelles qui sont à notre avis insuffisantes.

3 Pourquoi les méthodes traditionnelles se sont-elles montrées insuffisantes ?

4 1-Statique : impossible à toucher sans transformer toute la clé Clés écrites : 2-Impose un ordre procédural 3-Propose des caractères pas toujours disponibles : structures endommagées, état phénologique, etc. 4-Propose parfois des caractères difficilement interprétable pour un néophyte 5- Les clés de détermination et les flores sont difficiles à mettre a jour

5 Bases de données (type relationnelles) : 1-Manipulent difficilement des données taxinomiques : données floues, incertaines, hiérarchiques 2-Imposent des contraintes de champs 3-Ne permettent pas d ’interroger des images 4-Apportent peu d ’aide à la décision Bien que les flores classiques aient profité de l’évolution de l’informatique avec leur passage en bases de données relationnelles, les systèmes proposés jusque là souffrent des problèmes suivants

6 Les outils d’identification assistée par ordinateur du fait de leur souplesse et leur utilisation facile constituent une solution prometteuse à la gestion des flores, à l’évaluation de la biodiversité et à la déterminations rapides et fiables des taxons

7 Des systèmes plus puissants dits d ’identification assistée par ordinateur (Delta, LucID, Meka, etc.) Intérêts : 1-S ’appuient largement sur le multimédia : images, sons, vidéo 2-Manipulent directement des valeurs numériques 3-Calculent les meilleures voies d ’identification : les plus rapides et les plus fiables

8 Des systèmes plus puissants dits d ’identification assistée par ordinateur (Delta, LucID, Meka, etc.) Intérêts : 4-Permettent de calculer la probabilité de certitude d ’une identification 5-Entrée libre et multiple : potentiellement autant d ’entrées que de caractères 6-Clé évolutive : de nouvelles données contribueront à l ’enrichissement et à la performance de la clé

9 Dans le cadre d'une étude globale portant sur la connaissance des symbioses à Rhizobia chez les légumineuses d'Algérie nous avons été amenés à adapter et à utiliser, au niveau de notre laboratoire, un système de gestion d'informations taxonomiques, le système DELTA (Description Language for TAxonomy)

10 L ’intérêt de DELTA (Description Language for Taxonomy) 1-Repose sur un langage : avec sa propre syntaxe et sémantique 2-Sa structure flexible : il s’adapte aux données et non l ’inverse 3-Rend compte des caractères de type ‘ variable ’, ‘ inconnu ’ et ‘ inapplicable ’ 4-Code pour des valeurs binaires, multistates (ordonnées ou non, chevauchantes) et textuelles

11 L ’intérêt de DELTA (Description Language for Taxonomy) 5-Encodage est en free format : simplicité de l ’enregistrement des données 6-Engendre des descriptions et des clés en langage naturel 7-Classe les caractères par ordre de mérite à tout moment de l ’identification 8 -Détermination interactive des taxons 9-Logiciel libre de tous droits

12 Un exemple d ’identification interactive et de recherche documentaire

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14 Conclusion Le langage DELTA (Description Language for Taxonomy) que nous avons décrit dans le cadre restreint des légumineuses d'Algérie et son apport à nos activités de recherche est largement utilisé dans le monde aussi bien pour la classification des bois commerciaux, des poteries, des virus, des insectes et des végétaux.. La flore officielle de Chine dont la version papier souffre énormément du rythme rapide de nouvelles découvertes d'espèces est aujourd'hui éditée, sur support optique et sur internet, au format DELTA.

15 L’aspect évolutif du système permet facilement son enrichissement et sa mise à jour (par de nouvelles informations concernant la nodulation, la biologie moléculaire, la synonymie, l’écologie, etc.). A terme, il devrait constituer l’inventaire exhaustif de toutes les espèces de légumineuses d’Algérie et l'adoption d'un tel système via les réseaux universitaires et/ou ministériels (MESRS, MATE, MARA) permettrait de disposer d'une plate forme récipiendaire qui permettrait de thésauriser toutes les observations ayant trait à la biodiversité et d'en faire profiter toute la communauté scientifique. Conclusion