Outils chimiques pour létude des biomolécules 2 ème partie : Outils chimiques théorique : Modélisation Moléculaire 2) La modélisation moléculaire : application.

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1 Outils chimiques pour létude des biomolécules 2 ème partie : Outils chimiques théorique : Modélisation Moléculaire 2) La modélisation moléculaire : application à l'étude de la réactivité chimique

2 Exemple d'une application à l'étude de la réactivité chimique : Explication de l'orientation d'une réaction de cyclisation…

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6 Mécanisme réactionnel : - Milieu fortement acide (PPA), protonation du C=O par H + et formation d'un carbocation, - Formation d'un complexe de type (étape déterminante), - Réarrangement en complexe de type (perte de conjugaison), élimination d'une molécule d'eau et libération d'un proton (le PPA ne joue donc le rôle que d'un catalyseur).

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8 Modélisation : Il faut donc expliquer la faisabilité du complexe par la mécanique quantique avec étude de la HOMO, l'orbitale moléculaire qui doit fournir l'électron destiné à former la liaison attendue…

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10 HOMO HOMO 1

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13 C'était donc un exemple parmi d'autre de l'utilisation de la modélisation moléculaire pour l'explication de la réactivité chimique…