Bilan d’activités PHYTOCOT 2012

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1 Bilan d’activités PHYTOCOT 2012
Natacha Guiselin (CDD-IR)

2 Base de données Base de données postgreSQL (D. Dessailly )
Conversion carbone Base de données postgreSQL (D. Dessailly )

3 Exploitation et valorisation données de cytométrie en flux
Base de données BdD Cyto2 postgreSQL (D. Dessailly et X. Mériaux ) BdD terrain2 Exploitation et valorisation données de cytométrie en flux

4 Alternative cytométrie en flux
Base de données Matchups Seawifs 200 analyses pigmentaires 5000 analyses taxons (CPR) Alternative cytométrie en flux

5 Cytomètre « classique »
Apports de la cytométrie en flux (CytoSense) Ex: Beckman Coulter Epics XL Flow Cytometer Cytomètre Cytosense Cytomètre « classique » Analyse automatisable in situ Analyse en laboratoire Jusqu’à 5 mL < 1 mL De 1 à > 1000 µm µm Profils optiques (pulse-shape cytometry) Intégration de pics

6 Informations supplémentaires sur les IOPs
Apports de la cytométrie en flux (CytoSense) Température Salinité Informations supplémentaires sur les IOPs Variabilité liée à la composition phytoplanctonique, à la physiologie en relation avec les conditions environnementales

7 Relation biovolume-FWS
Apports de la cytométrie en flux (CytoSense)  Estimation biomasse Fluorescence rouge = proxy chla (coll. M. Thyssen) Diffusion avant (FWS) = proxy biovolume Relation biovolume-FWS Cultures phytoplanctoniques

8 Aide à la labellisation pour la méthode PHYSAT (coll. Thyssen)
Apports de la cytométrie en flux (CytoSense) Aide à la labellisation pour la méthode PHYSAT (coll. Thyssen) Expertise et connaissances sur les populations phytoplanctoniques locales par cytométrie

9 Exercice de calibration Détection et fonction de poids
Etudes optiques et expériences Conversion des mesures de diffusion par cytométrie (FWS et SWS) (coll. L. Duforêt) Exercices de calibration et simulations théoriques (théorie de Mie, T-matrix...) Θ DETECTOR PARTICLE ΔΩ Exercice de calibration Billes d'indice de réfraction et taille connus Détection et fonction de poids Particularités instrumentales

10 Activité de cultures et dispositif expérimental (microcosme)
Etudes optiques et expériences Activité de cultures et dispositif expérimental (microcosme) Aspects pratiques, mesures en laboratoire, acquisition de données

11 Guiselin Natacha, Duforêt-Gaurier Lucile and Alvain Séverine
Guiselin Natacha, Duforêt-Gaurier Lucile and Alvain Séverine. CytoSense potential use in a remote sensing context. Poster Ocean Optics XXI, Glasgow, October 2012