Plate-forme bioinformatique de OUEST-genopole® Amnesix : Serveur de sauvegardes Stockage réseau Sun StorEdge(4 To) Matrix Cluster Alambix : Sun Fire 12000.

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1 Plate-forme bioinformatique de OUEST-genopole® Amnesix : Serveur de sauvegardes Stockage réseau Sun StorEdge(4 To) Matrix Cluster Alambix : Sun Fire 12000 partagé Idefix : Sun Fire 6800 www.genouest.org

2 8 nœuds 1U, bi Xeon 2.4 Ghz, 2 Go Ram, 2* 36 Go disques 1 serveur 2U, même caractéristiques + RAID 1 To Réseau Gb ethernet, routeur Cisco (gestion univ-rennes1) Logiciel d’administration : Alinka Raisins. MAIS PBS non fonctionnel et plantages applicatifs Bibliothèques : mpich, lam, bioperl, biopython,… Logiciels : Ilog Cplex, Biobase Transfac pro, emboss, qtlcart, R (stats), Reputer Banques de données publiques (mise à jour quotidienne) : genbank, swiss-prot, genome humain, collection de génomes (riz, algues, …) Le Cluster (carri systems)

3 Equipe Symbiose + labos de OUEST-genopole ACI IMPBio, ACI Masse de données Gestion : CRI univ-rennes1.fr pour les Suns (système) logiciels (install + suivi) H.L., cluster Linux : H.L. Outils spécifiques en développement par 3 CDD (plus conseils en bases de données spécialisées : huitre, chou-fleur, xénope, algues) fin 2004 : nouvelle machine de production (cctp en cours de rédaction) Fort soutien de la région Bretagne : cper 2000-2006: 228 K € + PRIR 2 tranches de 60 K € 2004 : 260 K€ (100%) PRIR 2 tranches de 70 K€ (125 K € à justifier) CNRG 2002 : 191 K € + attente financement 2003 : 170 K€ (100%) La plate-forme GenOuest