Gérer ses références bibliographiques avec Zotero

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Gérer ses références bibliographiques avec Zotero Christine Silvy (INRA, Montpellier) Christiane Roure (SupAgro) Formation organisée par le réseau CNRS Doccitanist le 8/11/2011 à Montpellier 26/10/11

Les logiciels libres de bibliographie Logiciel de gestion bibliographique (liste de logiciels libres) http://fr.wikipedia.org/wiki/Logiciel_de_gestion_bibliographique [Bibus (www.bibus.fr), Zotero, CiteULike (www.citeulike.org), Connotea (www.connotea.org), Mendeley (www.mendeley.com), Wikindx (wikindx.sourceforge.net), Wizfolio (www.wizfolio.com) …] Les logiciels libres de gestion bibliographique http://www.projet-plume.org/fr/ressource/zoom-sur-la-gestion-de-references- bibliographiques-dans-plume Site de la journée du 20 mars 2009 « Gérez vos références bibliographiques avec des logiciels libres » http://www.projet-plume.org/fr/ressource/journee-plume-biblio-2009 C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 2

Zotero version 2.1.10 (sept. 2011) Support adapté à la version 2 de Zotero qui apporte des nouveautés (/version 1) Synchronisation Groupes Partage de références Notes formatées Détection automatique des métadonnées PDF etc. C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 3

Zotero Présentation générale Créé fin 2006 Projet du Center for history and New Media (University georges Mason, Virginia USA) http://chnm.gmu.edu/ Fonds de plusieurs institutions et fondations Unitive States Institute of Museum and Library Services (IMLS) http://www.imls.gov/ Andrew W. Mellon Foundation http://www.mellon.org Ethymologie : vient du verbe albanais zöteroj =« master, acquire » « apprendre » C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 4

Zotero Logiciel libre de bibliographie Extension du navigateur Firefox (> version 2) Extension de firefox, mais données stockées indépendamment Multi-plateformes (Linux, Mac, Windows) Captures de pages web Orientation hypermédia (vidéos, images, pages html, billets de blogs) Possibilité d’annoter les références Multilingue dès le départ (dont le français) Utilisation individuelle et/ou collective Avec la v2, synchronisation, collaboration, partage de données etc. Fort dynamisme de développement Version 3 Beta (Firefox et Standalone) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 5

Zotero Logiciel libre de bibliographie à télécharger à partir du site de Zotero http://www.zotero.org Guide de démarrage rapide en français Support (aide, documentation : nombreuses rubriques en français) Forums (par thèmes) Blog francophone (http://zotero.hypotheses.org) Groups People (communauté Zotero) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 6

Gérer sa bibliographie Zotero Installation Gérer sa bibliographie Partager ses données C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 7

Zotero Installation Installer firefox (< v. 4 si on ne veut pas la version Standalone) Aller sur le site de Zotero http://www.zotero.org Télécharger la version 2.1.10 (au 04/09/11) Si firefox bloque l’installation, cliquer sur Autoriser Redémarrer Firefox Une fois le logiciel téléchargé, l’icône Zotero apparaît en bas à droite de l’écran du navigateur internet Firefox Emplacement de Zotero: C:\Documents and Settings\Nom\Application Data\Mozilla\Firefox\Profiles Toutes les données sont stockées dans un répertoire en local (on peut changer cet emplacement, voir diapo 25 Préférences) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 8

Clic sur le logo Zotero Fenêtre partagée avec Firefox Page du navigateur Firefox Logiciel Zotero C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 9

Terminologie de Zotero Ma bibliothèque : ensemble des références de toutes les collections ou isolées Collections : dossiers thématiques contenant les références Marqueurs : mots-clés Créateur : auteur (sauf pour la saisie = auteur) Très important : la logique Bibliothèque/Collections (très différent de Endnote) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 10

La liste des références Interface Zotero Les collections La liste des références Une référence Les marqueurs ou mots clés C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 11

Interface : colonne de gauche voir aussi « Organiser sa bibliothèque et ses collections » (Diapo 38) Contient par défaut « Ma bibliothèque » (toutes les réfs des collections + les réfs qui ne sont pas classées dans une collection particulière) Collections : dossiers créés par l'utilisateur; on peut créer des sous-collections Pour savoir combien de réfs dans une collection : se positionner dans la colonne du milieu, faire ctrl-a, le nombre de réfs s'affiche dans la colonne de droite C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 12

Interface : colonne du milieu Affiche les références contenues dans la collection en cours d’utilisation Pour afficher + de champs : cliquer sur icône « grille » (à droite du +) Pour changer ordre d'affichage des champs : cliquer/glisser l'intitulé du champ Tri alphabétique en cliquant sur chaque intitulé de champ Le « + » à droite du nom des champs = tri multiple C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 13

Interface : colonne de droite Onglet Info : détail de la notice sélectionnée dans la colonne du milieu Onglet Notes : note de lecture, annotation éventuelles (sera ajoutée comme élément fils de la notice ; ex. ajouter « très intéressant » comme note à un article) (voir détails plus loin) Onglet Marqueurs : voir plus loin Onglet Connexe : pour lier des réfs entre elles (ex un article et sa traduction) : clic et choisir la réf (un signe s'ajoute à côté de la réf) Le Bouton Afficher (petite flèche au-dessus de l’onglet info) est actif quand la réf. est un site web. Un clic sur ce bouton fait apparaître la page du site dans le navigateur. Le Bouton Localiser, au-dessus de l’onglet Info : lien vers CrossRef et vers les moteurs ; dans les préférences de Zotero, le résolveur de lien est paramétré par défaut vers WorldCat, pour localiser le document (on peut modifier ce paramétrage vers un autre catalogue par le menu actions-> préférences, par exemple vers le SFX de l’INRA) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 14

Collecte des références Le menu et les icônes de Zotero (détail de chaque fonction diapos suivantes) Collections et Groupes Paramètres Affichage page web Collecte des références Icônes recherche Syncro/serveur Créer nouvelle collection C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 15

Le menu et les icônes de Zotero (détail de chaque fonction) Ajouter nouvel élément Ajouter un élément par son identifiant Recherche simple Nouvelle note Roue dentelée Actions (détails plus loin) Synchronisation avec serveur Zotero Recherche avancée Fermer Zotero Affichage page web Bascule Mode plein écran Créer nouvelle collection Créer un nvel élt à partir de la page courante Joindre/attacher (voir plus loin) Nouveau groupe Créer nouvelle collection C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 16

Le menu et les icônes de Zotero : Bouton actions (roue dentelée) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 17

Créer une chronologie Bouton actions (suite) = outil d’exploration des données Une chronologie peut être basée sur la bibliothèque, ou sur une collection ou sur une sélection manuelle de références Sélectionner puis cliquer sur le bouton actions et sur créer une chronologie Zotero affiche 3 bandes (par mois, par année, par décennie) basées sur la date de publication des références Le critère date est changeable en date d’ajout de la notice ou date de modification de la notice (cela permet un suivi détaillé de l’évolution de sa bibliographie) Pour se déplacer horizontalement, cliquer à un endroit dans une des 3 bandes,rester appuyé et bouger la souris C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 18

Exemple de chronologie C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 19

Préférences de Zotero Bouton actions (suite) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 20

Préférences : synchronisation Settings : se créer un compte (diapo 66) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 21

Préférences : synchronisation Reset : avec le serveur Zotero (diapo 67) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 22

Préférences : Recherche télécharger pdftotext et pdfinfo pour l’indexation des pdf C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 23

Préférences : exportation Choix du style par défaut C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 24

Préférences de Zotero : styles Options de citation à cocher et ajout de styles Cliquer sur install depuis le site de Zotero : Zotero Style Repository Lien vers liste de styles sur site Zotero Cliquer sur install C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 25

Préférences : avancées On peut changer le répertoire des données de Zotero Worldcat par défaut Résolveur SFX de l’INRA Par défaut = worldcat C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 26

Ajouter nouvel élément manuellement C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 27

Création d’une notice Clic sur le bouton vert (nouvel élément) Choix du type de document Champs à remplir divers types de documents C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 28

Ajout manuel de marqueurs (mots-clés) Voir aussi Diapos 45 et 46 pour la recherche par les marqueurs Collection sélectionnée Référence sélectionnée Marqueurs de la ref. Marqueurs ajoutés (bleu) Marqueurs importés (jaune) Marqueurs sélectionnés pour cette références (tous) Possibilité de rechercher un marqueur avec le cadre (loupe) ou en cliquant sur le mot C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 29 29 29

Créer un nouvel élément à partir de la page courante : copie de la page C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 30

Annoter et surligner une capture de page web Fichier de stockage dans zotero Icônes d’annotation C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 31

Annoter et surligner une capture de page web Réduire les annotations Ajouter un post-it à n’importe quel endroit Surligner le texte Supprimer le surlignage C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 32

Capture de page courante Exemple des pdf et récupération des métadonnées Ouvrir le pdf en pleine page, dans le navigateur et ré-ouvrir zotero à partir de cette page Cliquer sur icône créer un nouvel élément à partir de la page courante On a bien une nouvelle notice avec icône pdf Clic droit et clic sur récupérer les métadonnées du pdf (une fenêtre s’affiche la 1ère fois pour installer pdftools : pdftotext version 3.02 et pdfinfo version 3.02 cf. diapo 22) L’icône pdf devient article avec le pdf attaché La notice complète s’affiche dans la colonne de droite Champs non importés à vérifier: résumé, vol., pages… Que des pdf éditeur, pas de scans C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 33

Récupération des métadonnées du pdf (pdf capturé depuis le web ou glissé-déposé depuis son ordi) (récupération partielle selon les sources) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 34

Ajouter un élément par son identifiant : DOI, ISBN ou PMID Saisir le DOI ou l’ISBN Le document est chargé automatiquement dans la collection C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 35

Ajouter une nouvelle note Ajout d’une note indépendante S’affiche comme une référence On peut ensuite Relier cette note à une référence par glisser/déposer On peut copier/coller du texte dans les notes Ajout d’une note liée à une référence C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 36

Attacher des fichiers à une référence choix entre « lien vers un fichier » et « stocker une copie du fichier » (2e choix recommandé) Lien vers le fichier attaché sur son ordi = photo de l’écran pas un lien Le fichier attaché va être stocké dans les données de Zotero (conseillé) = lien vers l’adresse de la page web C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 37

Attacher un pdf à une notice déjà existante Ouvrir le pdf en pleine page Se positionner sur la bonne notice Cliquer sur l’icône trombone et sur joindre une capture de la page courante Apparemment pas possible d’attacher un fichier à une note indépendante (menu du trombone pas actif) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 38

Organiser sa bibliothèque Bibliothèques ou collections C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 39

Organiser sa bibliothèque (suite) Ma bibliothèque clic sur l’icône pour créer une nouvelle collection Clic droit dans une collection pour créer une sous-collection (la nommer) Choisir sa collection pour créer des notices ou en importer Nombre de références dans sa collection : « ctrl a » affichage en colonne 3 Clic droit dans une collection : renommer ou supprimer une collection mais les références de la collection supprimée resteront dans Ma bibliothèque Si on supprime des références dans Ma bibliothèque, elles seront supprimées aussi dans la collection On peut faire glisser-déposer des notices dans une autre collection, mais elle restent dans le fichier d’origine C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 40

Actions sur les références (clic droit) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 41

Générer un rapport à partir d’un élément sélectionné Clic droit sur la référence : Générer un rapport à partir de l’élément sélectionné Tous les champs non vides de la colonne 3 figurent dans ce rapport qu’on peut enregistrer dans un fichier en tant que page html C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 42

dans ma bibliothèque ou une collection Recherche simple dans ma bibliothèque ou une collection - Recherche dans toutes les références + fichiers attachés + notes et dans tous les champs y compris les marqueurs (+ dans les pdf si sont indexés) - troncature * et opérateurs AND/ET implicites - minuscules / majuscules sans importance C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 43

Recherche avancée multicritères Icône loupe C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 44

Recherche avancée clic sur l'icône loupe Possibilité de rechercher dans les sous-collections ou non Recherche dans tous les champs, recherches croisées + options de recherche Possibilité d'enregistrer la recherche et de générer une bibliographie ou un rapport à partir du résultat de cette recherche Recherche enregistrée : une nouvelle collection est créée Elle comprend toutes les réfs correspondant au résultat de la recherche Cette collection s'actualise au fur et à mesure (si une réf est ajoutée à ma bibliothèque et qu'elle correspond à la recherche, elle y est ajoutée) ATTENTION : pas de ET ou de OU mais 1er menu déroulant est équivalent à : « Correspond à toutes les conditions suivantes » ou « au moins à une » C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 45

Recherche par les marqueurs (ajoutés manuellement ou importés ->voir plus loin) Sélectionner un ou plusieurs marqueurs en cliquant dessus pour filtrer votre bibliothèque (ou votre collection) Marqueur sélectionné C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 46

Recherche par les marqueurs Collection sélectionnée : tous les marqueurs sont affichés Seul le marqueur non grisé est actif et correspond à une référence On peut faire glisser une référence sur un marqueur pour que ce dernier soit ajouté à la référence Remarque : les marqueurs bleus sont ajoutés manuellement les jaunes sont ajoutés par import depuis des Bdd C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 47

Récupération de références à partir de Endnote (pb selon les versions) Ouvrir fichier Endnote edit -> select all -> output styles -> Endnote export File (ou RefMan (RIS) -> export -> fichier.txt se remettre dans Zotero icône actions (roue dentelée) -> import -> fichier .txt Importe les références à la fois dans « ma bibliothèque » et dans une nouvelle collection appelée « import jour date année » il faut ensuite faire glisser les réfs au bon endroit L'import des pdf ne marche pas ! N’importe pas tous les champs de Endnote (label, notes, DOI)… Zotero n’a pas tous les champs de Endnote et on ne peut pas en ajouter C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 48

Import d’une autre collection de Zotero Roue dentelée : import Choix du fichier à importer Format d’import .rdf C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 49

Récupération des références depuis des base de données liste des sites des bases de données compatibles avec Zotero http://www.zotero.org/translators/ Web of Science  clic sur barre navigation Cab Abstracts   clic sur barre navigation (pb de pagination) (pb WoS – WoK 5 ?) FSTA   clic sur barre navigation pour FSTA – WoK 5 (il n’y a pas toutes les références dans la boite de dialogue) PubMed Clic sur barre navigation Econlit / Francis  export format RIS + Import dans Zotero Science Direct export format RIS+ Import dans Zotero Nature Publishing Group clic sur barre navigation (+ pdf) ProdInra Panier, export format EndNote + Import dans Zotero Sudoc Google Scholar Scirus clic sur barre navigation (pour SD) ou export RIS PMB Montpellier export format BibTex + Import dans Zotero Agricola C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 50

Récupération des références depuis des bases de données Liste des sites compatibles (possibilité d’importer des listes) et partiellement compatibles (import références par référence) http://www.zotero.org/translators La liste ne semble pas à jour ; voir plutôt le forum correspondant http://forums.zotero.org/6/ Possibilité pour les bases non compatibles : exporter en format BibTex et importer dans Zotero ou exporter vers Endnote et importer dans Zotero (On ne peut pas importer des documents word) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 51

Récupération des références depuis des base de données Interrogation d’un catalogue (ex. Google scholar) Liste des références obtenues L’icône jaune s’affiche dans la barre de l’adresse du site Attention : bien se placer dans une collection sélectionnée Liste des références C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 52

Récupération des références depuis des base de données clic sur icône jaune > ouverture de la fenêtre des résultats de la 1ère page du site Sélection d’1 ou de plusieurs références : select all, deselect all OK > les références sélectionnées sont importées dans sa collection de Zotero C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 53

Récupération d’une référence précise Après l’interrogation d’un catalogue (ex. Amazon) Liste des références > choix d’une référence : l’icône bleue s’affiche >Ok Attention : toujours se placer dans une collection sélectionnée C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 54

Créer une bibliographie à partir d’une collection (ou de plusieurs références) Pas possible à partir de « ma bibliothèque » Sélectionner la collection ou les références dans la collection clic droit« créer une bibliographie à partir de la collection ou des documents sélectionnés» choisir le style (boîte de dialogue s'affiche automatiquement) ou en installer un qui existe (voir diapo suivante) choisir format de sortie (rtf, html...) OK choisir le nom du fichier et localisation répertoire Pour la pré-visualisation des styles voir au passage de la souris sur la page des styles du site zotero.org Possibilité de glisser/déposer des références dans un mail ou un traitement de texte : cliquer, ne pas lâcher et aller vers le mail en cours de rédaction ou le document word et déposer C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 55

choix du style et du format de fichier dans la nouvelle fenêtre Créer une bibliographie à partir de l’élément sélectionné Clic droit sur la référence choix du style et du format de fichier dans la nouvelle fenêtre C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 56

Citer et créer une bibliographie Glisser, déposer des références dans un mail ou un texte Ouvrir un mail ou un traitement de texte acceptant l’inclusion du format texte par glisser déposer Sélectionner un ou plusieurs éléments de sa base Zotero Faire glisser la sélection dans l’application choisie en maintenant le bouton gauche de la souris appuyée et placer quelques secondes le pointeur de la souris sur l’application active dans la barre de tâche. Attendez que la fenêtre de l’application s’ouvre puis placer le pointeur de la souris à l’endroit où vous désirez copier la bibliographie. Relâchez le bouton C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 57

Intégration des références avec Microsoft Word et Open Office Writer Installation des plugins Dans la page d’accueil de Zotero, cliquer sur Download Now, puis sur plugins for Microsoft Word and Open Office (il faut que ces applications soit fermées) Choisir Zotero 2.1/3.0 word processor plugins, Installation des plugins en fonction de son environnement informatique (Windows, Mac…) La barre d’outils des icônes de Zotero apparaît en haut à gauche dans Word ou Open Office Writer (Si ce n’est pas le cas pour word, aller dans le menu outil > Macro > Sécurité et cliquer sur le niveau de sécurité bas) Pour Word 2010 cliquer sur le bouton Compléments pour faire apparaître les icônes Zotero Pour Open Office, voir diapos 82 à 85 C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 58

Icônes de Zotero dans word (2003) Remove Codes (suppression des codes de champs) Zotero Insert citation Zotero insert bibliography refresh Set Doc Preferences = changer de style Zotero Edit Citation = modification d’une citation Zotero edit bibliography C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 59

Icônes de Zotero dans word Zotero insert citation Choix du style lors de la 1ère installation et choix de la référence de sa collection Entrée clavier pour continuer à taper du texte et insérer une autre citation Zotero Edit Citation Modification d’une citation si curseur dans la citation Zotero insert bibliography Insertion de la bibliographie en fonction du style choisi (récapitulatif des citations) Zotero edit bibliography Modifier si curseur à l’intérieur de la bibliographie Zotero refresh (actualiser ses insertions) Zotero set doc prefs (changer de style) Zotero remove codes (empêche Zotero de mettre à jour les citations et les bibliographies dans le document) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 60

Choix d’un style Choix d’un style initial : cliquer sur le bouton actions (roue dentelée) -> préférences -> styles Ou choix depuis les icônes de word Pour obtenir un autre style, aller sur la page www.zotero.org/styles et visualiser le style en passant la souris Cliquer sur install pour en installer un (il va se rajouter dans la liste dans preferences) On ne peut pas créer un nouveau style sous endnote et l’importer… C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 61

Export Zotero -> Endnote Clic droit sur la collection choisie Exporter en format .RIS Choisir d'exporter ou non les notes OK Nommer le fichier et choisir répertoire Ouvrir Endnote File -> import -> fichier.RIS C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 62

Export vers la bibliothèque d’un autre utilisateur Clic droit sur la collection ou sous-collection icône actions : exporter format Zotero .RDF Nommer fichier d'export et choisir répertoire (ou disque dur externe) OK Envoyer à son correspondant en fichier attaché On est obligé de passer par l'import pour ouvrir une collection qui est sur un répertoire extérieur Avec la possibilité de partager les collections sur le serveur de Zotero, cette fonction est moins utilisée C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 63

Fonctionnalités Zotero V2 Création d’un compte C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 64

Création d’un compte Le compte Zotero permet de sauvegarder sa bibliothèque en ligne sur le serveur Travailler depuis plusieurs ordinateurs Partager des références avec des groupes publics ou privés C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 65

Synchronisation (1) Configurer les paramètres de synchronisation dans roue dentelée -> préférences -> Sync On reçoit un mail de confirmation Lancer la synchronisation de sa bibliothèque en ligne On a accès à « My library », qu’on a sauvegardée sur le serveur Pb : difficultés (lenteur de la synchro ou échec) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 66

Synchronisation (1) settings C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 67

Synchronisation (1) reset C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 68

Synchronisation (2) lancement de la synchronisation de la bibliothèque C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 69

Synchronisation (3) Fonction Sync : Aller dans menu roue dentelée -> préférences -> synchronisation -> reset restore de Zotero en local vers le serveur : on sauvegarde sur le serveur Restore du serveur vers son poste : par exemple si on travaille sur un autre ordinateur Réfs synchronisées avec les fichiers attachés, mais le texte intégral est remplacé par le lien vers l’éditeur. Les pièces attachées font rapidement dépasser le volume limité sur le serveur Zotero C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 70

Créer un groupe Onglet Groups du site Zotero : create a new group Choisir un nom et les conditions d’accès à ce groupe Remplir le profil du groupe Onglet Members : inviter les participants C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 71

Groupes C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 72

Types de groupes -> Groupes privés -> Groupes publics Seuls les membres du groupe et les invités peuvent voir la page du groupe Ces groupes n’apparaissent pas dans la recherche de groupe -> Groupes publics Adhésion restreinte : la page du groupe est visible mais il faut une invitation pour le rejoindre Adhésion ouverte, tout le monde peut le rejoindre C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 73

Voir les groupes existants Sur le site zotero.org, une fois qu’on a créé son compte, cliquer sur groups pour aller voir les groupes existants ou les nouveaux groupes créés Au 03/11/11, il y a 20620 groupes On peut faire une recherche par discipline ou faire un browse C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 74

Recherche dans les groupes C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 75

Paramétrage des droits sur la bibliothèque Library reading : autoriser la consultation de la bibliothèque à tout le monde, seulement aux membres du groupe ou seulement aux administrateurs Library editing : autoriser la modification de la bibliothèque seulement aux membres du groupe ou seulement aux administrateurs Droits et types d’utilisateurs : 3 rôles Administrateur Propriétaire du groupe Membre C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 76

Bibliothèque du groupe On peut ajouter un élément par glisser/déposer depuis sa propre bibliothèque On peut copier des références d’autres bibliothèques vers la sienne On ne peut pas travailler sur la bibliothèque qui est sur le serveur, on peut seulement la consulter On peut stocker gratuitement jusqu’à 100MB pour les fichiers attachés sur le serveur de Zotero (très vite atteint), au-delà c’est payant On peut suivre les nouveautés d’autres bibliothèques par fils RSS (se placer sur la bibliothèque de l’utilisateur et cliquer sur subscribe to this feed) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 77

Zotero V2, collaboratif permet de faire partie de groupes de collaborer avec d’autres utilisateurs de publier des bibliothèques partagées de découvrir d’autres chercheurs travaillant dans votre domaine C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 78

Sauvegarde Fortement recommandé de sauvegarder régulièrement (pour plus de simplicité, on peut sauvegarder tout le répertoire Zotero) ou sauvegarder une collection particulière après export (format rdf), sur support externe Sauvegarder sur le serveur de Zotero (mais penser à sauvegarder à chaque mise à jour !) Aller dans menu roue dentelée -> préférences -> synchronisation -> reset -> restaurer C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 79

Les limites de Zotero Pas assez de sites compatibles pour la récupération de références, donc possibilités d'import/export limitées (mais çà évolue) Pas de dédoublonnage des références (de plus accepte l’importation d’une réf qui est déjà dans une collection) Dédoublonnage prévu dans la version 3 Pas de champs personnalisables dans les notices Quelle garantie de compatibilité entre les différentes versions de Zotero et notamment avec la dernière version Standalone Comment Zotero gère des gros volumes de références ? Mais çà évolue (voir les forums) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 80

Zotero Standalone Version beta lancée en juillet 2011 compatible Mac OS X, Windows et Linux Téléchargeable sur la page d’accueil de Zotero.org Plus besoin d’avoir l’extension Zotero de Firefox ouverte pour voir sa bibliothèque L’interface et les fonctionnalités restent les mêmes Zotero Standalone partage un répertoire avec Zotero/Firefox, les articles de l’un sont donc sauvegardés dans l’autre Voir le Forum correspondant sur le site de Zotero http://forums.zotero.org/14/ C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011

Liens utiles Quelques tutoriels en français Plusieurs tutoriels mis en ligne sur la page logiciels documentaires de l’Université Paris Descartes http://www.bu.univ-paris5.fr/spip.php?article860 Forum Zotero http://forums.zotero.org/ Le blog francophone de Zotero http://zotero.hypotheses.org C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 82

Intégration des références avec OpenOffice Writer Installation des plugins Dans la page d’accueil de Zotero, cliquer sur Download Now, puis sur plugins for Microsoft Word and OpenOffice Install OpenOffice plugin for Zotero 2.1 La barre des icônes de Zotero apparaît en haut à gauche dans OpenOffice Writer Si pb, aller dans le menu Outils de Mozilla > Gestionnaire des extensions, ouvrir mes extensions et vérifier que l’extension zotero.oxt soit activée C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 83

Insertion d’1 référence dans OpenOffice Writer Icônes Zotero (bouton insert bibliography) Choix du style C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 84

Edition de la référence dans OpenOffice (bouton edit bibliography) Choix de la référence C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 85

Edition de la référence dans OpenOffice C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro) Doccitanist/CNRS 08/11/2011 86