Analyses en multiplex Le Bio-Plex Luminex.

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Transcription de la présentation:

Analyses en multiplex Le Bio-Plex Luminex

Bio-Plex Analyse simultanée de nombreuses substances sur de faibles volumes d’échantillons (30ul de plasma, surnageants, etc). 4 grandes familles d’applications: Le Bio-Plex (www.luminexcorp.com ) est un système ouvert : - réactifs commerciaux - vos propres réactifs basés sur les billes de la société Luminex

Champs d’applications - réactifs commerciaux Cell biology Phosphoprotein assays (www.bio-rad.com) Transcription factor assays (www.biosource.com, linco: www.labodia.com) Hormones Cytokines (inflammation, adipokines) (www.bio-rad.com, www.labodia.com) Endocrine hormones (www.labodia.com) Pituitary hormones (www.labodia.com) Metabolic markers cardiovascular diseases (www.labodia.com) bone metabolism (www.labodia.com) apolipoproteins (www.labodia.com) apoptosis (www.labodia.com) Nucleides RNA assay (www.panomics.com) Des réactifs commerciaux sont disponibles pour: l’homme, le singe, le rat, la souris, le chien.

Panel et prix : mouse cytokines Note: de nombreuses autres possibilités sont proposées par les sites commerciaux

Panel et prix : mouse bone markers Note: de nombreuses autres possibilités sont proposées par les sites commerciaux

Panel et prix : mouse endocrine Note: de nombreuses autres possibilités sont proposées par les sites commerciaux

Panel et prix : human gut hormones Notes: de nombreuses autres possibilités sont proposées par les sites commerciaux.

38 échantillons en double ou 76 échantillons en simple Nombre de tests par kit Le Bio-Plex ne peut être utilisé au coup par coup. Son unité de travail est une plaque de 96 puits. De ces 96 puits, 20 sont nécessaires à l’étalonnage et à la validation de chaque dosage. 1 kit = 1 plaque = 38 échantillons en double ou 76 échantillons en simple Faut-il mesurer systématiquement les échantillons en double? Oui si vous êtes en phase finale d’un projet et si vous devez quantifier très précisément des variations de concentrations très faibles Non si vous disposez de doubles biologiques ou si vous êtes en phase exploratoire

Planification de l’expérience Impératif : prendre contact au moins 15 jours à l’avance pour disponibilité et renseignements en vue des analyses à effectuer Échantillons Sont à apporter déjà centrifugés et prélevés conformément à la notice du kit (nous demander) Numérotation Claire, bien lisible et indélébile Volume En supplément 30ul pour dosages en simple et 75ul pour duplicats Fournir 15 ml de milieu de culture frais lorsque les échantillons sont des surnageants de culture Analyses Préciser types de dosages et nombre d’échantillons Nature du projet Quelques mots sur la nature du test et les conditions de prélèvement

Nature des échantillons En recherche clinique humaine Plasma , sérum, urine, expectoration , LCR, Liquide bronchoalvéolaire, secrétions vaginales , liquide de ponction articulaire En recherche fondamentale Plasma, sérum, urine, divers liquides histologiques, extrait de tissus, culture cellulaire, milieu de culture. (liste non limitative) Jamais de solvants organiques, détergents < 2 %

Prélèvements des échantillons et volumes Sang : préférer systématiquement le plasma EDTA à toute autre forme de collecte Attention aux sérums lipémiques, hémolysés ou visqueux et aux protéines instables dans le plasma (ACTH , glucagon, GLP-1, etc: prélever le sang en présence d’inhibiteurs de protéases). Bio-Plex = petits volumes pour un grand nombre d’analyses 30 µl de plasma pour 30 cytokines humaines ou 22 cytokines de souris Attention : pour un dosage en double, fournir 75 µl de plasma à notre laboratoire

Rendu des résultats Les résultats sont sortis sur imprimante et sont transmis par e-mail sous forme de tableau Excel avec toutes les données utiles.

Formulaire à remettre avec les échantillons Demande d’analyses Formulaire à remettre avec les échantillons Date Nom Groupe Nombre d’échantillons Nature des échantillons (plasma, surnageant etc.) Type de dosage Nature du projet (type de souris) Adresse email

Conditions d’utilisation La plate-forme propose divers dosages effectués sur plasma et milieu de culture à l’aide de kits commerciaux L’unité d’utilisation est un kit complet soit 76 échantillons La responsabilité de la plate-forme n’est pas engagée en cas de résultats douteux obtenus sur des échantillons incompatibles (hyperlipémiques hémolysés, visqueux etc…) ou des vices de fabrication des kits

Contact 021/ 692 3957 labo 2022 Jours : mardi jeudi vendredi Laborantine responsable : Marianne Carrard Superviseur de la plateforme : Frédéric Preitner Directeur de la plateforme : Bernard Thorens Jours : mardi jeudi vendredi 021/ 692 4136 labo génotypage ou 021/ 692 3957 labo 2022 Mail to: marianne.carrard@unil.ch