Autour de ZOTERO et MENDELEY Logiciels de gestion de références : quels besoins, quelles fonctions ? Autour de ZOTERO et MENDELEY URFIST de Rennes – 03/04/2013 Appuyé sur le support de F. Cohen-Adad « Panorama des logiciels de gestion de références bbiliographiques »

PLAN Origines et caractéristiques des logiciels de gestion de références bibliographiques Panorama général des outils gratuits pour la gestion des références bibliographiques Orientations globales des logiciels Mendeley et Zotero, Comparaison des sources compatibles Analyse comparative des fonctionnalités de gestion Capacités des logiciels pour la publication

Origines des logiciels de bibliographie personnelle A la base de toute recherche : Le travail de citation Confrontation aux énoncés et travaux précédents, concernant le même sujet ou des sujets connexes crédibilité scientifique Le travail de recherche s’appuie sur un réseau de citations qui seront intégrées dans la publication Citations dans le texte Notes de bas de page Bibliographie URFIST Rennes

Origines des logiciels de bibliographie personnelle Les principales étapes Recherche documentaire et exploration de la littérature scientifique sur le sujet de recherche Bases de données Recherche dans le web Récupération et stockage de références bibliographiques Constitution d’un corpus de références Identification et description précises des documents référencés URFIST Rennes

Origines des logiciels de bibliographie personnelle Les principales étapes (suite) : Exploitation des références Citations dans le texte de la thèse et notes de bas de page Élaboration de la bibliographie Réutilisation des références pour d’autres travaux : communications à des congrès, articles de revues spécialisées … Mise en forme des références En conformité avec des normes d’écriture et de présentation URFIST Rennes

Origines des logiciels de bibliographie personnelle Les normes : Norme ISO/AFNOR Norme ISO 690 Norme AFNOR NF Z 44-005, de 1987, pour les publications imprimées, livres et publications en série, leurs parties composantes et les brevets) Norme 690-2 Norme AFNOR Z 44-005-2, de 1998, pour les documents électroniques URFIST Rennes

Origines des logiciels de bibliographie personnelle Les normes : Protocoles spécifiques Protocole MLA (Modern Language Association of America) Protocole APA (American Psychological Association) Pratiques mises en œuvre par les universitaires et les étudiants dans leurs travaux Usages mis en place par les éditeurs de livres et de revues http://owl.english.purdue.edu/owl/resource/747/01/ URFIST Rennes 7

Outils de gestion bibliographique 2 – Définition et applications Un logiciel de gestion de références bibliographiques (LGR) permet de : Stocker Importer Gérer Exporter Éditer Ses références Partager Formater Diffuser URFIST Rennes 8

Origines des logiciels de bibliographie personnelle Premier développement dans les années 80 En réponse aux besoins des chercheurs Face à l’essor des publications scientifiques « publish or perish » Diversification des formats (texte, image…) Face au développement des modalités d’accès aux sources d’information scientifique Bases de données en ligne Agrégateurs de revues Web 2.0

Caractéristiques des logiciels de bibliographie personnelle Stocker des références et / ou signets web issus d'une recherche documentaire (par saisie manuelle ou import automatisé) ou d’autres outils bibliographiques Classer, organiser et de gérer dans une base de données les références et la publication Formater les références selon un style de publication Générer automatiquement dans une publication scientifique les citations et la bibliographie ainsi formatées. Exporter le corpus de références, le publier sur le web et dans certains cas, partager ses références. URFIST Rennes

Caractéristiques des logiciels de bibliographie personnelle Atouts des LGR Pour le stockage et la gestion des références : facilités d’exploitation de gros corpus de références par la structuration en base de données Pour la publication : récupération des références lors de l’écriture d’un texte formatage automatique des références selon les normes d’écriture en vigueur saisie unique des données et choix d’un format d’édition Pour le suivi de la recherche documentaire : liens entre la recherche documentaire et la base personnelle URFIST Rennes

Caractéristiques des logiciels de bibliographie personnelle Plateformes en ligne : Partage des références et accès à sa bibliothèque en ligne « Capitalisation des connaissances » et réseau de chercheurs Gain du temps pour son travail de recherche. URFIST Rennes

Caractéristiques des logiciels de bibliographie personnelle Typologies des LGR : Libres ou propriétaires Gratuits ou commerciaux En ligne ou / et application à installer en local Outils individuels ou de partage Outils autonomes ou à forte intégration web ou outils à orientation plus bibliographique Outils orientés références bibliographiques ou outils intégrant références et signets Multiplateformes ou PC / Mac / Linux URFIST Rennes

L’offre

L’offre Un grand nombre de produits Développement permanent de nouveaux logiciels Evolution et multiplication des fonctions Interfaçage avec les traitements de texte Orientation web … Des outils multi-plateformes ou non URFIST Rennes

L’offre Quelques logiciels professionnels (commerciaux) connus et utilisés : EndNote / EndNote Web http://www.endnote.com/ Reference Manager http://www.refman.com/ Procite http://www.procite.com/ Papers http://www.mekentosj.com/papers/ RefWorks édités par Thomson Reuters Logiciel en ligne http://www.refworks.com URFIST Rennes

L’offre Il existe un grand nombre d’autres logiciels bibliographiques Sur le site de Plume, fiches techniques de logiciels 2008/2009 : projet Eclore, test sur un panel de logiciels de gestion de références bibliographiques Sur Form@doct (http://guides-formadoct.ueb.eu/) , un guide sur les LGR Quelques exemples de logiciels gratuits à télécharger ou à utiliser en ligne Voir diapo suivante URFIST Rennes

Quelques outils gratuits (références et / ou signets web) L’offre Quelques outils gratuits (références et / ou signets web) En ligne Bibsonomy CiteUlike WizFolio (version de base) BibMe A noter : Connotea ferme le 12 mars Mixte Mendeley (version de bureau et serveur) Zotero (synchronisation des données en ligne) En local JabRef BibDesk (pour mac) Bibus URFIST Rennes

L’offre Multiplicité / Diversité des outils Quelques outils prépondérants Aujourd’hui, surtout Payant Gratuit Gratuit

Caractéristiques communes Création de bases de données personnelles de références bibliographiques Stockage des références bibliographiques Enrichissement de la base Import automatique depuis des sources diverses : bases de données, sites web, moteurs de recherche Saisie de références Gestion de la base Organisation de la base, recherche dans la base, gestion des doublons… Rédaction de travaux scientifiques Insertion de citations dans un document élaboré avec un traitement de texte Production automatique de la bibliographie

Caractéristiques communes Fonctions complémentaires Gestion du texte intégral et des métadonnées Partage de références Annotations des PDF et des captures web Bibliothèque en ligne / synchronisation des données Export de la base de références Bibliothèques de références sur mobile

Quels critères de choix ? Eléments de comparaison Les stratégies générales des outils Les sources depuis lesquelles il est possible d'importer des références. Les styles disponibles pour formater automatiquement la bibliographie. La possibilité de créer ou d'adapter des modèles d'import, de publication. L'interaction avec les traitements de texte. La prise en compte et la gestion du texte intégral pour le document référencé. Les possibilités de partage des références et leur gestion en ligne. Les possibilités d'export et d'échange avec d'autres outils bibliographiques.

L’offre Reference Manager Overview, Martin Fenner, 19 septembre 2010. Licence CC : BY. Source : GOBBLEDYGOOK, PLoS BLOGS URFIST Rennes

L’offre Evaluations comparatives Panorama des logiciels de gestion de références bibliographiques, Frédérique Cohen-Adad (nov. 2012) http://urfist.univ-lyon1.fr/servlet/ com.univ.collaboratif. utils. LectureFichiergw?ID_FICHIER=1320402929118 Base Eclore (2009) http://eclore.veille.inist.fr/-/Eclore/?Eclore=interro « Comparison of reference management software » sur Wikipedia (dernière maj février 2013) http://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_reference_management_softw are URFIST Rennes

Orientations globales Zotero, http://www.zotero.org 2006 > Logiciel open source Vient du monde académique Produit par le Center for History and New Media / George Mason University Logiciel local = plugin Firefox et outil autonome (Standalone) + serveur en ligne Gratuit pour l’application locale, gratuit jusqu’à 1 Méga de stockage sur l’espace en ligne Multiplateforme Orienté références bibliographiques et pages web Intégration web favorisée Réseau social

Orientations globales Mendeley, http://www.mendeley.com 2008 > Logiciel propriétaire Producteur = Mendeley Ltd Anglo-saxon Logiciel local (Mendeley Desktop) et plateforme en ligne 2 millions d’utilisateurs Accent mis sur le réseau social de chercheurs : diffusion des papiers, propriétés de réseau social; compte en ligne préalable à l’installation de Mendeley Desktop Logiciel gratuit pour l’application locale, gratuit jusqu’à 1 Go sur le serveur en ligne

Le modèle de logiciel ? Source : F. Cohen-Adad

Le modèle de logiciel ? Source : F. Cohen-Adad

Comparaison : l’import de références Source : F. Cohen-Adad

Comparaison : l’import de références Source : F. Cohen-Adad

Comparaison : l’import de références Source : F. Cohen-Adad

Comparaison : les imports depuis Zotero Les « translators » de Zotero Soit directement depuis la page web, soit en passant par la création de fichiers Environ1500 Catalogues de bibliothèques et de musées, bases de données spécialisées, sites de revues et d’actualités, sites web Plus hétérogènes, plus ouverts sur les SHS et sur le web + récupération à partir du DOI, ISBN, PMID Mais pas de possibilité de les modifier Exemples : les bases d’EBSCO, PubMed, JSTOR, Springer, ScienceDirect, Google Scholar, et Books, CiteSeer, WorldCat, Muse, Lexis-Nexis…

Comparaison : les imports depuis Mendeley Sur la page du Web Importer : 48 sources principales d’information scientifique + par identifiants DOI, PMID, ArXiv ID + PDF éditeurs (pas de modification des filtres)

Comparaison : les imports depuis Mendeley Autres sources d’alimentation de la base = Papers, par recherche ou navigation dans les disciplines

La gestion des références

Fonctionnalités de gestion des références Source : F. Cohen-Adad

Fonctionnalités de gestion des références Zotero gère : Les références bibliographiques Les liens Les fichiers associés Les captures de pages web / annotations de captures web Indexation possible des PDF, mais pas d’annotation actuellement Mendeley gère : Les fichiers Indexation des PDF Annotation des PDF

Les références Types de références : Avec Mendeley : 20 chez Mendeley 34 chez Zotero Pas de types de référence personnalisables Pas de champs personnalisables Avec Mendeley : Références marquées comme lues Filtre par auteurs, marqueurs, publications, mots clés

Fonctionnalités de gestion des références 300 Mo actuellement Source : F. Cohen-Adad

Fonctions de partage

Fonctions de Partage Source : F. Cohen-Adad

Fonctions de partage Diffusion en ligne Mendeley : un réseau social développé Fonction Papers : Facilite la recherche de documents scientifiques Facilite la diffusion de documents scientifiques Possibilité de recherche par disciplines et sous-disciplines + tags Education : 342 317 papers et 3722 groupes

Fonctions d’export Formats d’export de la bibliothèque Zotero : 11 formats (RDF, RIS, BibTeX, ReferBibIX, TEI …) Mendeley : 3 formats (RIS, BibTeX, EndNote XML)

Citer et éditer sa bibliographie Source : F. Cohen-Adad

Citer et éditer sa bibliographie Source : F. Cohen-Adad

Citer et éditer sa bibliographie Mendeley : Intégration Mendeley: Word, Libre Office / Open Office 4306 styles disponibles http://www.mendeley.com/citationstyles/ Majoritairement en STM 4 variantes APA 12 variantes du style Chicago Manual of Style Large palette de revues Pas de modification possible dans l’interface; il faut connaître le langage CSL

Citer et éditer sa bibliographie Zotero : Intégration Zotero : Word, Libre Office / Open Office 4307 styles disponibles http://www.zotero.org/styles/ Palette plus développée du côté des sciences humaines 4 variantes APA Pas de modification possible dans l’interface; il faut connaître le langage CSL

Atouts et limites Zotero Avantages Limites Logiciel libre / communauté permettant des améliorations progressives Facilité d’usage et d’import Large intégration web Ouverture sur les SHS en même temps que sur les STM Gestion des PDF Serveur Zotero et travail collaboratif Limites Peu d’espace de stockage gratuit Rigidité pour les types de référence et les champs Modification des styles uniquement par le code CSL Qualité des imports à contrôler

Atouts et limites Mendeley Avantages Limites Gratuité Réseau social de chercheurs et site très collaboratif Facilités de gestion des PDF My Publications / Données sur les publications Limites Pas de personnalisation des types de références ou des champs Modification des styles uniquement par le code CSL Sécurité des données ? Qualité des imports à contrôler

Ressources Cohen-Adad, F. Panorama des logiciels de gestion de références bibliographiques, 2011, http://urfist.enc.sorbonne.fr/sites/default/files/file/docsab/Panorama _logiciels_bibliographiques_mars2012.pdf Comparison of reference management software. Wikipedia, 2012, http://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_reference_management _software Fenner, M. Reference manager overview, PLosBlogs2010, http://blogs.plos.org/mfenner/reference-manager-overview/ Hensens, H. 3 logiciels « gratuits » pour gérer sa bibliographie, 2012, https://www.mpl.ird.fr/documentation/download/ENW_Zotero_Men deley_AperoDoc.pdf