Logos Logos Phu Phu Phu Phu INFOS Canal KcsA Canal KcsA Espèces : Streptomyces lividans Localisation : Protéine membranaire PDB : 1K4C Etude : 1998 Méthode : Cristallographie à Rayons X Motif : GYGTV INFOS

Logos Logos Phu Phu Phu Phu PRESENTATION Canal KcsA Canal KcsA L’homéostasie d’un organisme est une condition vitale, et doit donc être maintenue par de nombreuses molécules membranaires qui surveillent et régulent quand il y a besoin. Cela nécessite l’intervention de protéines particulières comme des récepteurs (ionotropes ou métabotropes), des canaux, etc… Cependant, ces molécules doivent être spécifique d’un ou plusieurs ligands permettant de modifier un paramètre précis. Par exemple, les récepteurs ne reconnaissent que les ligands qu’ils peuvent fixer, que ce soit du à la géométrie des molécules mise en jeu, ou à certaines forces. Il est également possible de reconnaitre un récepteur sans l’activer puisqu’il ne correspond pas parfaitement à la forme voulue (Antagoniste). Les canaux utilisent quant à eux d’autres mécanismes qui permettent de trier les molécules passantes et d’établir une sélectivité vraiment spécifique, que ce soit par la taille, la forme, ou par la charge pour les ions. Ce mécanisme est assuré par le filtre de sélectivité qui est contenu dans les canaux et permettent la sélection de molécules, d’ions ou d’atomes précis.   PRESENTATION

Logos Logos Phu Phu Phu Phu FONCTIONNEMENT Canal KcsA Canal KcsA Un canal est une protéine, soit un ensemble d’acides aminés, qui est le plus souvent bien conservée puisque c’est sa séquence précise ou une majeure partie de celle-ci qui est responsable de cette fonction précise. Ici, nous allons donc nous attarder sur le canal potassique KcsA analysé chez la bactérie Streptomyces lividans, et notamment présent chez la souris. KcsA est une protéine de 4 sous-unités identiques de 158 résidus, qui sont subdivisés en 2 hélices M1 et M2 réunies par un segment P, formant le pore. Celui-ci est long d’environ 30 acides aminés, mais contient un pentapeptide qui forme un motif essentiel pour le passage exclusif du potassium. Ces 5 acides aminés sont GYGTV et restent très conservés dans les canaux potassiques. FONCTIONNEMENT

Logos Logos Phu Phu Phu Phu FONCTIONNEMENT Canal KcsA Canal KcsA Lors de son passage dans le canal, l’ion potassium est hydraté et s’entoure donc d’une couronne de 8 molécules d’eau qui contribue à augmenter sa taille dans la cavité. Une fois que l’ion potassium précédent s’est libéré des premiers oxygènes formant le filtre sélectif, le potassium présent dans la cavité entre à son tour, se libérant des molécules d’eau pour se fixer aux premiers oxygènes par des liaisons faibles, de type Van Der Waals. Il est ensuite attiré par les suivants à l’aide du gradient électrochimique. Cette mobilité lui permet d’avancer de site de fixation en site de fixation, des oxygènes la plupart du temps issus des groupements carbonyles des acides aminés. Par la suite, il ressort dans le milieu extracellulaire. La sélectivité se base donc sur des critères de gradient électrochimique qui favorise le recrutement de potassium dans le canal, mais également de taille, puisque les ions potassium disposent de la taille idéale pour passer d’oxygène en oxygène sur les parois du filtre de sélectivité. FONCTIONNEMENT

Logos Phu Phu 4 158 45 10 CHIFFRE Canal KcsA Composition Sous-unités Taille 158 Résidus Longueur 45 Ã Largeur 10 Ã CHIFFRE

Logos Phu Phu ILLUSTRATION Canal KcsA http://slideplayer.fr/slide/514780/