Introduction aux logiciels de gestion de références bibliographiques Formations Doctorales Nantes 2017 SCD / URFIST Bretagne et Pays de la Loire Marie-Laure Malingre

Outils de gestion bibliographique Plan 1 - Contexte d’utilisation 2 - Définition et applications 3 - Panorama général 4 - Présentation de quelques outils et méthodologie

Outils de gestion bibliographique 1 – Contexte d’utilisation A la base de toute recherche : Le travail de citation Confrontation aux énoncés et travaux précédents, concernant le même sujet ou des sujets connexes crédibilité scientifique Le travail de recherche s’appuie sur un réseau de citations qui seront intégrées dans la publication Citations dans le texte Notes de bas de page Bibliographie

Outils de gestion bibliographique 1 – Contexte d’utilisation Les principales étapes Recherche documentaire et exploration de la littérature scientifique sur le sujet de recherche Bases de données Recherche dans le web Récupération et stockage de références bibliographiques Constitution d’un corpus de références Identification et description précises des documents référencés

Outils de gestion bibliographique 1 – Contexte d’utilisation Les principales étapes (suite) : Exploitation des références Citations dans le texte de la thèse et notes de bas de page Élaboration de la bibliographie Réutilisation des références pour d’autres travaux : communications à des congrès, articles de revues spécialisées … Mise en forme des références En conformité avec des normes d’écriture et de présentation

Outils de gestion bibliographique 1 – Contexte d’utilisation Les normes : Norme ISO/AFNOR Norme ISO 690 Norme AFNOR NF Z 44-005, de 1987, pour les publications imprimées, livres et publications en série, leurs parties composantes et les brevets) Norme 690-2 Norme AFNOR Z 44-005-2, de 1998, pour les documents électroniques

Outils de gestion bibliographique 1 – Contexte d’utilisation Les normes : Protocoles spécifiques Style Harvard Style Vancouver Style MLA (Modern Language Association of America) Style APA (American Psychological Association) Pratiques mises en œuvre par les universitaires et les étudiants dans leurs travaux Usages mis en place par les éditeurs de livres et de revues Style Harvard / site Emerald Group Publishing 7

Outils de gestion bibliographique 1 – Contexte d’utilisation Du côté des LGR : 1983 : Apparition des premiers LGR Sci-MateTM , a user-friendly information storage and retrieval system for microcomputers / ISI ProCite, Personal Bibliographic Software of Ann Arbor, Michigan, repris par Thomson Reuters / ISI en 1996, mais fermé en 2013 1984 : Reference Manager, Ernest and Earl Butler, Research Information Systems, repris par Thomson Reuters Années 70 - Début des années 1980 : quel paysage pour l’information scientifique ? Grandes bases de données bibliographiques mises en place Après Chemical Abstracts, Medline et Pascal en 1971 Emergence des serveurs de bases de données et développement des accès en ligne Dialog en 1971 Premiers ordinateurs personnels 1982-83 : Protocole TCP-IP et réseau Internet Premiers ordinateurs personnels : bull en 1973, PC-IBM en 1975, Apple I en 1977` ProCite, a commercial reference management software program, was designed in the early 1980s by Victor Rosenberg, associate professor in the School of Library and Information Studies at the University of Michigan, Ann Arbor. ProCite was published in 1983 by Personal Bibliographic Software of Ann Arbor, Michigan.[1][2] In 1996, ProCite was purchased by the Institute for Scientific Information, a division of Thomson Reuters.[3] Thomson Reuters discontinued sales and support of Procite in May 2013. [4] Source :wikipedia 8 8

Outils de gestion bibliographique 1 – Contexte d’utilisation Milieu et fin des années 80 Développement des accès au texte intégral Apparition des CD ROM en 1988 1989 : World Wide Web et développement des dispositifs de recherche et de navigation sur le web Du côté des LGR : 1988 : arrivée d’EndNote sur le marché, actuellement chez Thomson Reuters = 3e grand outil de gestion bibliographique avec Procite et Reference Manager Fonction principale : Constituer des bibliothèques de références interrogeables Annotation et indexation des références Premiers ordinateurs personnels : bull en 1973, PC-IBM en 1975, Apple I en 1977` ProCite, a commercial reference management software program, was designed in the early 1980s by Victor Rosenberg, associate professor in the School of Library and Information Studies at the University of Michigan, Ann Arbor. ProCite was published in 1983 by Personal Bibliographic Software of Ann Arbor, Michigan.[1][2] In 1996, ProCite was purchased by the Institute for Scientific Information, a division of Thomson Reuters.[3] Thomson Reuters discontinued sales and support of Procite in May 2013. [4] Source :wikipedia 9 9

Outils de gestion bibliographique 1 – Contexte d’utilisation Du côté des LGR : Import automatisé depuis les bases de données Interfaçage des LGR avec les traitements de texte Automatisation de la production bibliographique selon une norme appropriée devient un atout important des LGR Leaders : EndNote et Reference Manager D’autres outils : 1998 : Biblioscape Années 90 Essor des bases de données en texte intégral développement des portails de revues commerciales et en accès libre (movement de l’open access) 1998 : ScienceDirect 1991 : base de preprint ArXiv Revues en libre accès 1990 : Psycoloquy Premiers ordinateurs personnels : bull en 1973, PC-IBM en 1975, Apple I en 1977` ProCite, a commercial reference management software program, was designed in the early 1980s by Victor Rosenberg, associate professor in the School of Library and Information Studies at the University of Michigan, Ann Arbor. ProCite was published in 1983 by Personal Bibliographic Software of Ann Arbor, Michigan.[1][2] In 1996, ProCite was purchased by the Institute for Scientific Information, a division of Thomson Reuters.[3] Thomson Reuters discontinued sales and support of Procite in May 2013. [4] Source :wikipedia 10 10

Outils de gestion bibliographique 1 – Contexte d’utilisation Années 2000 Croissance du web Arrivée du Web « 2.0 » / web social : Plateformes de partage et folksonomies Blogs, wikis Réseaux sociaux Pour la recherche : ResearchGate et Academia.edu lancés en 2008 Développement des formats et des langages autour de l’information numériques XML, métadonnées Du côté des LGR : Développement des applications en ligne Apparition des logiciels open source « Bibliographic social bookmarking » Premiers ordinateurs personnels : bull en 1973, PC-IBM en 1975, Apple I en 1977` ProCite, a commercial reference management software program, was designed in the early 1980s by Victor Rosenberg, associate professor in the School of Library and Information Studies at the University of Michigan, Ann Arbor. ProCite was published in 1983 by Personal Bibliographic Software of Ann Arbor, Michigan.[1][2] In 1996, ProCite was purchased by the Institute for Scientific Information, a division of Thomson Reuters.[3] Thomson Reuters discontinued sales and support of Procite in May 2013. [4] Source :wikipedia 11 11

Outils de gestion bibliographique 2 – Définition et applications Un logiciel de gestion de références bibliographiques (LGR) permet de : Stocker Importer Gérer Exporter Éditer Ses références Partager Formater Diffuser 12

Outils de gestion bibliographique 2 – Définition et applications Stocker des références et / ou signets web issus d'une recherche documentaire (par saisie manuelle ou import automatisé) ou d’autres outils bibliographiques Classer, organiser et de gérer dans une base de données les références et la publication Formater les références selon un style de publication Générer automatiquement dans une publication scientifique les citations et la bibliographie ainsi formatées. Exporter le corpus de références, le publier sur le web et dans certains cas, partager ses références.

Outils de gestion bibliographique 2 – Définition et applications Atouts des LGR Pour le stockage et la gestion des références : facilités d’exploitation de gros corpus de références par la structuration en base de données Pour la publication : récupération des références lors de l’écriture d’un texte formatage automatique des références selon les normes d’écriture en vigueur saisie unique des données et choix d’un format d’édition Pour le suivi de la recherche documentaire : liens entre la recherche documentaire et la base personnelle

Outils de gestion bibliographique 2 – Définition et applications Plateformes en ligne : Partage des références et accès à sa bibliothèque en ligne « Capitalisation des connaissances » et réseau de chercheurs Gain du temps pour son travail de recherche.

Outils de gestion bibliographique 2 – Définition et applications Typologies des LGR : Libres ou propriétaires Gratuits ou commerciaux En ligne ou / et application à installer en local Outils individuels ou de partage Outils autonomes ou à forte intégration web ou outils à orientation plus bibliographique Outils orientés références bibliographiques ou outils intégrant références et signets Multiplateformes ou PC / Mac / Linux

Outils de gestion bibliographique 2 – Définition et applications Eléments constitutifs d’un logiciel bibliographique : « Grilles de saisie » regroupant dans des zones différenciées = champs, les éléments nécessaires à la description des documents cités description bibliographique mots clés sujet éventuellement notes de lecture Exemple d’une grille JabRef

Outils de gestion bibliographique 2 – Définition et applications Eléments constitutifs d’un logiciel bibliographique (suite) : Fonction de récupération automatique directe de références depuis des bases de données Exemple de Papers 18

Outils de gestion bibliographique 2 – Définition et applications Eléments constitutifs d’un logiciel bibliographique (suite) : Modules de récupération de références depuis des bases de données par : Filtres Fichiers de connexion Exemple des filtres Refworks

Outils de gestion bibliographique 2 – Définition et applications Eléments constitutifs d’un logiciel bibliographique (suite) : Gestion interne de la base Recherche dans la base Tri des références Modification des références … Exemple de recherche EndNote

Outils de gestion bibliographique 2 – Définition et applications Eléments constitutifs d’un logiciel bibliographique (suite) : Modèles d’édition des références conformes aux normes de publication Styles Exemple des styles Zotero

Outils de gestion bibliographique 2 – Définition et applications Eléments constitutifs d’un logiciel bibliographique (suite) : Éléments complémentaires : Gestion d’objets (images, graphiques, tableaux) Gestion du texte intégral Passerelles vers les traitements de texte Outils de partage des référence Aides à la saisie Possibilités d’annotation, de notes de lecture Fonctionnalités d’export de la base de références …

Outils de gestion bibliographique 3 – Panorama des outils Bookends Sente Papers BibDesk

Outils de gestion bibliographique 3 – Panorama des outils Essor des LGR : Carte « Tools for managing bibliographic data / information Refworks > commercial, en ligne (2001) BibDesk (2002) JabRef > open source (2003) Bibus > open source, local (2004) Wikindx > en ligne (2004) CiteUlike > en ligne, propriétaire, gratuit (2004) / Connotea > n’existe plus Sente (2004) > mac, en local… EndNote Web (2005) … Premiers ordinateurs personnels : bull en 1973, PC-IBM en 1975, Apple I en 1977` ProCite, a commercial reference management software program, was designed in the early 1980s by Victor Rosenberg, associate professor in the School of Library and Information Studies at the University of Michigan, Ann Arbor. ProCite was published in 1983 by Personal Bibliographic Software of Ann Arbor, Michigan.[1][2] In 1996, ProCite was purchased by the Institute for Scientific Information, a division of Thomson Reuters.[3] Thomson Reuters discontinued sales and support of Procite in May 2013. [4] Source :wikipedia 24 24

Outils de gestion bibliographique 3 – Panorama des outils Essor des LGR : 2006 : Apparition de nouveaux acteurs importants Zotero > open source, en local et en ligne En même temps que Zotero : Bibsonomy Citavi 2007 : 2collab > interrompu Papers 2008 : Wizfolio > en ligne Lancement et succès de Mendeley > en ligne et en local, propriétaire, racheté en suite par Elsevier, une version gratuite 2009 : La suite Docear pour la recherche (conjonction avec les fonctions des cartes heuristiques) > open source Premiers ordinateurs personnels : bull en 1973, PC-IBM en 1975, Apple I en 1977` ProCite, a commercial reference management software program, was designed in the early 1980s by Victor Rosenberg, associate professor in the School of Library and Information Studies at the University of Michigan, Ann Arbor. ProCite was published in 1983 by Personal Bibliographic Software of Ann Arbor, Michigan.[1][2] In 1996, ProCite was purchased by the Institute for Scientific Information, a division of Thomson Reuters.[3] Thomson Reuters discontinued sales and support of Procite in May 2013. [4] Source :wikipedia 25 25

Outils de gestion bibliographique 3 – Panorama des outils Un grand nombre de produits Développement permanent de nouveaux logiciels Evolution et multiplication des fonctions Interfaçage avec les traitements de texte Orientation web … Des outils multi-plateformes ou non

Outils de gestion bibliographique 3 – Panorama des outils Quelques logiciels professionnels (commerciaux) connus et utilisés : EndNote / EndNote Web http://endnote.com/ Papers http://www.mekentosj.com/papers/ RefWorks édité par Thomson Reuters Logiciel en ligne https://www.refworks.com/

Outils de gestion bibliographique 3 – Panorama des outils Quelques outils gratuits (références et / ou signets web) En ligne Bibsonomy CiteUlike WizFolio (version de base) BibMe Mixte Mendeley (version de bureau et serveur) Zotero (synchronisation des données en ligne) En local JabRef BibDesk (pour mac) Bibus

Outils de gestion bibliographique 3 – Panorama des outils Depuis 2010 Arrivée du web de données Open Data Linked Data Cloud Computing Du côté des LGR : Restructuration parmi les grands outils Thomson Reuters : Reference Manager et Procite interrompus, fusion de EndNote et EndNote Web , « Connect with EndNote) (2014) Nature Publishing Group : arrêt de Connotea (2011) Elsevier : arrêt de 2collab (2011), achat de Mendeley (2013) 29 29

Outils de gestion bibliographique 3 – Panorama des outils Développement constant de nouveaux outils Colwiz, Qikka (2010) ReadCube (2011) SciRef (2012) Flow (Proquest, 2013) Fonctionnalités Développement des fonctions autour de la gestion du texte intégral Fonctionnalités spécifiques : Colwiz intègre des outils de gestion de projet et de planning partagé, Qiqqa l’extraction des concepts, ReadCube la recommandation d’articles 30 30

Outils de gestion bibliographique 3 – Panorama des outils   Que peut-on comparer ? Les sources depuis lesquelles il est possible d'importer des références. Les styles disponibles pour formater automatiquement la bibliographie. La possibilité de créer ou d'adapter des modèles d'import, de publication. Les modalités d'interaction avec les traitements de texte. La prise en compte et la gestion du texte intégral pour le document référencé. Les possibilités de partage des références et leur gestion en ligne. Les possibilités d'export et d'échange avec d'autres outils bibliographiques.

Outils de gestion bibliographique 3 – Panorama des outils Reference Manager Overview, Martin Fenner, 19 septembre 2010. Licence CC : BY. Source : GOBBLEDYGOOK, PLoS BLOGS URFIST Rennes

Outils de gestion bibliographique 3 – Panorama des outils Evaluations comparatives Frédérique Cohen-Adad : Panorama des logiciels de gestion de références bibliographiques (mai 2016) http://urfist.enc.sorbonne.fr/sites/default/files/ab/CohenAdad_Panorama_logiciels_bibliographiques_2016.pdf « Comparison of reference management software » sur Wikipedia (dernière maj 20/01/2017) http://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_reference_management_software Comparaison de programmes de gestion de références / Bibliothèque Université Technique de Munich (juin 2015) https://mediatum.ub.tum.de/doc/1272837/1272837.pdf

Première découverte de quelques outils : Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Première découverte de quelques outils : Mendeley CiteUlike Bibsonomy Zotero Papers EndNote JabRef Qiqqa

Mendeley, http://www.mendeley.com/ Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Mendeley, http://www.mendeley.com/

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Installer Mendeley Desktop Créer son compte sur le site de Mendeley Installer Web Importer

Détail des références et notes Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Mendeley Desktop Barre d’outils Recherche Collections Détail des références et notes Liste des références Filtres

Bibliothèque Mendeley en ligne Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Bibliothèque Mendeley en ligne

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Importer des références depuis Google Scholar : Afficher les résultats de la requête Dans les favoris / signets, sélectionner Import to Mendeley Importer les références souhaités en cliquant sur « Import » On peut aussi importer à partir des PDF (Add Folder)

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Produire sa bibliographie Sélectionner un style : View > Citation style et glisser/déposer les références ou les copier

Citer en écrivant : plugin Word et Open Office / Libre Office Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Citer en écrivant : plugin Word et Open Office / Libre Office

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils / méthodologie CiteUlike http://www.citeulike.org/ créé en 2004 (Université de Manchester) + développements ultérieurs Gestion de références en ligne gratuite (sur inscription) Sauvegarde, recherche, et partage de références d’articles dans des bibliothèques personnelles ou de groupes Fils RSS pour mettre en place une veille sur un thème + Watchlist Accès direct aux 13 508 revues auxquelles CiteUlike est abonné Export vers Zotero possible

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie CiteUlike

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie 3 modes d’intégration des références : Intégration automatisée par bookmarklet à intégrer dans le navigateur Intégration semi-automatisée en copiant l’URL dans CiteUlike Intégration manuelle Sources diverses : Sites d’éditeurs commerciaux (ex: Elsevier, Springer) Agrégateurs (ex: Ingenta, JSTOR) Archives ouvertes (ex: ArXiv) Librairies (ex: Amazon) Faiblesses Ne sait pas intégrer un lot de références Google Scholar : inégal même avec le bookmarklet avancé Ne marche pas pour les catalogues de bibliothèque Springer Link : ne marche pas toujours avec les chapitres de ebooks Ne gère pas la collection en sous collection Tri pas possible par tag

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Créer un compte Dans le menu principal : Browser button Ajouter le bouton : « Post to CiteUlike » ou « Advanced bookmarklet » A partir de la page d’accueil, onglet CiteUlike choisir Browser Button Intégrer le bouton avancé : advanced bookmarklet Voir en bas de cette page les sites compatibles Please note we can only find articles from peer-reviewed journals

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Le bouton « Post to CiteUlike » ajoute la référence à la bibliothèque personnelle Faire un exercice avec une référence à partir de Springer link ou Science direct Montrer mode semi-automatique Post an URL et manuel Post manually Montrer la barre des tâches de My library : Search Export Sort Montrer une référence, et la possibilité de l’intégrer dans un traitement de texte My CiteUlike Portal : Montrer les fonctionnalités de partage Recommandations, Neighbours etc.

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Edition des références dans diverses normes : Harvard, Nature, Elsevier…

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Bibsonomy, http://www.bibsonomy.org (Université de Kassel, Allemagne) Signets Références

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Export des références selon le format APA

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Zotero

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Zotero Depuis octobre 2006 Andrew W. Mellon Foundation Center for History and New Media George Mason University Extension du navigateur Firefox + maintenant version autonome + serveur en ligne Logiciel libre et gratuit, à télecharger à partir du site http://www.zotero.org

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Principales fonctionnalités de Zotero Récupération de données et constitution de la base personnelle Références multiples / Référence par référence Intégration dans les « collections » de la bibliothèque personnelle Liste de sites compatibles (ScienceDirect, SUDOC, Google Scholar, PubMed …) > voir sur la page http://www.zotero.org/translators Capture de documents web (avec métadonnées) et lien au fichier web

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Saisie manuelle de références Gestion de la base personnelle Modification de références Recherche dans la base Tri des notices Ajout de notes de lecture Ajout de tags (marqueurs) Export de la bibliothèque de références Lien de deux notices Création d’une bibliographie À partir d’une collection donnée Formatage dans un style donné (styles par défaut + page Repository pour les styles : http://www.zotero.org/styles )

dans le traitement de texte Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Passerelle avec les traitements de texte Avec Word et Open/ Libre Office Choix d’un style Insertion de citations Création d’une bibliographie L’interface de Zotero : en 3 panneaux La bibliothèque et ses collections La liste des références d’une collection donnée Le détail de la référence sélectionnée + la barre d’action et le panneau des marqueurs Barre d’outils Zotero dans le traitement de texte

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie EndNote, http://www.endnote.com Outil commercial, professionnel Outil en local (+ un module Web lié au Web of Science) Édité par Thomson Reuters) Fournisseur français : Ritme, http://www.ritme.com Les atouts d’EndNote Les ressources : nombreux styles, filtres… L’annotation des PDF La modification par l’utilisateur (des styles, des paramétrages, etc.)

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Principales fonctionnalités d’EndNote Recherche documentaire et constitution de la base : Connexion directe à des bases de données distantes Intégration automatique de références sous EndNote à partir des interfaces de recherche de bases de données Import des fichiers de résultats issus de bases de données via des filtres d’import Récupération de bibliographies rédigées avec un traitement de texte Récupération de bases élaborées sous d’autres logiciels bibliographiques

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie L’organisation et l’exploitation de la documentation personnelle : Gestion des fichiers de références bibliographiques organisés au sein de bases de données, permettant : La saisie manuelle de références (aides à la saisie) et l’intégration d’objets (tableaux, graphiques); l’import de références Le lien au texte intégral / gestion du texte intégral La modification et la mise à jour des références La recherche dans les références Le formatage bibliographique des références L’export des données sous d’autres formats

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie La rédaction et la publication scientifiques : Interface directe avec le traitement de texte Word et Open Office / Libre Office, permettant : de créer des citations dans le texte en cours de rédaction de générer une bibliographie, soit à la suite de l’article rédigé, soit indépendamment de tout texte (possibilité aussi de générer la liste des tableaux, etc.) de choisir un format d’édition déterminé = style (correspondant aux normes de présentation bibliographique des revues scientifiques)

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie présence d’une image EndNote Groupes de références référence Pour voir une référence dans un style donné Nombre de références affichées sur nombre total

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Colwiz, https://www.colwiz.com/ Elaboré par des chercheurs de l’Université d’Oxford / start-up colwiz Plateforme en ligne + outil local (à installer); fonction de synchronisation Gratuit Import et gestion de références (bases de données et web), outils de collaboration et réseau; intégration du PDF Plugin pour traitements de texte (Word, Libre Office, Open office, LaTex, Google Docs) Plus de 6500 styles de citation

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie En local

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie En ligne

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Import de références à partir de l’interface locale Sélection de ressources interrogeables

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Les paramètres de styles montrent les styles directement utilisables et un ensemble de styles à ajouter (répertoire de styles CSL)

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Configuration de l’application avec le traitement de texte de son choix par le biais d’un plugin, pour citer et générer la bibliographie

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Qiqqa 66 66

Autres exemples : JabRef Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Autres exemples : JabRef Qu’est-ce que JabRef ? Application écrite en Java, utilisant nativement le format Bibtex pour enregistrer ses données Outil gratuit et OpenSource (Licence GPL) Aides sur JabRef : http://jabref.sourceforge.net/help/fr/Contents.php Présentation de Marc Bailly-Bechet, http://pbil.univ-lyon1.fr/members/mbailly/Comm_Scientifique/M1/jabref.pdf 67

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Principales fonctionnalités de JabRef Saisie des données dans les champs existant dans BibTeX (Ajout possible des champs personnalisés, génération automatique des clés BibTeX, groupement des entrées, gestion partielle des autorités) Fonctions de recherche Recherche par mots-clés Surlignage de certaines entrées Recherche par groupes / sous-groupes URFIST Rennes 68

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Imports de données dans JabRef : Dans les formats suivants : BibTeXML, Biblioscape, Biomail, CSA, INSPEC, ISI, JStor (tabulations), Medline, Ovid, REPEC (New Economic Paper), RIS, Refer/EndNote, Scifinder, SilverPlatter, Sixpack Bases : Web of Science (ISI), ScienceDirect et EconLit (RIS), CAB, Francis (SilverPlatter), EndNote (RIS) Option Fetch : recherche sur serveurs distants pour les bases Medline, CiteSeer URFIST Rennes 69

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie JabRef : Gestion du lien vers le texte intégral depuis la référence (pdf, ps, url, doi) Export : html, BibTeXML, Harvard RTF, EndNote… Citations : Liens vers éditeurs LaTeX Automatisation de l’attribution d’une étiquette BibTeX de type AuteurDate (icône baguette magique) Insertion de la référence à citer dans un fichier Latex par CTRL-K / CTRL-V {\citeToto2005} Option « Push selection » to WinEdt (éditeur LateX) Vers Word : option « copier la clé bibtex » par clic droit sur les références sélectionnées URFIST Rennes 70

Créer une base de références Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie JabRef Créer une base de références Import de données Fonctions d’export URFIST Rennes 71

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie WizFolio http://wizfolio.com/ Outil de gestion de références en ligne Version de base gratuite = 100 mb ou 200 références Toutes les fonctionnalités propres à un logiciel de gestion de références bibliographiques Récupération de références à la volée (référence par référence) Localisation du texte intégral (PDF) Intégration avec Word / Windows 68 styles bibliographiques Partage des références 72

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie WizFolio Web 2.0, http://wizfolio.com/ Boutons : WizAdd pour importer facilement des références WizCite pour citer facilement des références URFIST Rennes 73

Papers, http://www.mekentosj.com/papers/ Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie Papers, http://www.mekentosj.com/papers/ Logiciel acquis par Springer en novembre 2012 Application payante Initialement Mac, développement d’une version windows Sources d’import accessibles sous Papers Interfaçage avec les traitements de texte, les présentations… Partage avec Lifve 74

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie

Outils de gestion bibliographique 4 - Présentation de quelques outils /méthodologie L’interface de Papers

Quelques ressources Regards sur les logiciels bibliographiques, journée d’étude, Villeurbanne, 17 novembre 2014 Guides Form@doct sur la gestion de références bibliographiques Panorama des logiciels de gestion de références bibliographiques, Frédérique Cohen-Adad (2016)