BEAUCOUP de gènes et PEU d’épistasie Modèle additif multi-locus
Les expériences de réponse à long terme à la sélection « Illinois Long Term Selection Corn Experiment » Dudley & lambert, 1992.
Le polymorphisme permettant une réponse soutenue à la sélection est: Infini (modèle infinitésimal) Caché (linkage) Régénéré régulièrement (mutations)
Les modèles de réponse à long terme à la sélection Fisher, 1930 Hill, 1982 Weber and Diggins, 1990 Lynch and Walsh, 200x Modèle infinitésimal populations infinies + mutations Réponse à la sélection Yoo, 1980 + dérive génétique Robertson, 1960 Bulmer, 1971 Chevalet, 1988 + linkage Générations (D’après les données de Yoo, 1980)
Le polymorphisme est caché (linkage) Comment est structuré le polymorphisme sélectionné le long du génome ? Réserve de polymorphisme dans des segments à forte densité de gènes ? à court terme / dans une population ? à long terme ? Thèse Emmanuelle Della-Chiesa
Effet Bulmer (1971) P=seuil sélection P= G + E = iXi + E P=X1+X2 Cov(X1,X2)<0 X1 P= G + E = iXi + E Var(G) = i Var(Xi) + ij Cov(Xi , Xj) Var(G) = Vg + C (C<0) La variance disponible pour la sélection est réduite
Déséquilibre de liaison entre paires de locus « moins fortement » négatif entre locus éloignés « fortement » négatif entre locus proches
Effet Hill-Robertson (1966) Dérive génétique + Liaison + Sélection des allèles favorables Augmentation de la probabilité de fixation des allèles défavorables
La recombinaison restaure la variance « cachée » mutation ? Hospital & Chevalet, Genetical Research, 1996.
Répartition aléatoire du polymorphisme Distances entre locus Répartition aléatoire du polymorphisme Répartition observée sous sélection t=50 t=50 AVEC MUTATION SANS MUTATION t=200 t=200 Indice d’agrégation au cours du temps
Structuration du polymorphisme sélectionné A court terme, agrégation transitoire du polymorphisme dans une population Importance en sélection artificielle (SAM) Faible impact sur le maintien du polymorphisme avec mutation-sélection Fixations successives de mutations +/- indépendantes Effets sur la divergence entre populations ?
Impact de l’histoire sélective des populations sur l’architecture apparente des caractères quantitatifs population Lignée H’ Lignée H Lignée L sélection Croisement Détection QTL Divergence entre lignées HH’: