Aide mémoire sur l’utilisation du Code

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Transcription de la présentation:

Aide mémoire sur l’utilisation du Code CA.S.T.E.P

{-(1/2) ∆+ Vext(r)+ VH(r)+Vxc(r)}φiKS=εiφiKS(r) Méthode de Calcul L’équation de Schrödinger indépendante du temps permet de calculer les états stationnaires et les énergies de ces états. Il a été montré que parmi les solutions de cette équation, il existe une énergie minimale, à laquelle est associé l’état fondamental. En 1965, Kohn et Sham ont proposé une approximation de cette fonctionnelle, permettant l’application à des cas pratiques. {-(1/2) ∆+ Vext(r)+ VH(r)+Vxc(r)}φiKS=εiφiKS(r) (2) Les bases d’ondes planes utilisent la même résolution dans chaque région de l’espace de sorte que pour décrire à la fois les cœurs ioniques et les états électroniques partiellement localisés autour d’eux, le nombre de vecteurs k nécessaires serait relativement prohibitif pour mener à bien la résolution des équations de Kohn-Sham. Η.Ψ = Ε.Ψ (1) En 1964, Hohenberg et Kohn ont montré que pour un système dans son état fondamental, il existe une relation bi-univoque entre la densité électronique ρ et le potentiel extérieur. La méthode des pseudopotentiels repose sur l’hypothèse que les propriétés physiques et chimiques d’un système sont essentiellement gouvernées par les électrons de valence (les électrons les plus externes) tandis que les cœurs ioniques peuvent être considérés comme étant « gelés » dans leurs configurations atomiques. La méthode des pseudopotentiels consiste ainsi à ne traiter explicitement que les électrons de valence. L'état fondamental électronique et son énergie sont entièrement déterminés par une fonction de trois variables (la densité ρ(x,y,z)) alors que dans le formalisme de Schrödinger de l'équation (1) la fonction d'onde inconnue dépend de 3Ne variables.

Construction d’un projet de calcul

Lancement du programme Matériaux studio et nommé le projet de calcul sous le nom du composé que l’on désire à calculer Le nom du projet Par exemple BiInO3

Une click droite de la sourie New 3D Atomistic Document Une fois que le document 3d apparaisse L’étape d’introduire notre input

Build crystal Appuyer sur Build Crystals

Choisir le groupe d’espace adéquat pour votre composé (cubic perovskite # 221) Build Crystal Space group Les sept systèmes du Bravais

Injecter les paramètres de maille « lattice parameters » À partir d’une référence par exemple physical review B 75, 245209(2007) Pour chaque type de réseau de Bravais Hexagonal, tetragonal, orthorhombique…..

Une fois que le réseau cubique apparaisse Cliquer sur build Add Atoms

Cliquer sur Element Periodic Table Cliquer ici Pour obtenir Tableau Périodique

Sélectionner les éléments du composé un par un et introduire leurs positions dans le réseau cristallin.

Clique droite Display style pour rendre les atomes sous forme sphérique

Display style CPK ou Poyhedron ou bien Ball and Stick en même temps vous pouvez choisir les options pour Lattice.

Pour nommer les atomes ou bien une tache voulue clique droite Label

Plusieurs propriétés affichées soit ce qui concerne « Atom » ou bien « Bond »

Comment lancer un calcul utilisant le code CASTEP.

Modules CASTEP Calculation

Task geometry optimization Minimizer coucher optimize cell

Task geometry optimization more et choisir l’algorithme voulu

Cette tache nous permet de introduire la valeur du pression hydrostatique La pression Est un tenseur Injecter directement La valeur voulue ici

Pseudo- potentiel

« Energy cut-off » « K-points » selon le cas Pour des résultats d’haute performances personnaliser quelques paramètres « Energy cut-off » « K-points » selon le cas

Appuyer sur « Run » pour demarer la procédure du calcul Faire associer tous les processeurs de votre machine pour accélérer le calcul. Appuyer sur « Run » pour demarer la procédure du calcul .

Le programme en état de calcul

Étape du calcul est terminée, cliquer sur « OK »

Output du programme

3D Atomisticdocument.xsd optimisé

Calcul des propriétés électronique et optique

Une fois que le calcul d’optimisation géométrique est termine, on lance notre calcul des propretés à partir du fichier « 3D Atomistic Document.xsd »

Tache est active sur « Properties »

Coucher les propriétés à calculer « Properties »

Vous pouvez optimiser les paramètres pour Le calcul du TDOS et PDOS

Vous pouvez optimiser les paramètres pour Le calcul du propriétés optique

Introduire le chiffre qui est relatif aux paramètres du réseau cristallin

Fin du calcul du propriétés Cliquer sur « OK »

Pour les propriétés électroniques et optiques Analyse des résultats Pour les propriétés électroniques et optiques

L’analyse s’effectue à partir du 3D Atomistic document.xsd optimisé

Analyse des Propriétés électronique Cliquer sur « view » pour visualiser Le spectre énergétique du « band structure »

Clique droite sur le spectre « copy » Ouvrir un fichier origine « coller le sur une fenêtre data worksheet

Cliquer sur « view » pour visualiser le spectre TDOS

Clique droite sur le spectre « copy » Ouvrir un fichier origine « coller le sur un fenêtre data worksheet

« view » pour obtenir le spectre PDOS « Bi » Cliquer sur « view » pour obtenir le spectre PDOS « Bi »

Clique droite sur le spectre « copy » Ouvrir un fichier origine « coller le sur un fenêtre data workcheet NB: on deux variables sur l’axe x.

« Import» pour voir la densité de charge sous forme 3D Cliquer sur « save » pour saufgarder le fichier dont l’extension charge_Frm

Une fois que le fichier est enregistré, cliquer sur la densité en 3D est la supprimée

NB: chercher sur le fichier charge_Frm dans le projet de calcul et projeter le sur un plan bien défini à l’aide d’un programme « Fortran…… »

Analyse des Propriétés optique Polycrystalline; Unpolarised Polarised along direction Sélectionner le paramètre optique à étudier

Appuyer sur « calculate » puis sur « view » pour visualiser le spectre de la grandeur optique voulue, par exemple « Adsorption »

Clique droite sur le spectre « copy » et le coller dans une fenêtre d’origine « data »

Calcul des constants élastiques « Propriétés élastique » 3D Atomisticdocument.xsd optimisé

Le programme en état de calcul

Analyse des constants élastiques Fin de calcul Des Cij

Appuyer sur « calculation » Output des Cij Est activée

« Propriétés Thermodynamique » Faire une optimisation géométrique autour du 0GPa avec un pas de 2,5 GPa Pour des pressions positives et négatives. Tabuler les énergies et les volumes Obtenus de la maille E(V) dans un document de texte . À l’aide d’un programme (Code) Gibbs dont le modèle de Debye implémenté