RESISTANCE BACTERIENNE AU SENEGAL Pr Cheikh Saad Bouh BOYE Unité de Recherche et de Biotechnologie Microbienne /Bactériologie-Virologie FMPOS/UCAD/DAKAR

. Fréquence des Infections OBJECTIFS . Fréquence des Infections . Surveillance de la Résistance . Efficacité thérapeutique

PALM EGEM INSPEAR OBSAIRV BASKETT INSPIRATION DEMARCHE QUALITE

Isolement Bactérien Coloration Cytologie Flore bactérienne - Isolement , Identification - Etude de la Sensibilite( ABG , CMI… ) - Contrôle Qualité ( Références ATCC )

SOUCHES COMMUNAUTAIRES DEMARCHE QUALITE

IRBC IRH ( OTITES ET SINUSITES AIGUES) Streptococcus pneumoniae Haemophilus influenzae , Moraxella catarrhalis Bactéries Atypiques à Dakar ( SENEGAL) ( 1996-2007) IRBC IRH ( OTITES ET SINUSITES AIGUES) Unité de Recherche et de Biotechnologie Microbienne /Bactériologie-Virologie FMPOS/UCAD/DAKAR

Observatoire Sénégalais pour l ’Antibiothérapie dans les Infections Respiratoires de Ville PROJET OBSAIRV

ETIOLOGIE BACTERIENNE CAP Bacteries atypiques: Legionella spp Chlamydia spp Mycoplasma spp S. pneumoniae 22% 34% 6% S. aureus 15% 15% Autres 8% H. influenzae et M. catarrhalis BGN 20/11/2018 1

(OMA) (n = 113 souches) Enfants n= 63 souches Adultes n= 50 souches Autres Autres Haemophilus Haemophilus Moraxella Moraxella S.pneumoniae S.pneumoniae Enfants n= 63 souches Adultes n= 50 souches

(Sinusites Aigues) (n = 66 souches) Autres Autres Haemophilus Moraxella Haemophilus Moraxella S.pneumoniae S.pneumoniae Adultes n= 24 souches Enfants n= 42 souches

Profil des Souches isolées % % Afrique % Monde S.pneumoniae (DRSP) 32 15-50 > 50 S.pneumoniae (DSSP) 68 H.influenzae (Ampi S) H.influenzae(AmpiR/BL+ 26 25-40 30-80 H.influenzae(Ampi R/BL- 02 1-5 2-4 M.catarrhalis ( BL+) 70 70-90 M.catarrhalis ( BL-) 30

Profil des Souches isolées % IRB IRH S.pneumoniae (DRSP) 32 23 35 S.pneumoniae (DSSP) 68 H.influenzae (Ampi S) 72 H.influenzae(AmpiR/BL+ 26 28 H.influenzae(Ampi R/BL- 02 M.catarrhalis ( BL+) 70 75 M.catarrhalis ( BL-) 30

Beta Lactamines

Penicillin-nonsusceptible S. pneumoniae Penicillin-intermediate (MIC 0.12–1 µg/mL) Penicillin-resistant (MIC ³ 2 µg/mL) Rwanda 21.0% 0.0% Tunisia 24.0% 11.0% Algeria 11.4% 5.7% Senegal 2% 30% Ghana 17.0% 0.0% Egypt 29.1% 0.0% Zambia 14% 0.0% Zimbabwe 7% Botswana 25% 0.0% Ethiopia 17% 0.0% Kenya 41.2% 1.8% Namibia 21% 9% South Africa 20.9% 51.0% INSPIRATION , BASKETT

Streptococcus pneumoniae

S.pneumoniae ATB PSSP(68%) PISP(30%) PRSP(2%) AminoPeni S S(60%) R AminoP+Inhib S(98%) CSP1,2,3 S(93%) Macrolides S(87%) Tetracycline R(72%) Vancomycin

Macrolides

Macrolide-resistant S. pneumoniae Tunisia 28.0% Algeria 21.7% Egypt 2.5% Senegal 4% Erythromycin-resistant (MIC ³ 1 µg/mL) South Africa 52.7% INSPIRATION , BASKETT

Haemophilus influenzae Important pathogène dans IRA Plus de 30% -lactamase positive4 Haemophilus influenzae

Haemophilus influenzae β-lactams

Haemophilus influenzae

M. catarrhalis H. influenzae S. pneumoniae Senegal. Antimicrobial Resistance Trends Among Respiratory Tract Pathogens Resistance mechanism: Beta-lactamase Altered PBPs M. catarrhalis H. influenzae S. pneumoniae 20/11/2018

M.catarrhalis ATB BL+ ( 70%) BL-(30%) Aminopenicilline R S AminoP+Inhib CEFADROXIL CSP2,3 Macrolides Tetracycline

SOUCHES HOSPITALIERES 1996-2007

Staphylocoques Streptocoques Enterocoques Entrobactéries Autres BGN

INFECTIONS NOSOCOMIALES Bactériémies : ……………………………15% Pneumonie post ventilation :…………… 21% Infection urinaire (UTI) : …………………38% Infection respiratoire basse : ……………..4% Infections gastro intestinales , cutanées, cardiovasculaires : ………………………10% Infections du site opératoire : …………..10% Infections respiratoires hautes : ………….2%

INFECTIONS URINAIRES Enterobactéries : …………….50% GNNF : ……………………….35% Enterocoques : ……………...10% Autres : ……………………….5%

BACTERIEMIES NOSOCOMIALES Enterobacteries : ………………..50% Enterocoques : ………………….11% Staphylococcus aureus : ………12% Staphylocoques CN : …………..10% Pseudomonas : ………………….11% Acinetobacter : …………………...5% Autres : ……………………………1%

INFECTIONS DU SITE OPERATOIRE S aureus : ………………………………20% Pseudomonas : ………………………..16% Staphylocoques CN : ………………….15% Enterobacteries : ……………………… 25 Enterocoques: ………………………….12 Autres BGN : …………………………...12

SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES

Staphylococcus aureus ATB MehiR 43%) Methi S(57%) Aminopenicilline R S AminoP+Inhib CSP2,3 Macrolides Tetracycline Aminosides S/R

Streptocoques ATB Enterococcus(84) Streptococcus(359) Aminopenicilline AminoP+Inhib S(72%) CSP1,2,3 S( 76%) Macrolides Tetracycline

Klebsiella pneumoniae ATB Souches Klebsielles Béta-lactamines Aminosides Quinolones Cotrimoxazole Sauvages (12%) S R PHN ( 22%) MS BLSE (63%)

Pseudomonas aeruginosa ATB Souches Béta- lactamines Aminosides Quinolones Sulfa- triméto Sauvages (40%) R S Pénicillinase Haut niveau (28%) Céphalosporinase (16%) R/MS

SOUCHES ENTEROPATHOGENES 1999-2007

Données sur les bactéries entéropathogènes: Tendances et Antibiorésistance Les données sur les les bactéries entéropathogènes proviennent du Centre National Sénégalais des Entérobactéries (CNSE) sis à l’Institut Pasteur de Dakar. Missions du CNSE: Assurer pour l’ensemble des structures sanitaires du Sénégal l’identification complète et l’antibiogramme des souches d’entérobactéries, en particulier les salmonelles et les shigelles, Suivre l’évolution épidémiologique des souches et de leur résistance aux antimicrobiens

Salmonella: Entre 1999 et 2007, le CNSE a collecté 1426 souches de salmonelles dont 985 d’origine humaine et 441 d’origine alimentaire.Quatre nouveaux sérotypes ont été identifiés : Salmonella Keurmassar, Salmonella Ketiabargny, Salmonella Yombesali, Salmonella Yagounasally. Tous ces nouveaux sérotypes ont été isolés exclusivement de l’alimentation, à l’exception de Salmonella Keurmassar présent également dans des prélèvements d’origine humaine.

Grande sensibilité des souches aux antibiotiques testés. Cependant des résistances inquiétantes ont été notées chez les souches de Salmonella Agona, Kentucky et Keurmassar  isolées d’aliments: production d’une BLSE : le typage moléculaire a révélé la circulation au Sénégal de BLSE de type CTX-M15, SHV-12 d’intégrons: éléments génétiques mobiles porteurs de facteurs de résistance et capables de les disséminer au sein du monde bactérien et portant des cassettes. Des intégrons de classe 1 ont été détectés chez S. Keurmassar avec des cassettes codant la résistance à la streptomycine (gènes de résistance aadA) et la cassette codant la codant la résistance à l’érythromycine (gène de résistance ereA2), une macrolide largement utilisée en antibioprophylaxie dans les élevages de poulets de chair au Sénégal.

Shigella: Entre 1999 et 2007, le CNSE a reçu 538 souches de shigelles, toute d’origine humaine.La tendance au niveau des sérotypes montre un recul de flexneri . Le sérotype sonnei prend la place de leader. L’épidémiologie de la résistance aux antibiotiques est caractérisée par une résistance importante vis-à-vis des cyclines et du cotrimoxazole, pour l’ensemble des espèces et une circulation de souches avec une diminution de la sensibilité aux quinolones.

Merci de votre attention