Exemple d’un activateur transcriptionnel

Slides:



Advertisements
Présentations similaires
Dr Christophe BURUCOA Laboratoire de Microbiologie A CHU Poitiers
Advertisements

M2 Microbiologie fondamentale et appliquée
GÉNÉTIQUE BACTÉRIENNE
La synthèse des protéines
La génétique bactérienne cours 5
Protéine fonctionnelle
I. Support et organisation de l'IG II. Méca
Control of Hoxd Genes’ Collinearity during Early Limb Development
Interactions entre les voies notch et wnt
LAHMAR Qods SAID ALI Bahia
Répresseur de la transcription
Modalités de contrôle post-transcriptionnel cytoplasmique
TD – RFO Plantes hyperaccumulatrices de métaux lourds
CHMI 2227F Biochimie I Enzymes: Régulation
Contrôle de l’expression des gènes procaryotes
ADN.
Erratum suite à mon retard
Licence professionnelle de Génomique
Caractérisation structurale d ’un régulateur transcriptionnel du « Quorum Sensing » chez Brucella abortus.
INTERACTION LIGAND RECEPTEURS
La Régulation génétique chez les Procaryotes
Etude histologique, cellulaire et moléculaire de la régénération
Biochimie de la transduction des signaux cellulaires
BICH 6423 Mécanisme et régulation de l’activité des macromolécules
Mardi 23 janvier 2007 LE CYCLE CELLULAIRE.
LA TRANSCRIPTION DE L’ADN CHEZ LES PROCARYOTES
L’expression génétique
Bi 231: Ingénierie des Protéines
COMMUNICATION INTERCELLULAIRE RECEPTEURS MEDIATEURS
Chapitre 17: La glycolyse
LA SYNTHÈSE DES PROTÉINES
Laboratoire de Microbiologie et Biologie Moléculaire
Exemples de contrôle de voies métaboliques
Les bactéries Gram négatives possèdent plusieurs systèmes pour transférer le matériel génétique. L’un de ces mécanismes est le système de conjugaison.
LA SYNTHÈSE DES PROTÉINES
LA REGULATION DE L’EXPRESSION DES GENES
G protein coupled receptors Tout ce qu’on oublie, tout ce qu’on vous cache au sujet des GPCRs...
TD N°3: MUTATIONS DE L’OPERON LACTOSE & TRYPTOPHANE
La régulation des gènes et un peu plus
Chapitre 2 : l’expression du patrimoine génétique
Induction de l’expression de la frataxine avec des protéines TALEs ciblant son promoteur Dr. Jacques P. Tremblay Université Laval Québec., Canada.
Module 2 Biologie cellulaire, ADN et protéines
Co-expression = fonction (Eisen et al., PNAS 1998)
LES TONICARDIAQUES DIGITALIQUES
Métabolisme du glucose et lactose
Régulation de l’expression des gènes
Les subtélomères des chromosomes des hémiascomycètes Nantes, octobre 2006 Cécile Fairhead Génétique Moléculaire des Levures Institut Pasteur, Paris.
Voies de transduction du signal (1)
Transmission de l’information
Protéine.
Étude de la régulation des protéines Rho3 et Rho4: recherche des kinases responsables de la phosphorylation de la RhoGAP Rgd1 chez la levure Saccharomyces.
Gène Séquence d'acides nucléïques contenant une information codée pour la production régulée d'un ARN (transcription), ce dernier pouvant être traduit.
Métabolisme du glycogène (Harper : )
Régulation du Cycle Cellulaire
Héritier Fabienne Pirard Nathalie Belvoix Véronique
LA RÉGULATION DES GÈNES
Aspects techniques des biotechnologies
Chapitre 2 : La nature du vivant.
REGULATION DE L’EXPRESSION DES GENES
Régulation de l’expression génétique: Régulation procaryotes
Régulation de l’expression génétique: la transcription
TD-2 régulation de l’expression génique
Aspects techniques des biotechnologies
répresseur-inducteur Régulation de l ’initiation de la transcription chez les procaryotes promoteur Gène régulateur opérateur Gènes de structure 5 ’
ULBI 101 Biologie Cellulaire L1 Le Système Membranaire Interne.
RASAHOLIARISON Nomena Interne 1 er semestre en Neurologie USFR Neurologie CHU-JRB FACULTE DE MEDECINE UNIVERSITE D’ANTANANARIVO Cours du 01 avril 2015.
Chapitre 2 2ème partie Transcription et traduction titre.
ADN : Acide désoxyribonucléique Santatra Ratsitohara RAZAFINDRASATA Interne des hôpitaux en Neurologie 1 er semestre – USFR Neurologie CHU/JRB FACULTE.
Cytokines M. Alessandra Rosenthal-Allieri – décembre 2011.
Transcription de la présentation:

Exemple d’un activateur transcriptionnel La protéine CRP Activateur = ???

Changement de conformation Mécanismes simples Taux de transcription Changement de conformation -10 -35 a aN b b’ s 4 Classe I b’ -10 -35 a aN b s 4 Classe II CRP s 4 aN a Busby and Savery ENCYCLOPEDIA OF LIFE SCIENCES & 2007, John Wiley & Sons, Ltd. www.els.net p1-9

Nbrx promoteurs incluant Plac, Pgal, Para, Pmal - AMPc CRP + La protéine CRP cAMP receptor protein = CAP (catabolite gene activating protein) Chez E. coli Nbrx promoteurs incluant Plac, Pgal, Para, Pmal - AMPc CRP + - CRP Certains promoteurs/Pcrp, Pcya ADN N HTH C AMPc 209aa -

Les promoteurs cibles AAATGTGATCTAGATCACATTT 22pb Interactions ARNpol Angle ~ 90o

Liaison coopérative sur ADN Classe I AR2 AR1 ADN N HTH C AR3 Plac -61,5 a AR1 aval Affinité ADN Liaison coopérative sur ADN Busby and Savery ENCYCLOPEDIA OF LIFE SCIENCES & 2007, John Wiley & Sons, Ltd. www.els.net p1-9

aCTD effet inhibiteur : neutralisation Classe II AR1 AR2 AR3 ADN N HTH C Pgal -41,5 a s Busby and Savery ENCYCLOPEDIA OF LIFE SCIENCES & 2007, John Wiley & Sons, Ltd. www.els.net p1-9 1)Fixation AR1 amont aCTD effet inhibiteur : neutralisation (D aCTD AR1non nécessité) Quelle(s) manips: Hyp aCTD mal positionnné, CRP corrige????? 2) Activation AR2 aval 3 aa+ aNTD 4 aa - Facilite isomérisation AR3 aval Stabilisation ARNpol et facilite isomérisation

Classe III Plusieurs sites a s 2 classe I classe I + classe II -61,5 -91,5 -41,5 2 classe I classe I + classe II Synergie des CRP Activation D’après Busby and Savery ENCYCLOPEDIA OF LIFE SCIENCES & 2007, John Wiley & Sons, Ltd. www.els.net p1-9

Certains promoteurs/Pcrp, Pcya Répression par CRP CRP Certains promoteurs/Pcrp, Pcya -Autorégulation CRP ARNpol crp ARNpol -deoP Métabolisme des pyrimidines +cytidine CRP activateur -cytidine CRP permet fixation du répresseur CytR

Répression catabolique; Carbon catabolite repression=CCR -1940 J. Monod: croissance d’E. coli + mélange sucres ??? Ce phénomène a été appelé ??? Chez E. coli -Niveau AMPc régulé par système de transport des sucres: PTS, qui contrôle activité AC PTS= sugar Phosphotransferase system PEP sucre P Mb -Ce système nécessite EI et HPr protéines générales EII sucre-spécifiques: 3 à 4 domaines IIA et IIB Autres domaines P transfert Passage membrane

Le système PTS CRP activation Opérons cataboliques Inducteur exclusion LacY GlpK AC -Glu Inducteur exclusion GlpK=Glycérol Kinase LacY=lactose perméase AC=adénylate cyclase CM=cell membrane PEP=phosphoénol pyruvate D’après Stülke et Hillen Current opinion in Microbiology 1999 vol 2 p 195_201

Rappels: Régulation opéron lactose lacI lacZ lacY lacA En présence ou absence de quel(s) sucre(s)???? +Lac -Glu Allolac + inactif AMPc CRP active 1)+Glu ou +Lac ou +Glu+Lac 2) AMPc idem CRP* active +Glu+Lac pas expression Qui de CRP-AMPc ou exclusion de l’inducteur est le principal responsable du phénotype Glu répression???

CCR chez B. subtilis et bactéries apparentées (G+, low GC) PEP sucre P Mb Le composant central du PTS HPr EI (His-15) -2 sites de phosphorylation Hpr kinase (Ser-46) PtsK Régulation Importance de Phosphorylation de Hpr dans CCR

PTS chez B. subtilis Induc gly meta Glycérol-3-P -Glu +Glu 1 2 GlpK Reg spé -Glu +Glu 2 Reg spé= Régulateurs spécifiques contenant un PTS reg domain=PRD Exp: levR (levanase), licT (b-glucoside) D’après Stülke et Hillen Current opinion in Microbiology 1999 vol 2 p 195_201

Répresseur de la famille LacI Le répresseur CcpA -CcpA Répresseur de la famille LacI -Promoteurs cibles Séquence cre : catabolite responsive element Localisation: -dans promoteur(exp amyE) -dans seq codante (exp xyl) -en amont des promoteurs (exp lev) CCR médiée par CcpA -Interaction spécifique CcpA/Hpr-S46-P Fixation sur cre Expériences?????? Complexe ternaire CcpA2 / 2Hpr-S46-P /cre -Crh = Hpr-like proteine Crh-Ser46 par PtsK mais 0 P par EI

Deux mécanismes différents pour CCR enteric bactéries/G+low G+C E. coli B. subtilis Conclusions 1 CRP activation Opérons cataboliques LacY GlpK AC -Glu Inducteur exclusion GlpK Reg spé -Glu +Glu -Glu Repression des opérons cataboliques Deux mécanismes différents pour CCR enteric bactéries/G+low G+C Gènes codant Hpr et Hpr kinase chez G- non enteriques CCR? Dans tous les cas Rôle important de la P dans régulation au sens large

Conclusions 2 Régulation transcriptionnelle avec comme point de départ CRP -Protéine: fonction et structure -Interaction avec autres macromolécules -Etude des cibles -Physiologie Quelles techniques????