CONTEXTE THÉORIQUE DE L'AMR MATÉRIEL DE FORMATION

Ordre des Enterobacteriales (anciennement « famille des Enterobacteriaceae ») « Bactéries de l'intestin » : E. coli, Klebsiella (Raoultella), Enterobacter, Proteus, Citrobacter, Hafnia etc. Elles font partie de la flore normale de l'appareil digestif (côlon). Dans d'autres parties, physiologiquement stériles, de l'organisme, elles peuvent provoquer une infection. Bactérie à Gram négatif en milieu sélectif 1 Bactérie à Gram négatif en milieu sélectif 2

La propagation des Enterobacteriales dans un environnement clinique Dans des conditions hygiéniques insuffisantes, elles peuvent se transmettre par le biais de mains ou d'appareil sales. Elles peuvent être la cause de différentes infections contractées à l'hôpital (nosocomiales) : pneumonie, infection de la circulation sanguine, infections urinaires, infections de la peau et des parties molles etc.

Résistance aux antimicrobiens – A Les bactéries en cause des ces infections peuvent être résistantes à différents antibiotiques. La résistances des bactéries aux antibiotiques s'accroît. Suite au traitement antibactérien, la fréquence de résistance augmente à cause de la pression de sélection. Klebsiella : résistance naturelle à l'ampicilline

Résistance aux antimicrobiens – B L'apparition de la résistance : mutation gènes de résistance transmis par d'autres bactéries Les gènes de résistance se trouvent sur les plasmides et d'autres éléments génétiques mobiles (p. ex. transposons). Les plasmides sont capables de coder plusieurs gènes de résistance. bêta-lactamase – gène codant expression génique bêta-lactamase source du schéma représentant les β-lactamases : https://www.ebi.ac.uk/

Résistance aux antimicrobiens – C Résistant aux antibiotiques Sensible aux antibiotiques Le transfert horizontal de gènes est possible entre les mêmes ou différentes espèces de bactéries. Lors de la conjugaison, le plasmide est transmis de la cellule bactérienne donneuse à la bactérie receveuse. Si le plasmide comporte un gène de résistance, la cellule bactérienne receveuse devient résistante elle aussi. Résistant aux antibiotiques Transfert de gènes par conjugaison

Résistance aux antimicrobiens – D Les mécanismes de la résistance : La modification de la molécule cible de l'antibiotique La modification de la perméabilité de la membrane Efflux – les pompes d'efflux rejettent l'antibiotique à l'extérieur de la cellule bactérienne Dégradation enzymatique : production de bêta- lactamases – le cas de figure le plus fréquent

Antibiotiques β-lactames Le traitement des infections causées par les Enterobacteriaceae (et par d'autres bactéries) empêche la synthèse de la paroi cellulaire bactérienne composant principal : cycle lactame à 4 fonctions, contenant de l'azote pénicillines, céphalosporines, carbapénèmes et monobactames La structure des antibiotiques β-lactames

Bêta-lactamases – récapitulatif Les enzymes bêta-lactamases produits par les bactéries éliminent les antibiotiques β-lactames : ils déchirent le cycle lactame au niveau de la chaîne d'amide (voir schéma) Les types de bêta-lactamases : BLSE (bêta-lactamases à spectre étendu) : CTX-M (le plus fréquent), SHV, TEM Carbapénémases Céphalosporinases de type AmpC (moindre importance d'un point de vue épidémiologique) Molécule d'antibiotique intacte L'enzyme ouvre le cycle lactame

Les caractéristiques principales des BLSE hydrolysent la plupart des pénicillines et céphalosporines, y compris les les composés d'oxyimino-bêta-lactame : les céphalosporines de 2e, 3e et 4e génération, et aztréonam (pas les céphamycines ni les carbapénèmes) les inhibiteurs de bêta-lactamase (acide clavulanique, tazobactam, sulbactam) les empêchent de fonctionner (EUCAST – 2017) Bactérie productrice de BLSE

Bactérie à Gram négatif résistante aux carbapénèmes imipenem, meropenem, ertapenem, doripenem spectre le plus étendu traitement des infections graves / « dernier recours thérapeutique » multirésistant / pour le traitement des infections causées par les bactéries productrices de BLSE Bactérie à Gram négatif résistante aux carbapénèmes

Test E des carbapénémases hydrolysent les pénicillines, les céphalosporines (dans la plupart des cas) ; dégradent, à des degrés différents, les carbapénèmes et les monobactams (EUCAST) types : OXA, KPC, NDM, IMP, VIM etc. les infections causées par les bactéries productrices d'OXA et de KPC peuvent être traitées par une combinaison de carbapénèmes et d'inhibiteurs de bêta-lactamase Test E des carbapénémases

La résistance et sa détection – situation actuelle – 1 Dans les cas suivants, il existe un risque accru d'infection nosocomiale causée par les bactéries résistantes : une hospitalisation longue les patients en soins intensifs traitement antérieur par des antibiotiques à spectre étendu

La résistance et sa détection – situation actuelle – 2 Les bactéries deviennent de plus en plus résistantes partout dans le monde (données recueillies par l'OMS et l'ECDC) La colonisation par des bactéries productrices de BLSE est de plus en plus fréquente. Les bactéries productrices de BLSE les plus fréquemment isolées : E. coli et K. pneumoniae. (EUCAST – 2017) Les voyages à l'étranger font accélérer la propagation des bactéries multirésistantes.

La résistance et sa détection – situation actuelle – 3 Le taux de bactéries résistantes aux carbapénèmes et aux céphalosporines de 3e génération dans les isolats E. coli et K. pneumoniae obtenus à partir d'échantillons invasifs (selon les données recueillies par l'ECDC) % Année E. coli résistante aux céphalosporines de 3e génération E. coli résistante aux carbapénèmes K. pneumoniae résistante aux céphalosporines de 3e génération K. pneumoniae résistante aux carbapénèmes

La résistance et sa détection – situation actuelle – 4 La présence des bactéries productrices de carbapénémase (K. pneumoniae et E. coli) Cas déclarés par les hôpitaux de 38 pays européens, mai 2015 Stades épidémiologiques, 2014-2015 Pays n'ayant pas participé N'ayant pas déclaré la présence (stade 0) Présence sporadique (stade 1) Épidémie déclarée dans un seul hôpital (stade 2) Apparitions sporadiques dans les hôpitaux (stade 2b) Propagation dans une seule région (stade 3) Propagation dans plusieurs régions (stade 4) Situation endémique (stade 5) Luxembourg Malte Source : Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE), 8 April 2016, Stockholm : ECDC ; 2016

La résistance et sa détection – situation actuelle – 5 Les méthodes de détection actuelles des BLSE et des carbapénémases : en général, il faut une bactérie isolée Conformément aux directives EUCAST : tests de dépistage et de confirmation : diffusion à partir de disques, test E, double diffusion à partir de disques, MALDI-TOF MS, techniques PCR (et test Carba NP pour les carbapénémases) cette méthode prend du temps : >16 heures une détection rapide est indispensable pour prévenir une propagation plus importante pour une lutte efficace contre les bactéries multirésistantes

La résistance et sa détection – situation actuelle – 6 Les méthodes moléculaires, telles que la PCR en point final et la PCR en temps réels, peuvent être également utilisées pour la détection des bêta-lactamases. Ces méthodes se caractérisent par une haute sensibilité et une haute spécificité (et elles sont relativement rapides car il n'y a pas besoin de bactérie isolée). Par contre, la présence de gènes ne signifie pas forcément une production d'enzymes. Le test LFIA (lateral flow immunoassay) détecte les enzymes. Le dispositif NG DetecTool innovant (dont le fonctionnement est basé sur LFIA) détecte les enzymes directement à partir de l'échantillon fourni par le patient.

Contexte théorique de l'AMR Fin du matériel de formation NG DetecTool. Merci de l'avoir consulté !