Coordinated by Sven Bergmann

Slides:



Advertisements
Présentations similaires
QUALIFICATION COMPORTEMENTALE DES BASES DE DONNEES CLIENTS
Advertisements

PROPAGATION SPATIO-TEMPORELLE D’UNE MINEUSE ET DE SES PARASITOIDES
Comparaison des méthodes déterministes et Monte Carlo
Environmental Data Warehouse Cemagref, UR TSCF, TR MOTIVE 2011 – projet Miriphyque.
But du PPE : Développer les compétences nécessaires pour mener à bien un projet en pratiquant la démarche.
TD 1 les ckis et la différenciation des entérocytes
Master Informatique 2ème année
Modèles mathématiques d’angiogenèse
Estella Annoni, Franck Ravat, Olivier Teste, Gilles Zurfluh
COMMENT OPTIMISER UNE EXPERIENCE DE MICROARRAY?
Il est quelle heure?.
Société Française de Thermique
WP 4: Climate Change and Ocean Acidification 1st Annual Meeting Paris, 9-11 May 2011 MACROES.
OIL & UPML DREVET - HUMBERT Introduction OIL : un langage de description dontologies UPML : un langage de description de systèmes à base.
Modélisation de valeurs extrêmes Université de Liège : octobre 2002 Daniel Justens HEFF/Cooremans Bruxelles.
Les Sciences Physiques
2nd Pro Maintenance des Véhicules Automobiles
The origin and evolution of synapses
Définir des caractéristiques chercher de linformation? sur un support électronique? Élaborer un cadre théorique pour comprendre les enjeux et proposer.
Bi 231: Ingénierie des Protéines
Interfaces perceptuelles Interaction avec une caméra.
Le cycle cellulaire.
MobiNet: Une plateforme pédagogique pour
Coordinated by Sven Bergmann
Neuroenergetics: Modeling brain cell metabolic phenotypes
Glypicans in Drosophila wing imaginal disc patterning
Neuroénergétique Etudiantes :
Supervisors: Anna Kostikova, Nicolas Salamin
Météorologie de l’Espace: Le système Ionosphère-Thermosphère
Interfaces perceptuelles
General scheme for cell polarity development (1)
Génétique 30 Mars 2006 Mahinc Mathias Mollet Céline
Formatting of Game © Candace R. Black, Al rights reserved. Révisions!
Orbitales “s” Figure:
De tous temps en Guyane comme aux Antilles, la musique a d'abord servi à accompagner les danses. Les Musiques guyanaises reposent sur trois cultures :
des modèles utilisés pour la modélisation incendie
Station Matine de Villefranche sur Mer
Le Relookage. Identifiez - le 1.Qu’est ce que c’est? 2.À qui s’adresse ce site? 3.Que propose-t-il? 4.La modèle en photo a)Quelle peut être sa nationalité?
ANALYSE ET MODELISATION DES COURANTS ET DE LA TURBULENCE SOUS LES VAGUES DE VENT Présentation et position du problème dans un contexte cognitif et socio-économique.
Sujet Objet Les pronoms interrogatifs et relatifs
A Drosophila model for LRRK2-linked parkinsonism
IUMSP Institut universitaire de médecine sociale et préventive, Lausanne Facteurs génétiques associés au risque cardiovasculaire – comparaison entre sexes.
DIFFERENTIAL REGULATION OF HOX GENES IN ENDOMETRIOSIS
UVSQ EDF R&D Procédés de réutilisation pour les lignes de produits logiciels Yuanyuan XU, Bruno TRAVERSON - INFORSID Mai 2008.
The following people have been shopping and are now waiting for their friends at a café. Express this, using the appropriate forms of the verb attendre.
1 Méthode de “Fast Marching” générique pour “Shape From Shading” E. Prados & S. Soatto RFIA 2006 janvier 2006, Tours.
1 Programmation en C++ Marianne Morris. 2 Intro générale à la programmation On a déjà étudié le langage assembleur Langage de bas niveau Meilleur que.
DEPUIS: SINCE, FOR Les normes: Les questions essentielles:  Communication 1.2- Which tense is used with “Depuis” to express an action that begins in the.
Eléments de synthèse du 3ème congrès mondial de Neuro-Oncologie
Anitha sivaganesh foyer 140
LA MODÉLISATION Conférence du 2 octobre 2004 Présentation de M. Jacques Bélair Professeur au Département de mathématiques et statistiques, Vice doyen à.
Cours 3: Modélisation Mathématiques
Régulation du Cycle Cellulaire
Contexte général Le GHANA situation géographique situation économique situation démographique événement central pour notre étude terrain d’étude.
8 Les pronoms interrogatifs et relatifs Les normes: Communication 1.2 Comparisons 4.1 Les questions essentielles: - What are the 2 ways to ask the question.
ANIMATION PEDAGOGIQUE MATERNELLE
Le superlatif Les normes: Communication 1.2 Comparisons 4.1 Les questions essentielles: How is the superlative of an adjective made? What is the difference.
1. Un pays fragile. La Stratégie Sahel - la sécurité au Niger et dans la région:  • « …la sécurité et le développement au Sahel sont indissociables…
8 Les pronoms interrogatifs et relatifs Les normes: Communication 1.2 Comparisons 4.1 Les questions essentielles: - What are the 2 ways to ask the question.
La démarche scientifique.
1. Introduction.
I can talk about my typical routine, past and present Aujourd’hui nous allons Décrire notre journée typique Parler à deux Réviser nos relations Réviser.
The final intercalibration process Prerequisites 1. Good status boundaries have been set by Member States. 2. IC process has passed “feasibility checks“.
Le transfert de l’enseignement mathématique français aux Etats-Unis Le role des journaux américains de mathématiques ( ) IHP, Cirmath, 19 mai 2016.
Informatique 2A Langage C 2 è séance. Objectifs de la séance 2 Début de la modularité avec les fonctions Création d’une première bibliothèque.
Unit 3 Live Lesson © Facilitator: Roberta Smith La famille…
Accélérateur laser – plasma
Celebrating the Mathematics of Pierre Deligne.
Formulaire IMET.
Transcription de la présentation:

Coordinated by Sven Bergmann Solving Biological Problems that require Math Gradient Formation for the Cell Size in Fission Yeast Coordinated by Sven Bergmann Mentor Sascha Dalessi Students Johan Merçay Fabien Delapierre Lucas Degrugillier Olivier Hachet, DMF, UNIL

Deux articles parus dans Cell et Nature Contexte Étude sur les mécanismes de contrôle et d'entrée en mitose de la levure S. Pombe menée par le groupe de recherche du Professeur Sophie Martin Deux articles parus dans Cell et Nature Martin SG and Berthelot-Grosjean M. « Polar gradients of the DYRK-family kinase Pom1 couple cell length with the cell cycle » 2009. Nature 459: 852-6 Hachet O. & al. « A phosphorylation cycle shapes gradients of the DYRK-family kinase Pom1 at the plasma membrane » 2011. Cell 145: 1116-1128

Pom1-GFP Olivier Hachet, DMF, UNIL Aspect Biologique Identification du rôle de la protéine pom1 Forme gradient cortical et intracellulaire servant à mesurer la taille de la cellule et permet à la levure de contrôler l'entrée en mitose Pom1-GFP Olivier Hachet, DMF, UNIL

SG Matin & M Berthelot-Gorsjean Nature 459 (2009) Rôle de Pom1 Interaction de pom1 avec cdr2 inhibe l'entrée en mitose Pom1 prévient l'entrée prématurée en mitose des cellules de petite taille SG Matin & M Berthelot-Gorsjean Nature 459 (2009)

Formation du gradient Cycle de phosphorylation de Pom1 Olivier Hachet & al. Cell 145 (2011)

But du projet Mieux comprendre le mécanisme de diffusion de Pom1 le long de la membrane Établir un modèle mathématique permettant de décrire la formation du gradient

Développement Trois étapes : Extraction de données (Image J) Analyse de données (Mathematica) Modélisation (matlab)

Extraction des données Utilisation d'Image J pour extraire des données numériques des images Le gradient de pom1-GFP est exprimé en niveaux de gris La concentration de GFP est proportionnelle à l'intensité

Mathematica Traiter les données d'imageJ et définir des profils d'expression Comparer les profils retournés par le Plug-in avec les nôtres Validation du Plug-in

Données « à la main » 1ère étape pour les données « à la main » : Moyenne des 5 images Soustraction de la valeur du background

Comparaison avec le plug-in Transformer les données pour les rendre comparables : Origine de l'axe des x différent Taille de l'axe des x différent  

Profils Plug-in systématiquement moins élevés : Les résultats Profils Plug-in systématiquement moins élevés :

La suite Confirmer le Plug-in Analyses statistiques sur plusieurs profils Définir un modèle mathématique à l'aide d'équations différentielles