Le problème de la conformation. Les forces en jeu Interactions purement ioniques : pas sûr! Pensez à la RNAse modifiée par l’octapeptide poly-ala sur.

Slides:



Advertisements
Présentations similaires
Johannes Diderik van der Waals
Advertisements

Quest-ce que léducation du patient ? Chap. 1 – Q1.2 – Séq. 3 : Jeu de la matrice.
STRUCTURE DES PROTÉINES BASES DE LA BIOLOGIE STRUCTURALE
Les protéines.
La structure des protéines II
La structure des protéines I
Structure des protéines, Transcription, Traduction, Code Génétique,
Les liaisons intermoléculaires
Chapitre 8 Structures tridimensionnelles des protéines
Écrit, animé et illustré par Sheila CartwrightTraduit par
Évolution et diversité du vivant
Chapitre 8 Structures tridimensionnelles des protéines
5 ) ETUDE GÉOMÉTRIQUE . P2 5.1 ) Introduction .
CHMI 2227 F Biochimie I Protéines:
Protéines: Structure quaternaire
Cohésion de la matière à l’état solide
Groupe Béna Parallélisme entre la structure de l’information dans le code génétique et dans l’arithmétique Alain Bruyère Alain Bruyère.
Introduction au Repliement des Protéines et à la Simulation Moléculaire Le Repliement des Protéines La Dynamique Moléculaire (DM) Le Dynamique Brownienne.
Bi 231: Ingénierie des Protéines
Docking et Scoring.
PAA 1140 Biochimie vétérinaire, cours10
L’ADN, d’un fil à un chromosome…
Repliement des protéines: théorie et expérimentation
d- d+ H H F F Cl d+ d- d- d+ Li H F H
L’arbre du vivant.
Les évaluations CE1 – CM2 Séminaire Poitiers le 2 et 3 octobre.
Chapitre 2 Biochimie et Biosynthèse
Dissolution Une solution est obtenue par dissolution d’un soluté, ionique ou moléculaire, dans un solvant. Si le solvant est l’eau, la solution est dite.
La Modélisation Moléculaire
La structure des protéines
Interactions de faible énergie.
Interactions faibles intermoléculaires
PROTÉINES : Structure et fonctions .
Ch 9 Cohésions ioniques et moléculaires
Ch 10 Dissolution de composés ioniques ou moléculaires
COMPRENDRE LOIS ET MODELES.
Les membranes biologiques partie 1
-Lorsqu’on brise ces liaisons, nous faisons des transformations ____________……nous avons la ________ substance avant et après (mais pas sous le même _________…..)
Nouveau? L’utilisation de biomolécules (ADN, protéines, anticorps, enzymes….) n’est pas nouveau! On utilise ces biomolécules depuis longtemps dans les.
Protéines: Structure secondaire Hélice alpha
Prof Jeremías González SVT 1re S
3. LA LIAISON MÉTALLIQUE (forme des ______________)
Molécules et composés ioniques Interactions entre molécules
Bienvenue au département de Biochimie, Microbiologie et Immunologie
Protéines: Structure tertiaire
BTS DIETETIQUE 1 TP DE BIOCHIMIE                                                                                                                                                                
Les proteines.
Forces électriques et cohésion de la matière
Chapitre 3 les protéines
Les cristaux moléculaires.
Protéine.
PAA 1140 Biochimie vétérinaire, cours 9
UNIVERSITE DE PICARDIE JULES VERNE Faculté de Pharmacie
DES Premièrement, il faut une matière maniable qui se prête aux repliements … L’origami est l’art noble du pliage du papier. Car celle-ci peu plier ceci…
Interactions entre molécules

Synthèse de molécules organiques
PROPRIÉTÉS DES ACIDES AMINES. 1-1Propriétés ioniques:
LES LIAISONS DE FAIBLE ENERGIE

Comment une protéine se reploie t’elle?. Folding Probability An n-residue protein’s 2 n torsion angles (  &  ) have 3 stable conformations: –3 2n (~
Plan du cours 1. Introduction 2. L’eau 3. Les acides aminés, les peptides et les protéines 4. La structure tridimensionnelle des protéines 5. Exploration.
Dr. Florent Barbault, ITODYS (CNRS UMR 7086) La mécanique moléculaire.
LA COHÉSION DE LA MATIÈRE
RELATION STRUCTURE-PROPRIETES
Constituants du vivant
cohésion des solides moléculaires
Cohésion des solides moléculaires.
SWOT Analyse interne Analyse externe AtoutsHandicaps Forces … Faiblesses … Opportunités … Menaces …
Transcription de la présentation:

Le problème de la conformation

Les forces en jeu Interactions purement ioniques : pas sûr! Pensez à la RNAse modifiée par l’octapeptide poly-ala sur ses 10 lys de surface et son NH 2 terminal Van der Waals: Ces forces sont assez petites et ne se manifestent qu’à de très courtes distances Liens hydrogène : s’établissent localement

Les forces en jeu Force hydrophobe Côtés externe (polaire) et interne (hydrophobe) d’un feuillet  de la concanavaline Hélice à fort moment hydrophobe dans la myoglobine

Les forces en jeu Ponts S-S Le cas de la RNAse

PDI … accessoire au repliement

Cela ne fonctionne pas toujours L’insuline est dénaturée par la PDI

Cas de la BPTI

Chemin(s) vers la forme native

Chaperones moléculaires

Prévisibilité de la structure 24 N-term de l’adénylate kinase

Une séquence possible d’événements

Il y a des choses qui ne sont pas simples La structure parfois peut dépendre plus du contexte que de la séquence

Structure caméléonique ! 23-AATAEKFVFQY EWTYDDATKTF-52 AWTVEKAFKTF  7  5

Caractère local de l’organisation

La séquence ne reflète pas toujours la structure GB1Rop Janus Modification avec 50% homologie 40% homologie

Horreur, une protéine prion! PRION PROTEIN DOMAIN PRP( ) FROM MOUSE (PDB 1AG2)

Modélisation du repliement