Licence en Production et Protection Végétale La sélection assistée par marqueurs des variétés Sahel 108 et NERICA L-19 pour la tolérance au froid Réalisé par  : Mohamed Ould Sidi Encadré par: Dr. Baboucarr Manneh Sélectionneur du Riz Irrigué en AricaRice Dr.Med Abdallah Ould Moufid Eseignant à ISET ISET, Rosso, Mauritanie, 2014

Plan de Présentation Introduction Matériel et méthodes Résultats et Discussion Conclusions Perspectives

Introduction

Le riz constitue la denrée alimentaire de base de plus de la moitié de la population du globe En Afrique de l’Ouest la consommation en 2013 est autour de 7 millions 790 milles tonnes Malgré ses ressources l’Afrique de l’Ouest a importée 3 million 480 milles de tonnes en 2013 Pour la Mauritanie le riz contribue à près de 45 % de la production brute en céréales. 

 En 2013 : La consommation totale est 190 milles tonnes alors que la Production est seulement de 110 milles tonnes Un besoins accru d’augmenter la production pour atteindre l’autosuffisance et limiter l’importation. Des contraintes biotiques et abiotiques empêche l’augmentation de la production du riz Dans le Sahel le froid est un problème majeure pour la “double culture” et cela nécessite le développement et l’utilisation des variétés tolérantes au froid

Objectifs Global : Développer des variétés résistantes au froid Spécifique: Utiliser des marqueurs moléculaires (SSRs) pour identifier des individus BC2F1 qui ont introgressés les allèles de Silewah aux niveaux des QTLs (qCTB3 sur chromosome 3 et Ctb1 et Ctb2 sur chromosome 4) liés a la tolérance au froid.

Matériel et Méthodes

Le travail a été limité sur la population Sahel108/Silewah Matériel végétal NERICA L-19 Silewah Sahel108 Silewah 355 Individus BC2F1 189 Individus BC2F1 11 Familles 17 Familles Le travail a été limité sur la population Sahel108/Silewah

L’analyse moléculaire Les marqueurs SSR utilisés dans l'expérimentation Marqueur QTL chromosome Position (cM) RM231 qCTB3 3 11,5 RM523 5,5 RM280 Ctb1 4 152,3 RM317 Ctb2 118,3

Analyses moléculaires Récolte et mise en enveloppe des feuilles Extraction d’ ADN PCR révélation Migration sur gel acrylamide

Résultats et discussion

Amplification avec RM523 lié au qCTB3 sur chromosome 3 Lader S108 Silewah Pas d’Individus avec les allèles de Silewah en condition homozygote RM 523 22 individus condition hétérozygotes (AB)

Amplification avec RM231 lié au qCTB3 sur chromosome 3 Lader S108 Silewah 10 individus avec l’allèle de Silewah en état homozygote (BB RM231 28 individus en état hétérozygotes (AB)

Amplification avec RM280 lié au CTB1 sur chromosome 4 Lader S108 Silewah 10 individus avec l’allèle de Silewah en état homozygote (BB RM 280 8 individus en état hétérozygotes (AB)

Amplification avec RM317 lié au CTB2 sur chromosome 4 21 Individus avec l’allèle de Silewah en état homozygote (BB) RM 317 20 individus en état hétérozygotes (AB)

il y avait 50 individus qui ont introgressés l’allèle de Silewah sur les deux chromosomes 3 et 4 15 individus qui ont introgressés les allèles du Silewah sur deux marqueurs flanquant les régions des QTLs sur chromosome 3 (qCTB3) ou sur le chromosome 4 (Ctb1 et Ctb2) 3 individus (P31-4, P31-5 et P39-1) qui ont introgressés l’allèle de Silewah sur l’ensemble des marqueurs flanquant les régions des QTLs sur les chromosomes 3(qCTB3) et 4 (Ctb1 et Ctb2)

Les individus avec allèles de Silewah sur les marqueurs flaquant les QTLs sur le chromosome 3 ou 4 Markers RM231 RM523 RM280 RM317 Chromosome 3 4 Position 11,5 5,5 152,3  118,3 S108 A Silewah B P15-8 AB P15-13 P31-4 P31-5 P31-6 P31-7 P31-9 P34-6 P34-7 P34-11 P39-3 P39-1 P59-2 M P59-4

Conclusion et perspectives

Conclusion Les marqueurs microsatellites utilisés sont bien adaptés pour l’identification des individus qui ont introgressés les allèles de Silewah sur les QTLs liés à la tolérance au froid Il y avait d’autre individus qui ont introgressés l’allèle de Silewah sur un seul chromosome. Soit sur le chromosome 3, soit sur le chromosome 4 Les individus qui ont introgressés l’allèle de Silewah sur l’ensemble des marqueurs flaquant les régions des QTLs sur les chromosomes 3 (qCTB3) et 4 (Ctb1 et Ctb2). Sont les individus qui auront plus de résistance

Perspectives Background sélection ou la sélection de fond sur les individus qui ont introgressés l’allèle de Silewah sur l’ensemble des marqueurs flanquant les régions des QTLs sur les chromosomes 3 et 4 Inter-croisement entre les lignés sœurs qui ont itrogressées l’allèle de Silewah sur un seul QTLs du chromosome 3 ou 4

Perspectives Les individus sélectionnés doivent être marqués et croiser avec Sahel 108 pour produire des BC3F1s après avoir complété le SAM, la nouvelle version de Sahel 108, doit être testée en milieu paysan durant la période froide pour confirmer sa tolérance au froid et éventuellement homologuée pour l’exploitation par les riziculteurs

Merci de votre attention