Worldwide Botanical Knowledge Base – Jean-Marc Vanel ● GNU-Linux systèmes d'exploitation WWBKB biologie ● XML: pas d'autre moyen! ● Comment ce projet est-il.

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Transcription de la présentation:

Worldwide Botanical Knowledge Base – Jean-Marc Vanel ● GNU-Linux systèmes d'exploitation WWBKB biologie ● XML: pas d'autre moyen! ● Comment ce projet est-il venu? ● Depuis 15 ans je collectionne des plantes ● Expérimenté en informatique scientifique ● Un jour un collègue me dit: on peut trouver tout sur Internet ● Oui si on connait le nom

La Nature très menacée ● Des milliers d'espèces disparaissent pour toujours, ● Il faut une identification rapide des specimens de zones menacées, sans nécessiter de scientifiques; ● La connaissance est sur papier comme du temps de Linnaeus, ● ==> un inventaire (informatique) du patrimoine biologique de notre terre reste à faire.

La situation actuelle ● past efforts from biologists (e.g. Delta, Lucid) have been software first, data afterwards ● There is currently no other botanical project with this scope. Why ? ● funds go rather to biotechnologies than to descriptive biology, ● pluri-disciplinarity is not easy, ● laboratories are in a position of concurrence

Specifications ● rendre accessibles les données botaniques sur Internet : ● description des espèces, avec images 2D and 3D, ● identification assistée par ordinateur de specimens, ● Distribution géographique, ● Base de connaissances répartie (Web Sémantique), liens avec d'autres disciplines ● zoologie: pollinisation, disseminations, parasites, herbivores ● genetique/biochemie: e.g. corrélation entre molécules et taxonomie ● ecological - phytosociological, pedological, climatic: search of correlation, analyze of vicarious species ● agronomie, usages des plantes, ethnobotanie, paléontologie

Information libre / logiciel libre ● Personne ne possède la nature ● Un grand projet pour l'humanité, ● un projet informatique grandiose ● fédérer resources existantes et les hommes ● Flora of China Flora of China ● Flora of Australia ● Taxonomic Databases Working Group ● INRIA, Paris VI LIS, Museum,...

Vision: observations de terrain ● Vous avez un portable avec la base botanique, une camera, un GPS, et une connection Internet. Tout à coup rencontre d'une plante remarquable; vous la montrez à l'ordinateur, qui vous pose deux questions sur le nombre de carpelles, et les poils. ● l'ordinateur, indique que c'est un nouveau site pour Strasburgeria robusta, qu'on pensait exister seulement en Nouvelle Caledonia. ● Il propose d'envoyer des s aux specialistes des Strasburgeriaceae, et de la region, et de recueillir un specimen d'herbier. Pendant ce temps, ce découverte, complète avec images et coordonnées géographiques, est envoyée au serveur concerné(s)