Travail de génétique 2°Doc Doppagne M.L. Evrard L. Peduzzi F. Schoenars P.

Estimation de la variance génétique et phénotypique de divers caractères de croissance chez la chèvre Sicilienne «Girgentana»

Plan de l’exposé Présentation du sujet Présentation du sujet Commentaires des méthodes Commentaires des méthodes Résultats & Conclusion Résultats & Conclusion Applications pratiques Applications pratiques Bibliographie Bibliographie

I. Présentation du sujet  Animaux populaires dans le passé: -> élevés en centres urbains -> vente au détail de viande et lait  Restrictions sanitaires: -> interdiction d’élever en centres urbains -> interdiction de vendre le lait => EXTINCTION (de en 83 à 524 en 94)

Pour éviter l’extinction, la race doit retrouver sa valeur génétique, zootechnique et économique:  Augmenter la production de viande  Retarder l’abattage à jours

II. Commentaire des méthodes  1998 – 2000  276 chevreaux: 118 mâles 158 femelles 158 femelles  élevés en ferme expérimentale au lait maternel

1. Collecte de données: Numéro d’identification Numéro d’identification Pédigrée Pédigrée Sexe Sexe Poids corporel Poids corporel Taille de la portée Taille de la portée

2. Analyses statistiques: Modèle père multi-caractère incluant: Modèle père multi-caractère incluant: -> des effets fixes: - année de naissance - âge de la mère à la naissance - taille de la portée - sexe de l’enfant -> des effets dus au hasard: - pères dont on ne connaît pas l’âge à la naissance de l’enfant - autres

y ijklmn = µ + a i + b j + c k + d l + s im + e ijklmn y = caractère de croissance y = caractère de croissance µ = moyenne générale µ = moyenne générale a = année de naissance a = année de naissance b = âge de la mère à la naissance b = âge de la mère à la naissance c = taille de la portée c = taille de la portée d = sexe des chevreaux d = sexe des chevreaux s = effet du père lié à l’année de naissance s = effet du père lié à l’année de naissance e = erreur e = erreur

Héritabilité (h²) et variance génétique additive (σ² a ) h² = 4 σ² s / (σ² s + σ² e ) h² = 4 σ² s / (σ² s + σ² e ) -> σ² s : variabilité entre pères -> σ² e : variance résiduelle -> méthode ANOVA, ½ frères paternels (paternal half-sibs) σ² a = 4 σ² s /(1 – F) σ² a = 4 σ² s /(1 – F) -> F = consanguinité

Variance erreur de l’héritabilité (σ² h² ) σ² h² = 32h²/T σ² h² = 32h²/T -> T = pP où -p = nombre de descendants de chaque père -P = nombre de familles de demi-frères Probabilité que la variance erreur soit significative: Probabilité que la variance erreur soit significative: P 0 = 1/(s-1) { P-1/P (Σp²) }

III. Résultats et conclusions 1. Effets de l’environnement: - Sur le poids corporel (BW): -> effets fixes significatifs pour BW 0, 15, 60 -> seuls année et type de naissance significatifs pour BW 30 et 45 - Sur le gain quotidien moyen (ADG): -> taille de la portée significative sauf pour ADG1 -> année de naissance significative pour ADG1, 3 et 4

- Sur le poids corporel ET le gain quotidien moyen: -> année de naissance significative sauf pour BW30 -> âge de la mère significatif sur période pré- et post-sevrage càd entre 0 et 15 jours puis entre 45 et 60 jours -> BW augmente en moyenne avec l’âge de la mère -> ADG 2-4 augmente avec l’âge de la mère -> taille de la portée significative sur BW: « enfants uniques » ont meilleur BW et ADG

2. Effets génétiques - Sur BW: -> h² assez faible (valeur la plus élevée pour BW0?) -> corrélation génétique entre tous les BW significativement différente de 0 -> corrélation phénotypique inférieure à la corrélation génétique mais toutes positives, élevées, et significativement différentes de 0

- Sur ADG: -> h² faible inférieure à h² pour BW -> corrélation génétique négative entre ADG1 et ADG 2 - 4, diminue avec l’âge -> corrélation phénotypique augmente avec l’âge -Sur ADG et BW: -> corrélation génétique négative entre BW et ADG1 mais pas avec ADG 2 - 4

Conclusions Effets fixes expliquent 24 à 41% des variances phénotypiques: Effets fixes expliquent 24 à 41% des variances phénotypiques:  Année de naissance  Taille de portée  Age de la mère à la naissance Corrélation génétique entre BW0 – 60 et BW30 – 60 permet sélection indirecte des BW 60 en sélectionnant BW0 ou BW30 Corrélation génétique entre BW0 – 60 et BW30 – 60 permet sélection indirecte des BW 60 en sélectionnant BW0 ou BW30 Corrélation négative entre BW0 et ADG1 due à la perte de poids après la naissance Corrélation négative entre BW0 et ADG1 due à la perte de poids après la naissance

IV. Applications pratiques Gestion des facteurs d’environnement Gestion des facteurs d’environnement Sélection précoce au 30° jour Sélection précoce au 30° jour Sélection des parents limitée car héritabilité faible Sélection des parents limitée car héritabilité faible Attention à la consanguinité Attention à la consanguinité

V. BIBLIOGRAPHIE « Estimation of the genetic and phenotypic variance of several growth traits of the Sicilian Girgentana goat ». B. Portolano et al. Small Ruminant Research 45 (2002) 247 – 253 « Estimation of the genetic and phenotypic variance of several growth traits of the Sicilian Girgentana goat ». B. Portolano et al. Small Ruminant Research 45 (2002) 247 – 253 « Méthodes Statistiques en Médecine Vétérinaire ». P. Leroy, F. Farnir. Les éditions de l’université de Liège (2000 – 2001) « Méthodes Statistiques en Médecine Vétérinaire ». P. Leroy, F. Farnir. Les éditions de l’université de Liège (2000 – 2001) « Cours de génétique quantitative ». P. Leroy, J. Detilleux. (2004– 2005) « Cours de génétique quantitative ». P. Leroy, J. Detilleux. (2004– 2005)