Initiation à la microbiologie

Présentation au sujet: "Initiation à la microbiologie"— Transcription de la présentation:

1 Initiation à la microbiologie
Le projet Génome à l’école Initiation à la microbiologie

2 Nous avons reçu une souche:
Pectobacterium atrosepticum. Nous cherchons à savoir si la souche que nous avons reçu est bien Pectobacterium atrosepticum. Pour cela nous avons fait une orientation et une identification bactérienne.

3 Orientation Bactérienne
Nous réalisons un gram. Résultat : Coccobacille, Gram-

4 On réalise un test d’oxydase qui est oxydase - .
Nous avons effectué un état frais qui a montré que les bactéries sont mobiles. On a ensemencé un milieux Hugh et Leifson qui a démontré que la bactérie fermente le glucose en anaérobiose. On a ensuite ensemencé un milieu viande foie qui donne un type respiratoire aérobie anaérobie facultatif. Viande foie Hugh et Leifson

5 Orientation : famille des entérobactéries

6 Identification bactérienne
On ensemence une galerie API 20 E (E pour Entérobactérie), à l’aide d’une suspension bactérienne réalisée à partir d’une colonie isolée, Après incubation les résultats sont les suivants: aractère ONPG ADH LDC ODC CIT H2S URE TDA IND VP GEL GLU MAN INO SOR RhA SAC 91MEL AMY ARA Lecture de la galerie + - Erwinia spp selon API 13 3 1 5 88 17 97 77 26 91 19 42 41 On remarque que les résultats expérimentaux sont en accord avec les pourcentages de réaction positives mentionnés dans le tableau d’identification proposé par biomérieux .En effet Pectobactérium atrosepticum appartient à l’ancien genre Erwinia.

7 Après lecture de la galerie API, on a confirmé que la souche reçue est bien Pectobacterium atrosepticum.

8 Par ailleurs, après ensemencement sur pomme de terre nous avons bien vu que la souche cause une maladie chez la pomme de terre.

9 Nous disposons donc bien au laboratoire d’une souche de
Pectobacterium atrosepticum.