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WORK PACKAGE 1: MODELS AND TOOLS ALLOWING TO SPECIFY AND TO BUILD SEARCH ENGINES DEDICATED TO GEOGRAPHIC INFORMATION (SPATIAL, TEMPORAL ET THEMATIC FACETS)

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1 WORK PACKAGE 1: MODELS AND TOOLS ALLOWING TO SPECIFY AND TO BUILD SEARCH ENGINES DEDICATED TO GEOGRAPHIC INFORMATION (SPATIAL, TEMPORAL ET THEMATIC FACETS) Marie-Noelle BESSAGNET 1 MOANO 16 Décembre 2010 MOANO 16/12/ 2010 Equipe T2I Laboratoire LIUPPA, UPPA Equipe IC3 Laboratoire IRIT, UPS BnF

2 Expertise LIUPPA MOANO 2

3 Information extraction/Information retrieval MOANO 3

4 4 Spatial Interpréter Valider Extraire Temporel Interpréter Valider Extraire Thématique Interpréter Valider Extraire Fonds Documentaire Chaîne de Traitement sémantique Index Niveau 1 Chaîne de Traitement sémantique et statistique Recherche dInformation Scénarios dUsages

5 Expertise IRIT MOANO 5

6 Ontologies, textes et web sémantique MOANO 6 Construction et évolution Terminae, ANR Dafoe et Dynamo, 1 thèse SMAC Représentation des connaissances Autodiag, 1 thèse Outils dextraction de relations Exploiter le langage : patrons lexico-syntaxique Exploiter la structure XML et la mise en forme (projet GEONTO) Relations sur plusieurs phrases : résolution danaphores Corpus de textesOntologies à composante terminologique Construction dontologie Extraction dinformation Recherche en botanique Extraction de relations Perspectives Aide à la décision Ontologies Dynamiques

7 Expertise BnF MOANO 7 Ressources – Thésaurus RAMEAU – Documents sur la botanique Expertise indexation documentaire

8 Les membres LIUPPA Marie-Noelle BESSAGNET, Christian SALLABERRY IRIT Nathalie AUSSENAC-GILLES, Mouna KAMEL BnF Michel MINGAM MOANO 8

9 Découpage du WP1 WP 1.0 – Preliminary study of corpus features, end- users requirements and existing botanical ontologies Preliminary work should focus on identifying the ontologies available in botany to encourage their reuse to accelerate the construction of a new ontology WP 1.1: Development of methods and tools to extract concepts and relationships Preliminary study of corpora and reusable ontology to be used for botanical document annotation MOANO 9

10 Découpage du WP1 WP 1.2: Development of a thematic process to index text documents based on the produced ontology Tools for ontology-based indexing of botanical text MOANO 10

11 Découpage du WP1 WP 1.3 Development of a platform supporting the creation of descriptive notices (LIUPPA, BNF) MOANO 11

12 Place dans le projet : interactions MOANO 12

13 Ontologie MOANO 13 Un exemple schématique d'ontologie : l'incontournable exemple des cubes. Source :

14 Etape 1 : création de lontologie Une ontologie pour quoi faire? favoriser l'indexation conceptuelle automatique et la recherche de documents textuels sur la botanique (e.g., comptes rendus botaniques) ; faciliter la compréhension de la botanique (objectif pédagogique). Une ontologie de domaine : botanique Un préalable : Phase d'identification des ressources disponibles MOANO 14

15 Etape 2 : un système de RI basé sur lontologie Une ontologie pour quoi faire? Améliorer la requête de lutilisateur; Aide à la décision MOANO 15

16 Source Février URFIST16Web sémantique N. Aussenac-Gilles Ressource ontologique et processus de recherche dinformation Information need Query representation Analyse match Document gathering Collection of documents Documents representation Indexing Retrieved documents Concept hierarchy, thesaurus, ontology,...

17 Un système de RI basé sur lontologie MOANO 17 Spatial Temporel Thématique Fonds Documentaire Chaîne de Traitement sémantique IndexRequête Résultats

18 La botanique Compte-rendu de sortie botanique Récit Description de la flore vivant dans des biotopes à des périodes données « Lélément central est lobservation : cest lensemble de données relatives à un ou plusieurs individus dune même espèce observés sur un site à une certaine date par un observateur associé à un validateur / déterminateur, dans le cadre dun ensemble dobservations appelé relevé. » Corpus MOANO 18

19 Extrait CR sortie botanique MOANO 19 EspaceThème : taxon Thème

20 Extrait CR sortie botanique MOANO 20 Espace : biotope Thème

21 Livres anciens « Le voyage de Tarbes, Première grande traversée des Pyrénées", aux éditions Loubatières, de Augustin Pyramus de Candolle. » Comment donner accès à ce contenu scientifique? Augustin Pyramus de Candolle ( ), botaniste. MOANO 21

22 Livres anciens En 2007, un groupe de botanistes a refait cette traversée en 70 jours – Evolution de la flore – MOANO 22

23 Extrait de leur récit Le val d'Esquierry Nous partons à 6H45 du refuge d'Espingo pour rallier les Granges d'astau et rejoindre le reste de l'équipe dont nous étions séparés suite aux péripétie de la veille au port d'OO. Dans la descente, sur une falaise humide, nous trouvons une station à Saxifrage de Cluse d'une dizaine de pieds. Plante assez rare, Gérard précise qu'une station aurait été détruite lors de l'élargissement du sentier. Heureusement, la nature semble avoir encore quelques ressources. 8H15, arrivée au bivouac, nous retrouvons l'équipe. Nous mettons rapidement les échantillons d'herbier récoltés depuis trois jours dans la grande presse. Nous repartons vers 10H00 pour le val d'Esquierry. La montée à travers la prairie et la hêtraie est raide, mais assez courte. À la sortie, nous débouchons sur un immense vallon couvert de fleurs. Nous trouvons une prairie montagnarde pas encore pâturée. Nous relevons, comme de Candolle avant nous, le Millepertuis des montagnes, la Serratule fausse-centaurée, plante remarquable par la taille de son port et de son inflorescence et formant une population de quelques dizaines de pieds très localisée. MOANO 23

24 Contexte : La botanique Ouvrir laccès à la connaissance (grand public, étudiants, décideurs,...) au travers dinterfaces de recherche/navigation en texte. Exploiter les connaissances des experts présentes au sein des descriptions textuelles Limage a une place prépondérante en botanique : de nombreux croquis…. MOANO 24

25 Des images et des croquis Le Millepertuis des montagnes, la Serratule fausse-centaurée, MOANO 25

26 Un concept : Le millepertuis plusieurs termes Noms communs : Millepertuis, herbe de la Saint- Jean. Nom botanique : Hypericum perforatum, famille des hypéricacées ou clusiacées. Noms anglais : St. Johns Wort, SJW. MOANO 26

27 Des outils pour classer, indexer et rechercher Thésaurus : RAMEAU Des référentiels taxonomiques pour la faune et la flore : : logiciel de gestion de bases de données naturalisteshttp://www.sciena.org/serena/ MOANO 27

28 Une taxonomie existante – Thésaurus Rameau Une première base MOANO 28

29 Des questions? pour votre attention MOANO 16 Décembre


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