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Acides aminés: Structure Propriétés chimiques générales

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1 Acides aminés: Structure Propriétés chimiques générales
CHMI 2227F Biochimie I Acides aminés: Structure Propriétés chimiques générales CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

2 Protéines: Blocs de base des être vivants!
CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

3 Acides aminés C H R COOH NH2 Ca CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

4 Propriétés générales des acides aminés.
CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

5 Propriétés générales des acides aminés.
Zwitterion Charge nette: +1 Charge nette: 0 Charge nette: -1 pH acide pH alcalin pKa 1 (pH 2-2.5) pKa 2 (pH ) CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

6 Titrage des acides aminés 1. scénario le plus simple:
Tampon! CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

7 Les 20 acides aminés CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

8 Structure des 20 acides aminés 1. acides aminés hydrophobes
CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

9 Structure des 20 acides aminés 1. acides aminés hydrophobes
CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

10 Structure des 20 acides aminés 2. Acides aminés aromatiques
CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

11 Structure des 20 acides aminés 2. Acides aminés aromatiques
Absorbance max (nm) Molar (M-1 cm-1) Phenylalanine 257.4 197 Tyrosine 274.6 1420 Tryptophan 279.8 5690 CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

12 Structure des 20 acides aminés 3. acides aminés polaires, non-chargés
CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

13 Structure des 20 acides aminés Cystéine et cystine
Pont disulfure En biochimie: oxidation: perd H Réduction: gagne H CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

14 Structure des 20 acides aminés Tyr, Ser, Thr
- P=O O- Phospho-Ser Protéine kinase phosphatase ATP ADP H2O PO4-3 CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

15 Structure des 20 acides aminés 4. Acides aminés chargés négativement
CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

16 Structure des 20 acides aminés 4. Acides aminés chargés négativement
pKa1 pKa2 pKaR Quel est le pI du glutamate? NaOH pH 9.5 4.1 2.1 100% A 100% B 100% C 100% D A B C D CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

17 Structure des 20 acides aminés 5. Acides aminés chargés positivement
CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

18 Structure des 20 acides aminés 5
Structure des 20 acides aminés 5. Acides aminés chargés positivement:His pKaR pKa2 CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

19 Structure des 20 acides aminés Valeurs des pKa des acides aminés
CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

20 Analyse des acides aminés 1. Chromatographie à échange d’ions
Élution + pH >> pI pH << pI CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.

21 Analyse des acides aminés 2. Détection des acides aminés
OH Ninhydrine Acide aminé 2 N C H R COO- NH3+ CO2 Pourpre!! R-HC=O CHMI E.R. Gauthier, Ph.D.


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