Les bases de données du Muséum

Présentation au sujet: "Les bases de données du Muséum"— Transcription de la présentation:

1 Les bases de données du Muséum
Jacim II.1 Initiation 26 novembre 2009 Aude ANDOUCHE 1

2 Visualisation des informations
Les bases de données du Muséum : Le petit monde de Jacim Jacim Interface de saisie et de consultation Collections en ligne Visualisation des informations Wiki des collections Accès direct à Jacim Aide en ligne Bases de données sous Oracle 2

3 Les collections en ligne
Les bases de données du Muséum : Les collections en ligne 3

4 Recherche sur différents critères
Les bases de données du Muséum : Les collections en ligne Recherche sur différents critères 4

5 Résultats sous forme de fiche
Les bases de données du Muséum : Les collections en ligne Résultats sous forme de fiche 5

6 Le wiki des collections
Les bases de données du Muséum Le wiki des collections 6

7 Les bases de données du Muséum :
Le wiki des collections Les données 7

8 Schéma des bases de données Les bases de données du Muséum :
Le wiki des collections Schéma des bases de données 8

9 Les bases de données du Muséum :
Le wiki des collections Jacim 9

10 Le wiki des collections
Les bases de données du Muséum Le wiki des collections 10

11 Définitions JACIM Java Oracle Les bases de données du Muséum :
Jacim II.1 Définitions JACIM = interface Java Application des Collections pour l’Informatisation des Musées « Jacim est une application permettant d'accéder à des données stockées dans des bases de données relationnelles (saisie, recherche, modification, importation, exportation) et de mettre en forme ces données (PDF, HTML, impressions...) » Java Langage de programmation Oracle un système de gestion de bases de données relationnelles 11

12 Définitions Base de données Les bases de données du Muséum :
Jacim II.1 Définitions Base de données Système d'organisation de l'information, conçu pour une localisation et une mise à jour rapide et facile des données. Organise l'information qu'elle contient en tables, en champs (les colonnes) et en enregistrements (les lignes). Les tables renferment les champs qui renferment les données - Tables ensemble de données - Champs un même type d’information 12

13 Organisation de l’information
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 Organisation de l’information Données sur spécimen Localité X Pays Y État du spécimen N° inventaire Détermination informatisation Table origine Localité pays Table spécimen État N° inventaire détermination 13

14 Relation entre les tables
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 Relation entre les tables PK: Primary Key (clé primaire): unique FK: Foreign Key (clé secondaire) Table ORIGINE Localité Pays Continent Département Province Latitude Longitude originePK Table SPECIMEN N° inventaire État Collection nombre SpecimenPK origine FK 14

15 Relation entre les tables
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 Relation entre les tables localité Spécimen 1 Spécimen 2 Spécimen 3 Spécimen 4 Spécimen 5 Spécimen 1 localité Relation de 1 à 1 1 spécimen vient d’une seule localité Relation de n à 1 1 localité regroupe plusieurs spécimens 15

16 16

17 Connexion http://jacim.mnhn.fr/wiki/ Les bases de données du Muséum
Toujours la dernière version déployée 17

18 Connexion Pour la connexion, saisir : Le nom d’utilisateur
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 Connexion Pour la connexion, saisir : Le nom d’utilisateur le mot de passe Administrateur Utilisateur lambda Consultations uniquement Base test des Crustacés Nom utilisateur : CRUSTATEST Mot de passe : 26novembre 18

19 Ouvrir Les bases de données du Muséum : Jacim II.1
Possibilité d’ouvrir le dernier modèle de document sur lequel nous avons travaillé 19

20 Ouvrir Tables Documents Contextes Les bases de données du Muséum :
Jacim II.1 Ouvrir Tables ex: table « ORIGINE » contient les champs PAYS, CONTINENT, VILLE, LAT, LONG… Documents Correspondent à plusieurs tables Contextes environnement de travail avec plusieurs documents 20

21 Création d’un modèle de document
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 Création d’un modèle de document Avec une seule table Ouvrir la table ORIGINE Enregistrer le document WIKI: « Un modèle de document est un document XML décrivant une perception hiérarchique de la structure d'une base de données relationnelle » 21

22 22

23 pour les tables et documents
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 5 modes d’affichage pour les tables et documents Disponible à tout moment 23

24 5 modes d’affichage Les bases de données du Muséum : Jacim II.1
« Configurateur » permet : de personnaliser la présentation des tables et des documents. « Composeur » permet : De mettre en forme l’information pour l’impression ou la visualisation « Assistant de saisie » permet : de saisir de nouveaux enregistrements. « Éditeur » permet : De visualiser, de corriger, d’ajouter de l’information à des enregistrements. « Tableur » permet : De créer un formulaire ou un tableau pour effectuer de la recherche, de la saisie ou de l’échange d’information entre Jacim et d’autres applications. 24

25 Personnaliser son document
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le configurateur Personnaliser son document Aide Copie Format de sortie Nom des champs 25

26 Personnaliser son document
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le configurateur Personnaliser son document Aide 26

27 Personnaliser son document
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le configurateur Personnaliser son document Nom des champs 27

28 Enregistrement des modifications
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le configurateur Enregistrement des modifications 28

29 récupérer des données sélectionnées
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Le Tableur permet de créer des formulaires Rechercher des données dans la BDD Ajouter des données dans la BDD récupérer des données sélectionnées 29

30 Le tableur Table Tableur Formulaire Les bases de données du Muséum :
Jacim II.1 : le tableur Le tableur Code couleur Rechercher : Bleu Ajouter : jaune Charger : vert Table Tableur Formulaire 30

31 La barre d’outils Les bases de données du Muséum :
Jacim II.1 : le tableur La barre d’outils Enregistrer le tableur Retirer une ligne de recherche Ouvrir Réinitialiser le tableur Importer des données Texte Importer des url d’images Exporter des données Excel Outil de gestion des images Exécuter une action (baguette magique) Dédoublonner Ajouter une ligne de recherche Accès aux différents modes 31

32 Créer ou modifier un tableur
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Créer ou modifier un tableur Ajouter des champs Supprimer des champs Déplacer les champs Mettre à la ligne des champs Réduire ou afficher les fenêtres 32

33 Effectuer une requête simple
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Effectuer une requête simple Exemple : Mauritanie Pour exécuter l’action 33

34 Effectuer une requête simple
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Effectuer une requête simple 34

35 Visualisation des résultats de la requête
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur Visualisation des résultats de la requête dans l’éditeur Formulaire Texte par défaut 35

36 Utilisation de l’aide Les bases de données du Muséum :
Jacim II.1 : le tableur Utilisation de l’aide Clic droit dans le champ (ou aide automatique dans le configurateur) uniquement disponible dans la partie formulaire 36

37 Utilisation de l’aide Les bases de données du Muséum :
Jacim II.1 : le tableur Utilisation de l’aide Utilisation des opérateurs dans l’aide Mauritanie *ritanie Mauri* *aurit* 37

38 Effectuer une requête simple
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Effectuer une requête simple Exemple : Mauritanie sans la baie du Lévrier 38

39 Utiliser plusieurs critères de recherche
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Utiliser plusieurs critères de recherche Ajouter des critères en ajoutant des lignes Supprimer des critères en supprimant des lignes 39

40 Utiliser plusieurs critères de recherche
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Utiliser plusieurs critères de recherche Changer les critères de recherche Ou : tout les cas de figure Sauf : sans ce critère 40

41 Utiliser plusieurs critères de recherche
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Utiliser plusieurs critères de recherche Changer les critères de recherche Et : à la fois Mauritanie et Cap blanc 41

42 Réinitialiser le tableur
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Réinitialiser le tableur 42

43 Exercices Recherche « PAYS » avec
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Exercices Base test des Crustacés Nom utilisateur : CRUSTATEST Mot de passe : 26novembre Recherche « PAYS » avec Mexique Indonésie Congo Recherche avec la ville de « Washington » Navire « Jean Charcot » Mission de l’Astrolabe Origines avec prof max > ou égale à 100m Origines avec prof comprise entre 200 et 500 m 43

44 Exercices Recherche « PAYS » avec Recherche avec « Washington » 5
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Exercices Base test des Crustacés Nom utilisateur : CRUSTATEST Mot de passe : 26novembre Recherche « PAYS » avec Mexique 57 Indonésie 178 Congo 28 Recherche avec « Washington » 5 Navire « Jean Charcot » 116 Mission de l’Astrolabe 6 Origines avec prof max > ou égale à 100m 5011 Origines avec prof comprise entre 200 et 500 m 1301

45 Corrections Recherche « PAYS » avec
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Corrections Recherche « PAYS » avec Mexique* *ndon* *Congo* Recherche avec « Washington » Wash* Navire « Jean Charcot » Jean Charcot Mission de l’Astrolabe *strolabe* prof max opérateur supérieur ou égale 100 prof min opérateur supérieur ou égale 200 et prof max opérateur inférieur ou égal 500

46 Création d’un modèle de document
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 Création d’un modèle de document Avec plusieurs tables Base test de malacologie Nom utilisateur : formamal Mot de passe : malaco 44

47 Création d’un modèle de document
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le configurateur Création d’un modèle de document Avec plusieurs tables 45

48 Document multi-tables
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le configurateur Document multi-tables En partant de la table Lot, ajoutez les tables Détermination, Localité, Statutype et Nom La 1ère table dite la table « racine » est importante pour le type de requête… Ici ce document va permettre de faire des recherches sur des spécimens Penser à enregistrer votre modèle de document 46

49 47

50 Requête sur un document multi-tables
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Requête sur un document multi-tables Enraciné sur la table Lot 48

51 Enregistrer le tableur
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Enregistrer le tableur Réouverture lors d’une autre session Ouverture par défaut de celui-ci s’il porte le même nom que le document 49

52 Exercices Holotype en alcool exclusivement
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Exercices Base test de malacologie Nom utilisateur : formamal Mot de passe : malaco Holotype en alcool exclusivement Types en alcool 70 et alcool adn Types en alcool 70 et alcool adn et de Nouvelle-Calédonie Coll Lamarck Murex récoltés à plus de 1000m Créer un document basé sur la table « localité » et faire les mêmes requêtes 50

53 Exercices Holotype en alcool exclusivement 61
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Exercices Base test de malacologie Nom utilisateur : formamal Mot de passe : malaco Holotype en alcool exclusivement 61 Types en alcool 70 et alcool adn 416 Types en alcool 70 et alcool adn et de Nouvelle-Calédonie 8 Coll Lamarck 53 Murex récoltés à plus de 1000m 1 Créer un document basé sur la table « localité » et faire les mêmes requêtes

54 Corrections alcool * *alcool* et *type*
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Corrections Base test de malacologie Nom utilisateur : formamal Mot de passe : malaco alcool * *alcool* et *type* *alcool* et *type* et *alédonie* Coll. Lamarck* champ Ngenerique Murex et PROF2 opérateur supérieur 1000 Créer un document basé sur la table « localité » et faire les mêmes requêtes Pas même résultats car recherche des localités et non des spécimens comme dans les exercices précédent

55 L’éditeur va permettre de : Visualiser les données et de les trier
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur L’éditeur va permettre de : Visualiser les données et de les trier Corriger les données Ajouter des informations Changer des informations 51

56 La barre d’outils Les bases de données du Muséum :
Jacim II.1 : l’éditeur La barre d’outils Enregistrer Remise à jour Ouvrir Trier Poubelle pour la sélection Imprimer Hiérarchie déployée Exporter en PDF Hiérarchie resserrée Ouvrir les composeurs associés au document 52

57 3 modes d’affichage Le formulaire (affichage par défaut)
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur 3 modes d’affichage Le formulaire (affichage par défaut) 53

58 Le composeur par défaut
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur Le composeur par défaut Avec aucune mise en page 54

59 le composeur avec mise en page
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur le composeur avec mise en page 55

60 Développer ou réduire la sélection
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur Développer ou réduire la sélection Permet de visualiser les différentes tables du document développer réduire 56

61 Visualiser les différentes tables du document
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur Visualiser les différentes tables du document 57

62 Trier la sélection Les bases de données du Muséum :
Jacim II.1 : l’éditeur Jacim II.1 : l’éditeur Trier la sélection Le tri s’effectue dans l’ordre des colonnes sélectionnées (double clic ou sélection et ajouter) Tri ascendant ou descendant (en décochant les cases) 58

63 Enregistrer le modèle de tri
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur Enregistrer le modèle de tri Si le modèle de tri porte le même nom que le document alors ce tri se fera par défaut 59

64 Corriger ou compléter des données
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur Corriger ou compléter des données Correction de la localité Attention! Ne pas corriger directement dans les champs car les modifications ne seront pas enregistrées! 60

65 Corriger ou compléter des données
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur Corriger ou compléter des données Rechercher sur le tableur Voir la recherche sur l’éditeur Se positionner au bon niveau dans la liste Cliquer sur CORRIGER Sélectionner la table que nous voulons corriger Corriger 61

66 Changer ou corriger des données Ce n’est pas la même chose
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur Changer ou corriger des données Ce n’est pas la même chose On peut corriger quand : une information n’est valable que pour un lot comme l’état, la quantité… ou des fautes d’orthographe On doit changer quand : une information peut être valable pour plusieurs lots comme la localité 62

67 Changer ou corriger des données
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur Changer ou corriger des données Erreur de localité pour le spécimen 2 localité 1 Spécimen 1 Spécimen 2 Spécimen 3 Spécimen 4 Spécimen 5 localité 1 Spécimen 1 Spécimen 2 Spécimen 3 Spécimen 4 Spécimen 5 Spécimen 1 Spécimen 2 Spécimen 3 Spécimen 4 Spécimen 5 localité 2 Spécimen 8 Spécimen 7 Spécimen 6 localité 2 Spécimen 8 Spécimen 7 Spécimen 6 localité 2 Spécimen 8 Spécimen 7 Spécimen 6 Corriger Changer 63

68 Changer ou corriger des données
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur Changer ou corriger des données n°inventaire A10002, en bon état, 1 exemplaire, 2 valves entières, fossile, holotype, collection Jousseaume 1er exemple : Vous voulez mettre la coll Lamarck à la place de la coll Jousseaume On peut corriger 64

69 Changer ou corriger des données
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur Changer ou corriger des données n°inventaire MOLL0002, en bon état, 1 exemplaire, 2 valves entières, holotype, collection Jousseaume 2ème exemple : Vous voulez mettre Lectotype à la place de Holotype On doit changer 65

70 Corriger ou compléter des données
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur Corriger ou compléter des données Sur plusieurs enregistrements en même temps L’information doit être la même pour tous les enregistrements! Une fenêtre vide apparaît (normal) Les autres informations dans les autres champs ne sont pas effacées 66

71 Effacer des enregistrements de l’éditeur
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur Effacer des enregistrements de l’éditeur Ils seront supprimés de la sélection mais pas dans la base Sélectionner les enregistrements à supprimer (avec SHIFT ou CTRL) Clic sur la poubelle 67

72 Créer un PDF Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’éditeur
68

73 Les bases de données du Muséum :
Jacim II.1 : l’assistant de saisie L’assistant de saisie va permettre de rentrer les données étape par étape en recherchant les données déjà inscrites dans la base L’assistant de saisie va dérouler les différentes tables en fonctions de la table racine et des autres tables qui lui sont associées 69

74 Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’assistant de saisie
l’assistant de saisie va à chaque étape proposer de rechercher de l’information existante ou de saisir de l’information 70

75 Rechercher si la localité est présente dans la base
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’assistant de saisie Rechercher si la localité est présente dans la base Taper une information comme « Mauritanie » (on peut s’aider de l’aide) Rechercher pour voir si c’est déjà rentrée Si oui, une nouvelle fenêtre apparait Trier la recherche Choisir, Accepter 71

76 Si la localité n’est pas présente dans la base
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’assistant de saisie Si la localité n’est pas présente dans la base Changement de la couleur de fond du formulaire, bleu en recherche jaune en ajout 72

77 L’assistant propose ensuite la table lot
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’assistant de saisie L’assistant propose ensuite la table lot La recherche n’est pas disponible pour cette table (fond jaune) 73

78 L’aide et la copie Les bases de données du Muséum :
Jacim II.1 : l’assistant de saisie L’aide et la copie Clic droit sur le champ 74

79 Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : l’assistant de saisie
75

80 Ajout de données avec le tableur
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Ajout de données avec le tableur couleur de fond du formulaire, jaune en ajout 76

81 Ajout de données avec le tableur
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Ajout de données avec le tableur Saisir des données avec le tableur: « AJOUTER » Puis baguette magique pour exécuter le travail 77

82 Ajout des données table par table
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Ajout des données table par table Procédure identique à l’assistant de saisie 78

83 Exportation de données
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Exportation de données Peut se faire sous format Excel ou texte Choisir les champs voulus, dans l’ordre Passer dans l’éditeur Revenir dans le tableur Charger Exporter (baguette magique) 79

84 Exportation de données
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Exportation de données Création du fichier Excel ou texte 80

85 Données exportées sous fichier excel
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Données exportées sous fichier excel En tête des colonnes: NOM BASE.NOM TABLE.NOM CHAMP 81

86 Importation de données
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Importation de données Peut se faire sous format texte En tête des colonnes: NOM BASE.NOM TABLE.NOM CHAMP 82

87 Importation de données
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Importation de données Le fichier doit être le plus homogène possible, et respecter le format des champs!! Oe Apostrophe ‘ Guillemet « Pas de formule Pas de caractère spéciaux Pas de touche « entrée » Pas de ligne vide 83

88 Importation de données
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Importation de données Importer un fichier texte: « AJOUTER AUTO » Jacim ne demande pas à chaque table votre accord vérifier qu’il n’y a pas de cellule rouge: mauvais format 84

89 Importation de données
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Importation de données vérifier dans l’éditeur le nb de lignes enregistrées 85

90 Recherche de données à partir d’un fichier texte
Les bases de données du Muséum : Jacim II.1 : le tableur Recherche de données à partir d’un fichier texte 86