BIO 4518: Biostatistiques appliquées Le 4 octobre 2005 Laboratoire 3 ANOVA à un critère de classification.

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1 BIO 4518: Biostatistiques appliquées Le 4 octobre 2005 Laboratoire 3 ANOVA à un critère de classification

2 Aujourd’hui… ANOVAs à un critère de comparaison –Visualisation des données –Test des conditions d’application –Analyses paramétrique et non-paramétrique –Comparaisons multiples (Bonferonni, Scheffé et Turkey) –Transformation de données –Examen des valeurs extrèmes

3 Comment procéder? L’examen visuel des données (pages 161-3) (référez-vous aux labos précédents pour les détails)

4 Vérification des conditions d’application Observations indépendantes Normalité des résidus –Test visuel: Diagramme de probabilité des résidus (p.165) –Test formel: Kolmogorov-Smirnov sur les résidus (p.166) Homoscédasticité des résidus –Test visuel: Graphique de l’étendue des résidus (p. 165) –Test formel: Test de Levene (p.166)

5 Correction du manuel La formule de sous-ensemble de données pour l’ANOVA sans les valeurs extrêmes (p. 176) devrait être: c(1:22, 24:58, 60:86, 88:118) avec un c minuscule et non un C majuscule

6 Et n’oubliez pas… La fonction pour gagner du temps La date de la remise du devoir 2 est le 11 octobre 2005

7 G-POWER Logiciel gratuit sur le site du cours: http://simulium.bio.uottawa.ca/bio4518/labo/index.htm Ouvrir GPOWER.EXE (double-clique) Passez en mode plein écran en appuyant sur ALT-ENTER (si vous ne travaillez pas en mode plein-écran, la souris ne fonctionne pas)

8 Étape 1: choisir le test Étape 2 : trouver d (voir prochaine diapo)

9 Déterminer la taille de l’effet (d) 1.Trouver  (vous devez le calculer vous-même) 2.Trouver d v = degrée de liberté s 2 = l’ecart-type (standard deviation) *Référez-vous à vos notes en classe pour un exemple où vous pouvez aussi utiliser G- POWER pour calculer d avec l’option Calc Effectsize

10 Pour les tests de t appariés Il faut choisir OTHER T-TESTS dans le choix du test (étape 1) La valeur de d est alors remplacée par la valeur f (qui correspond à la valeur absolue de t obtenu dans le test de t apparié)

11 L’option Graph Vous permet de modifier différents paramètres et d’en visualiser l’effet sur d’autres paramètres Choisissez les paramètres

12 Vous obtiendrez des graphiques comme celui-ci: