Vibert Dimitri CSII3 Tuteur : Volker Bäcker.  Présentation de Montpellier RIO Imaging  La mission  Les langages et outils utilisés  Le planning 

Présentation au sujet: "Vibert Dimitri CSII3 Tuteur : Volker Bäcker.  Présentation de Montpellier RIO Imaging  La mission  Les langages et outils utilisés  Le planning "— Transcription de la présentation:

1 Vibert Dimitri CSII3 Tuteur : Volker Bäcker

2  Présentation de Montpellier RIO Imaging  La mission  Les langages et outils utilisés  Le planning  La segmentation  L’algorithme : split and merge  Résultats obtenus  Problèmes rencontrés  Conclusion

3  La plate-forme  L’équipe :  Les missions : › Promouvoir l’utilisation de la microscopie  308 utilisateurs  29121 heures  3 millions d’images › Participer au développement de la microscopie  MRI Cell Analizer › Former les utilisateurs à la microscopie

4  Les problèmes  Le sujet  Le résultat attendu

5  ImageJ : › Un logiciel d’analyse et de traitement d’images › Caractéristiques

6  Analyse UML  Développement en JAVA  Eclipse  Junit  Subversion

7  Apprentissage des différents algorithmes de segmentation + présentation  Développement d’un premier algorithme : region growing  Développement de l’algorithme choisi : split and merge  Développement de l’interface et du manuel d’aide 2 semaines 1 semaine 1 mois et 3 semaines 2 semaines

8  Qu’est ce que la segmentation ?  Les classes d’algorithmes : › Basées sur une approche globale de l’image › Basées sur les régions › Basées sur les contours

9  2 étapes principales : › La première : Split (découpage)

10 › Etape intermédiaire :  Région adjacency graph (Graphe d’adjacence)

11 › La deuxième : Merge (fusion)

12  Diagramme UML :

13  Conditions de découpage :  Conditions de fusion :

14  Interface et résultats :

15  Anglais  Compréhension des algorithmes › Mathématiques › Domaine de la biologie  Communication et concentration

16 Objectifs atteints Méthodes de travail Acquisition de connaissances diverses

17 Merci pour votre attention !