Note 1 : Tous les rapports de T.P. devront être soumis avant la date limite via le serveur Esilbac. Aucune autre forme de remise ne sera acceptée. Note.

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1 Note 1 : Tous les rapports de T.P. devront être soumis avant la date limite via le serveur Esilbac. Aucune autre forme de remise ne sera acceptée. Note 2 : Un (1) point sera retranché à la note de votre T.P. pour chaque jour de remise en retard. Comme chaque T.P. vaut 5 points, il est préférable de remettre votre travail à temps. L’heure et la date indiquées sur le serveur serviront de référence. Note 3 : C’est votre responsabilité de vérifier que la remise de votre travail a été effectuée correctement. Bien vérifier que vous êtes dans le bon répertoire lors de la remise.

2 TP1 – Analyse de séquences Vos recherches en biochimie vous ont permis d’isoler un fragment d’ADN d’environ 1000 nt qui est toujours associé à une maladie génétique grave chez l’humain. Hypothèse: Il est donc probable que la protéine codée par ce gène fonctionne mal chez les individus atteints de la maladie. Objectifs: Vous voulez donc analyser la séquence pour identifier le gène, la protéine et ce qui est connu jusqu’ici à ce sujet.

3 Questions principales pour l’étude de cette maladie 1- A quel gène correspond le fragment d’ADN? 2- Quelle est la protéine codée par ce gène? 3- A quelle famille de protéines appartient cette protéine? A-t-elle des motifs qui permettraient de prédire sa fonction? 4- A quel point cette protéine est-elle conservée à travers l’évolution? 5- Quel est l’organisation du gène au niveau du génome? 6- Quelle est la fonction de la protéine? 7- Que sait-on de cette protéine?

4 NCBI Home Site Map (A-Z) All Resources Chemicals & Bioassays Data & Software DNA & RNA Domains & Structures Genes & Expression Genetics & Medicine Genomes & Maps Homology Literature Proteins Sequence Analysis Taxonomy Training & Tutorials Variation Welcome to NCBI The National Center for Biotechnology Information advances science and health by providing access to biomedical and genomic information. About the NCBI |About the NCBI Mission |Mission Organization |Organization Research |Research RSS Feeds Get Started Tools: Analyze data using NCBI softwareTools Downloads: Get NCBI data or softwareDownloads How-To's: Learn how to accomplish specific tasks at NCBIHow-To's Submissions: Submit data to GenBank or other NCBI databasesSubmissions 1 2 3 4 5 6 7 Popular Resources BLAST Bookshelf Gene Genome Nucleotide OMIM Protein PubChem PubMed PubMed Central SNP NCBI News New NCBI Newsletter 01 Dec 2011 Information on the new Genome Site, a new 16S BLAST database, updates to Sequin, changes in EUtilities, new PheGenI and Highlight Sequence Features tools, BLAST NCBI Home Site Map (A-Z) All Resources Chemicals & Bioassays Data & Software DNA & RNA Domains & Structures Genes & Expression Genetics & Medicine Genomes & Maps Homology Literature Proteins Sequence Analysis Taxonomy Training & Tutorials Variation Welcome to NCBI The National Center for Biotechnology Information advances science and health by providing access to biomedical and genomic information. About the NCBI |About the NCBI Mission |Mission Organization |Organization Research |Research RSS Feeds Get Started Tools: Analyze data using NCBI softwareTools Downloads: Get NCBI data or softwareDownloads How-To's: Learn how to accomplish specific tasks at NCBIHow-To's Submissions: Submit data to GenBank or other NCBI databasesSubmissions 1 2 3 4 5 6 7 Popular Resources BLAST Bookshelf Gene Genome Nucleotide OMIM Protein PubChem PubMed PubMed Central SNP NCBI News New NCBI Newsletter 01 Dec 2011 Information on the new Genome Site, a new 16S BLAST database, updates to Sequin, changes in EUtilities, new PheGenI and Highlight Sequence Features tools, BLAST NCBI Home Site Map (A-Z) All Resources Chemicals & Bioassays Data & Software DNA & RNA Domains & Structures Genes & Expression Genetics & Medicine Genomes & Maps Homology Literature Proteins Sequence Analysis Taxonomy Training & Tutorials Variation Welcome to NCBI The National Center for Biotechnology Information advances science and health by providing access to biomedical and genomic information. About the NCBI |About the NCBI Mission |Mission Organization |Organization Research |Research RSS Feeds Get Started Tools: Analyze data using NCBI softwareTools Downloads: Get NCBI data or softwareDownloads How-To's: Learn how to accomplish specific tasks at NCBIHow-To's Submissions: Submit data to GenBank or other NCBI databasesSubmissions 1 2 3 4 5 6 7 Popular Resources BLAST Bookshelf Gene Genome Nucleotide OMIM Protein PubChem PubMed PubMed Central SNP NCBI News New NCBI Newsletter 01 Dec 2011 Information on the new Genome Site, a new 16S BLAST database, updates to Sequin, changes in EUtilities, new PheGenI and Highlight Sequence Features tools, BLAST Comparaison de séquences Association du gène aux maladies humaines Littérature pertinente Recherche d’information dans les bases de données (NCBI) http://www.ncbi.nlm.nih.gov