Exposé : Les arbres phylogénétiques 1/ Définition de la phylogénie La phylogenèse ou phylogénie est l'étude des relations de parenté entre êtres vivants : entre individus (niveau généalogique ; seule une généalogie individuelle peut répondre à la question « qui est l'ancêtre de qui ? » , tandis qu'une phylogénie de groupe peut répondre à la question « qui est le plus proche parent de qui ? ») ; entre populations (à l'intérieur d'une même espèce) ; entre espèces (niveau interspécifique). La phylogenèse permet de reconstituer l'évolution des organismes vivants 1

2/ Qu'est-ce qu'un arbre phylogénétique? Un arbre phylogénétique est la représentation de la parenté supposée entre animaux ou entre plantes sous la forme d'un arbre. Le plus ancien est celui d'Haeckel qui était un biologiste, philosophe et libre penseur allemand du XIXeme siecle. Il a fait connaître les théories de Charles Darwin en Allemagne et a développé une théorie des origines de l'Homme, (Charles Darwin est un naturaliste anglais du XIXeme siècle dont les travaux sur l'évolution des espèces vivantes ont révolutionné la biologie avec son ouvrage De l'origine des espèces paru en 1859) 2

3/ ne pas confondre les arbres phylogénétiques et les arbres généalogiques La généalogie est le rapport d'ancêtre à descendants, ces rapports ne peuvent être identifiés en tant que tels uniquement si l'identité même de l'ancêtre et des descendants est préalablement connue. Autrement dit, pour retracer la généalogie, la science de la classification devrait avoir la certitude de connaître toutes les espèces existantes et ayant existé. Comme ce n'est pas le cas, car la science est loin de pouvoir connaître la totalité des espèces vivantes et fossiles, la généalogie, même si elle a réellement eu lieu dans le passé, ne peut être retracée. Ce que la science de la classification peut retracer, avec ces mêmes éléments partiels que sont les quelques espèces fossiles et actuelles connues, ce sont les rapports de parenté entre espèces. C'est ce qui fait la différence entre une généalogie (« qui est ancêtre de qui ») et une phylogénie (« qui est le plus proche parent de qui »). Les rapports phylogénétiques entre espèces connues constituent ainsi le seul critère objectif possible de classification 3

4/ La composition d'un arbre phylogénétique Les composants d'un arbre phylogénétique sont : -Les branches : qui sont le lien évolutif entre l'ancêtre commun et les espèces actuelles -Les nœuds : représentant le dernier ancêtre commun entre les branches qui en découlent -Les innovation évolutive : qui montrent le passage de l'état primitif d'un caractère à l'état dérivé du même caractère -Les Extrémités des branches : les espèces actuelles ou fossiles (ne sont jamais représentées sur une branche ou un nœud)   Pour modéliser les arbres phylogénétiques on peut aussi utiliser des logiciels (par exemple « Treedyn » ou « Jalview », Remarques : Les ancêtres communs représentés sur les arbres phylogénétiques sont hypothétiques,définis par l'ensemble des caractères dérivés partagés par des espèces qui leur sont postérieures ; ils ne correspondent pas à des espèces fossiles précises, Une espèce fossile ne peut être considérée comme la forme ancestrale à partir de laquelle se sont différenciées les espèces postérieures. Il est à noté que le fossile est une lignée évolutive éteinte. 4

5/ Les sources Dictionnaire Larousse Wikipédia Bioinfo-fr.net Freesvt.free.fr 5