Analyse génétique des "Days Open" chez les bovins viandeux Cruchon Virginie 2ème Doctorat Gardin Julien
But de l’étude Estimation facteurs génétiques affectant DO Programmes amélioration des bovins viandeux Exemple : Élevage d’Asturiana de los Valles
Days Open Définition : Jours entre le vêlage et la conception Utilisation bovins laitiers / bovins viandeux
Matériel et Méthodes Base de données CORECA Conditions d’enregistrements de DO : Fécondation Vêlage 269 à 305 jours Intervalle entre vêlages 290 à 630 jours
Données DO 21 349 DO 9379 vaches 2276 animaux suppl. =>1181 taureaux Progeny test
Autres données Intervalle entre vêlages (CI) Longueur de la gestation (GL) Date de vêlage (CD)
Analyse des paramètres génétiques affectant DO Procédure REML (Restricted Maximum Likelihood) Modèle linéaire Effet génétique additif animal (μ) : valeur variable (μ~N (0,Aσ²μ)). Programme DF-REML (Dérivative Free - Restricted Maximum Likelihood)
3 Facteurs d’environnement Nombre de descendants d’un taureau par année de vêlage Saison de vêlage : 2 niveaux Âge de la vache en année au vêlage précédent : 5 niveaux
4 niveaux de vêlage 1er vêlage 2nd vêlage 3ème au 9ème vêlage 10 vêlages ou plus
5 modèles différents Importance des effets génétiques et d'environnement permanent sur DO (modèles 1 et 2) Corrélations entre les facteurs génétiques et d'environnement permanent affectant la DO fonction du nombre de parturitions (modèles 4 et 5) Corrélation génétique de DO avec les autres caractères (modèle 5)
Modèle 1 Modèle animal univarié Effet génétique additif (μ), incluant environnement permanent (c) Résidu (e)
Modèle 2 Semblable au modèle 1 Effet génétique additif (μ) Environnement permanent (c) Résidu (e)
Modèle 3 Modèle animal multivarié DO = différents caractères corrélés entre eux dans les 4 niveaux de vêlage Effets génétiques additifs (μ) Covariance entre ces effets génétiques additifs (cov(μμ))
Modèle 4 Modèle animal bivarié DO = différents caractères corrélés entre eux dans 2 niveaux : 1er et 2nd vêlage ; 3 vêlages ou plus Effets génétiques additifs (μ) Covariance entre ces effets génétiques additifs (cov(μμ)) Effets d'environnement permanent (c) Covariance entre ces effets (cov(cc)) Résidu (e)
Modèle 5 Modèle animal bivarié Semblable au modèle 4 Caractérisation les relations génétiques entre DO et respectivement CI, GL et CD
Résultats et discussion Tableau 1 Décrit fréquences de performances reproductrices analysées en fonction du nombre de vêlage des femelles Performance souhaitée : 1 vêlage / an DO et intervalle entre vêlage : augmentation avec le nombre de vêlage ? Longueur de la gestation : plus courte ? Date de vêlage : pas de différence significative
Résultats et discussion Tableau 2 Résultats de l'analyse génétique de DO, effectuée en utilisant un modèle univarié Variance génétique estimée : modèle 2 << modèle 1 Diminution de l'héritabilité Même erreur de variance dans les modèles 1 et 2 Confusion entre les composantes génétiques et environnementales
Résultats et discussion Tableau 3 Héritabilités estimées de DO
Résultats et discussion Tableau 4 Héritabilité estimée pour DO Corrélation génétique des DO, jeunes vaches/vaches adultes Gènes affectant DO Facteurs environnementaux Amélioration de la performance reproductrice
Résultats et discussion Tableaux 3 et 4 Jeunes vaches : variances génétiques, environnement permanent, autres composantes des variances phénotypiques + élevés Biais sur estimation des variances génétiques (Réforme ?)
Résultats et discussion Tableau 5 Modèle bivarié utilisé pour s'assurer des relations génétiques entre DO et, respectivement, CI, GL et CD Corrélation génétique entre DO et CI = 1 Corrélation génétique entre DO et autres caractères reproductifs = négative Environnement permanent
Conclusion / Usage pratique DO = *caractère avec une variabilité génétique considérable *caractère de reproduction *génisses et vaches au 2nd vêlage Sélection des génisses en fonction de DO = excellente valeur dans les progeny tests des taureaux
Conclusion / Usage pratique DO = même caractère génétique que CI Mais rapidité d’enregistrement Calcul simultané des caractères de croissance au sevrage Relations génétiques entre DO et les caractères de croissance en pré-sevrage ? Utilité de DO dans les objectifs des élevages de bovins viandeux ?
Bibliographie Cours génétique 1er Doctorat, J. Detilleux http://www.ulg.ac.be/fmv/quant2doc.html http://www.ulg.ac.be/fmv/quant.html http://www.mat.univie.ac.at/~neum/reml.html http://www.agbu.une.edu.au/~kmeyer/dfreml.html Vierhout C. N., 1998, Characteristics of progeny test herds and their effects on the genetic evaluation of young sires, Dairy Science