Bactéries Multi-et hautement résistantes: épidémiologie mondiale et Européenne Dr Jean-Winoc DECOUSSER Laboratoire de Bactériologie – Hygiène Département de Microbiologie CHU Henri MONDOR Assistante Publique – Hôpitaux de Paris

Plan Introduction BMR, BHRe: quésaco? Voyage au pays des BMR: Cocci à coloration de Gram Positif Bacille à coloration de Gram négatif Entérobactéries BGN non fermentant … et les autres http://www.cdc.gov/

Introduction (1) Hampton T. Report Reveals Scope of US Antibiotic Resistance Threat. JAMA 2013

Capacité adaptative Échanges génétiques Capacité réplicative Biomasse La biomasse bactérienne = 6 x 1030 bactéries sur la planète Homme: 10 14 bactéries 1013 selles 109 peau 1010 nasopharynx Animaux Plantes / terre (107/g) Eau (douce: (106/ml) Capacité réplicative 1 génération en 20 min 0.01 erreur par génome bactérien et par génération (réparation) Capacité adaptative Échanges génétiques Pression antibiotique Transmission croisée

« Tout ou rien »: présence du mécanisme BMR: définition (s) « Tout ou rien »: présence du mécanisme Ex: BLSE – carbapénèmase chez entérobactéries, Ex: résistance à l’oxacilline chez S. aureus Mais: SARM communautaire multisensible E. coli oxa48 non BLSE Multi - Résistance par accumulation de résistance: = bactéries résistantes à > 3 classes d’antibiotiques habituellement utilisés pour traiter les infections dues à ce germe Archétype: Pseudomonas aeruginosa, BMR si résistant à l’imipénème + autres résistances» (SF2H, Prévention de la transmission croisée, 2009)…

Problème de consensus des définitions de MDR, eXtensively DR, PanDR: travail CDC/ECDC Def. Catégories d’antibiotiques par espèce BMR = I/R > 1 molécule dans > 3 catégories Magiorakos et Al. MDR, XDR, PDR bacteria: an international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance. CMI 2011

BMR - BHRe: définition / classification BMR « universelles » endémo-épidémiques: SARM, BLSE Bactéries Hautement Résistante émergente: BHRe Entérocoque Résistant à la Vancomycine (ERV), entérobactéries résistantes à l’imipénème (EPC). BMR « Réanimation » opportuniste et saprophytes: Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumanii Haut Conseil de la Santé Publique 2013

Staphylococcus aureus Bactériémies à SARM aux USA (2008 -2011): 42.9% /SARM et 57.1% SASM David MZ et al. Clin Infect Dis. (2014) http://ecdc.europa.eu/en/publications/Publications/antimicrobial-resistance-surveillance-europe-2012.pdf

Staphylococcus aureus Août 2004: 11 services d’urgences de CHU 422 cas d’Infections de la peau et des tissus mous 320/422 à S. aureus (76%) 78% des S. aureus étaient des SARM soit 59% de l’ensemble des bactéries isolées 99% des SARM appartenaient au même clone de coSARM (USA 300) 98% des SARM étaient porteur du gène de la leucocidine de Panton Valentine et 94% érythromycine R

Staphylococcus aureus

Staphylococcus aureus France: 2004 à 2008 USA300 a débarqué, sans succès ST80 son équivalent européen représente environ 1% des SARM Doublé par « Géraldine » France / Europe: depuis 2008 Italie, Espagne: USA300 émerge France:USA300 émerge ? 1ère épidémie intrafamiliale autochtone 1ère épidémie interfamiliale autochtone: juin 2011 – mai 2012: 1er épidémie autochtone interfamiliale à USA300 en France (Auvergne): 6 familles, 12 cas Tietz A et al. NEJM 2005 Larsen AR et al. Eurosurveillance 2007 Robert J et al. CMI 2005 Lamy et al. EJCMID 2012 Robert J et al. AAC 2011 Durand G et al. J Clin Microbiol 2006 Dauwalder et al. J Clin Microbiol 2008 Di Giacobbe A. et al. IJAA 2011 Blanco R. et al. JCM 2011 Traore et al. Folia Microbiologica 2014 Baud et al. EJCMID 2014.

ERV (Enterococcus faecium Prévalence de la colonisation par le VRE à l’admission dans les réanimations : USA: 12.3% (tendance à la baisse), Europe: 2.7% Amérique du Sud:7.0% Asie: 5.3% Océanie: 4.4% Plos One September 2013 | Volume 8 | Issue 9 | e75658

ERV E. faecium, mais aussi: E. avium E. raffinosus

Entérobactéries productrice de carbapénémases (EPC)

Entérobactéries productrice de carbapénémases (EPC)

Klebsiella pneumoniae E. Coli: <0,1%

France: Reference Center ATB R:01 to 09/2013 Espèce Nombre de souches positives K. pneumoniae 253 E. coli 68 Enterobacter spp. 39 Citrobacter spp. 15 Serratia spp. 4 Autres 13 Total 392 1.0% 3.8% 3.3% 9.9% 17.3% 64.5% P. Nordmann

France: Reference Center ATB R:01 to 09/2013 0.5% Nombre de souches positives OXA-48-like 306 KPC 22 NDM 40 VIM 14 IMP 3 IMI 2 OXA-48-like + NDM 5 Total 392 0.8% 1.3% 3.6% 10.2% 5.6% 78.1% P. Nordmann

OXA 48 sans BLSE: quid du dépistage? OXA 48 avec BLSE mais CMI ertapénème = 0,5 mg/L OXA 181 Non détecté par le Xpert Carba R assay ® Decousser et al. CMI 2014 In press

Acinetobacter baumannii résistant à l’imipénème (ABRI)

Comparaison des souches par Diversilab ®

1ère épidémie européenne à ABRI NDM-1 ABRI: oxa23, oxa40, oxa58 1ère épidémie européenne à ABRI NDM-1 description de cas importés en Europe (République Tchèque, Allemagne, Slovénie, Suisse, Belgique, France) Région de provenance: majoritairement Maghreb et Moyen Orient clone particulier ST85 Environnement génétique particulier Acquisition résistance colistine / Tigecycline + amikacine sous traitement Bonnin et al. CMI 2012

Pseudomonas aeruginosa khail V Edelstein M et al. Lancet Infect Dis 2013 3 périodes:2002 – 2004 / 2006-2007/ 2008 /2010 Russie / Russie / Russie + Biolérussie + Kazakhstan Souche de P. aeruginosa responsable d’infection nosocomiale 4,5% / 20,3 % / 28,7% des souches productrices de carbapénémase 96% résistantes à tout sauf à la colistine 99,6% porteuse du gène bla VIM-2 96,5% appartiennent au ST295 En 2010 5,9% résistantes à la colistine

Mais encore….. Staphylocoque à Coagulase Négative Neisseria gonorrhoeae Mycobacterium tuberculosis Streptococcus pneumoniae Streptococcus agalactiae ….

Conclusion Nouveaux mécanismes de résistance Importation continue de pays ou la situation n’est pas maîtrisée/ plus maîtrisable « superbug » associant virulence / résistance / diffusion +++ Bataille perdue d’avance? Ou plutôt: ce n’est pas gagné…….

Introduction (2) Course entre (1) l’émergence et la diffusion de la résistance bactérienne aux antibiotiques et (2) le développement de nouvelles molécules (1) Phénomène naturel inéluctable favorisé par l’utilisation des antibiotiques (1) Transmission croisée: voyages, surpopulation, hôpitaux (2) pas de nouvelle classe d’antibiotique depuis 40 ans (2) 2 molécules avec de nouvelles cibles depuis 1998 (linézolide et daptomycine) (2) 15/18 des grandes compagnies pharmaceutiques ont complètement abandonné le champ des antibiotiques Barlett JG et al. Seven ways to preserve the miracle of antibiotics . Clin Inf Dis 2013