Evaluation 2007 8-10th October 2007 Dispositif INRA et partenaires d’UMR en Santé Animale Réseau Français de Santé Animale Groupe miroir de la Technical Platform for Global Animal Health Alfort-Afssa 29 Octobre 2007 Une communauté scientifique pour la recherche en santé animale et santé publique vétérinaire INRA-Animal Health Division

INRA et partenaires académiques et de formation un envionnement scientifique en structuration dans un contexte compétitif Évolution (lente) de l’organisation de la recherche en France Concentration des organismes, identification des Instituts finalisés Rapprochement Recherche / Formation supérieure Agences (ANR, AERES, ANI) Préservation des missions et spécificité des structures Au niveau des entités de recherches : les Unités Mixtes de Recherche Au niveau régional, les pôles : PRES, pôles de compétitivité, pôles DGER Au niveau national : les réseaux et la répartition des clusters Au niveau international : Les outils européens dont les TP, NeO, etc.. La tétrapartite (INRA, USDA-ARS, BBSRC, AAF Canada), CGIAR et réseaux internationaux CIRAD, rapprochement INRA-CIRAD Domaine agronomique Des recherches finalisées, recherches d’amont et d’aval construites sur l’identification de demandes sociétales, et en partenariat académique, régalien et professionnel

Département Santé Animale (+MICA) Evaluation 2007 Structuration de la recherche publique en santé animale en France 8-10th October 2007 INRA 180 2008 Département Santé Animale (+MICA) ENVs 80 CIRAD 20 AFSSA 100 Recherche Formation pour/à la recherche Surveillance et AST Evaluation du risque Développement Une répartition des mandats mais une communauté scientifique de plus en plus inter connectée en recherche INRA-Animal Health Division

Les partenaires des départements Principales tutelles Ministère de la Recherche, Ministère de l’Agriculture (ministère des affaires étrangères - CIRAD), ministère de la santé (Afssa) Les principaux acteurs et partenaires INRA (Départements SA, MICA), ENVs (DGER), CNRS, CIRAD, AFSSA, Universités, Hôpitaux Organismes dédiés à d’autres domaines concernant la Santé Animale : génétique, génomique, physiologie, systèmes de production, clinique, alimentation humaine, sécurité environnementale, économie Département Santé Animale et Microbiologie de la chaîne alimentaire Autres partenaires sur champs spécifiques : ENVs, CIRAD

Département INRA : une structure ouverte et un mode de fonctionnement partagé Département Santé Animale Un « Board » constitué de collègues des différents organismes : INRA, ENVs, AFSSA (Aumont, Benmansour, Boireau, Toutain, Seegers), à terme CIRAD Un conseil scientifique (stratégie, recrutement, évaluation collective), où sont représentés de nombreux partenaires de différentes origines institutionnelle et géographique INRA (SA, MICA, PHASE, GA), ENVs (toutes) CIRAD, AFSSA, CNRS, Inserm, CEA, DGAl, DGER, CGV, GTVD, AFSSA, Universités, Hôpitaux Un staff scientifique très partagé entre différents organismes : Unités mixtes de Recherches, Unités sous contrats :ENV, CNRS, Universités, CIRAD, AFSSA Un GDR en maladies infectieuses animales INRA CIRAD Volonté d’ouverture et de transparence sur nos exigences scientifiques garantes de la flexibilité Une communauté scientifique pour la recherche en Santé Animale et la Santé Publique Vétérinaire

Scientifiques et ingénieurs en postes : 360 Répartition des scientifiques et ingénieurs en postes dans les unités pilotées par le DSA (+ MICA) Scientifiques et ingénieurs en postes : 360 ENVs (27%) INRA (51%) Universités AFSSA CIRAD : 4 % CNRS Autre Inserm Hôpitaux 30 ETP chercheurs en CDD 75 Doctorants (PhD) en postes

Scientifiques et ingénieurs Techniciens & Administratifs Agents permanents (en ETP) dans les unités pilotées par le DSA (+ MICA) 350 300 65 250 112 200 Non INRA 150 INRA 247 100 174 50 Scientifiques et ingénieurs 266 Techniciens & Administratifs 312 Tous corps 578

Missions du Département SA (+ MICA) 1 – Connaissances pour des méthodes de prévention, de contrôle et d’estimation de l’impact des maladies des animaux d’élevage en vue d’améliorer la compétitivité des filières ; 2 - Contribuer à la santé des consommateurs et des populations par l’appréciation, puis la prévention des risques infectieux et toxiques, alimentaires et environnementaux ; 3 - Participer à l’analyse du risque et à l’appui à la décision publique dans le domaine de la santé publique vétérinaire ; 4 - Accroître la cohérence de l’ensemble du dispositif national de recherche en santé animale (comprenant en particulier la formation par/pour la recherche); Des recherches finalisées, sur le long terme, d’amont et d’aval construites sur l’identification de demandes sociétales, en partenariat académique, régalien, industriel et professionnel

« Guidelines » stratégiques Excellence scientifique basée sur de compétences disciplinaires coordonnées et regroupées dans des unités ou des équipes fondées sur des questions biologiques plus que des maladies. Le département assure coordination et transversalités Thématiques sans limite de liste : maladies modèles mais aussi maladies pandémiques, réglementées, zoonotiques émergentes ou récurrentes. Choix « raisonné » et collectif sur la base de collaborations scientifiques (public, privé) et de pertinences scientifique et sanitaire Outils de la biologie moderne à haut débit, « *omics » et biologie structurale (à terme l’imagerie pour l’étude des processus infectieux et toxiques). Continuum allant de la biologie structurale à la modélisation épidémiologique Microbiologie cellulaire, virologie, parasitologie moléculaire et cellulaire, immunologie générique, immunopathologie, génomique animale, pharmacologie, toxicologie des faibles doses et de la chronicité , épidémiologie et modélisation épidémiologique Méthodes de maîtrise variées : vaccins, pharmaceutique, résistance, systèmes d’information pour l’aide à la décision (épidémiologie)

Schéma Stratégique : actions Renforcer des entités (têtes de réseau ou pôles) ayant une identité lisible et reconnue (Virologie francilienne, Pôle santé animale de Tours, pôle de Pharmacologie et toxicologie animale de Toulouse), structuration d’équipes Équilibrer les collaborations avec l’AFSSA et le CIRAD, le CNRS et les universités tout en consolidant le partenariat consubstantiel avec la DGER Renforcer les relations avec les gestionnaires du risque (DGAL, OIE), avec les partenaires de la société civile (filières) et industrie (innovation, R&D, Lyon biopôle) Améliorer, mettre aux normes, ouvrir et partager nos dispositifs Veille stratégique, communication, information (domaines embryonnaires de l’organisation des départements) Politique plus construite à l’international (Global Animal Health, 7ième PCRD, SCAR, ERA Net, labo bi-nationaux) Réseau français en santé Animale : une suite logique et naturelle de la stratégie déclinée depuis 7 années

Les compétences du DSA (+MICA) ( 01/01/08) 10 20 30 40 50 60 70 80 90 Gestion Département SA INRA Non INRA Plate formes et logistiques Modèles animaux et pathologie comparée Pharmacologie Toxicologie Épidémiologie Maladies vectorisées par les arthropodes Parasitologie Immunologie Maladies bactériennes (hors ABD) Virologie (hors épidémiologie) Prions, TSE (hors épidémiologie)

Les compétences du DSA (+MICA) ( 01/01/08) Immunologie Parasitologie Maladies bactériennes (hors ABD) Maladies vectorisées Épidémiologie Pharmacol.-Toxicol. Virologie (hors épidémiologie) Animaux modèles & pathologie comparée Prions, TSE (hors épidémiologie) Plate formes & logstique Gestion Animal Health Division

Périmètre des recherches de l’INRA et de ses partenaires d’UMR Tous les agents infectieux et toxiques, xénobiotiques d’intérêt en santé animale, troubles locomoteurs des chevaux Tous animaux de production (comprenant les poissons et les chevaux) Animaux de compagnie avec les ENVs uniquement dans des problématiques de santé publique (toxicologie, zoonoses) Animaux modèles : biologie fondamentale, modèles de pathologie humaine (en général étudié avec les ENVs) : myopathie, cancers, maladies de la pléthore et de la longévité (diabète, artériosclérose, dégénérescence maculaire, etc…) Méthodes de contrôle : innovation en diagnostic, vaccins, méthodes de prévention, thérapeutiques et usage des médicaments Bien être et souffrance : Département PHASE

Structures: 3 UR, 12 UMR, 3 USC, 1 UG, 01/01/08 Nat. Vet. Sch. Alfort JRU BIPAR (Univ,AFSSA,NVS,INRA) helminths, protozoa, fungi, arthropod borne disease JRU Virology (AFSSA,NVS, INRA) emerging and zoonotic vrus JRU BPLC (INRA NVS) : Equine Locomotors Pathology Animal Health Centre, Tours RU IASP: Virus, prions, bacteria, parasites, Zoonoses, immunology, infection & immunity, pathology JRU IPV (Univ) : Immunology, vaccine, Toxoplasma Jouy en Josas RU VIM : Mol virology, immunol., prions, fish pathology UMR1157 VMS (INRA CNRS) : Structural virology Nat. Vet. Sch. Nantes JRU BIOEPAR (INRA-NVS) -GSA : epidemiology, economy - CAE : antibiotics & aqua Env. - IHPM: parasites, ticks, ABD JRU IECM : Diabet & immunity JRU DPTM : Geno-therapy, myopathy, anatomy and pathology Alfort Reims Jouy-Gif RU Phlebotomes (Univ), vector of Leishmanii Nantes Tours LYON, Gerland, N. V. Sch. JRU RPC (Univ, INRA, NVS, EPHE): Lentivirus JRU MTCX (NVS, INRA): Mycotoxins ,rodenticids Bordeaux Theix Lyon Bordeaux JRU GDPP (BCU SA) Univ INRA Mycoplasms of man & animals Montpellier Theix RU EpiA: Epidemiology, emerging dis. RU Mic (MICA): Dig. bacteria, E coli Toulouse Nat. Vet. Sch. Toulouse Centre of toxicology RU PT: pharmacology, toxicology, mycotoxins JRU PTE (INRA NVS): Pk/Pd, Physio- Tox JRU IHAP (INRA, NVS): Infection and immunity, TSE, Virus(pox), Mycoplasm, parasites, E coli Montpellier CIRAD BCU-UR 5: Tropical infectious diseases, arthropod borne disease

Coordination par tête de réseau Ile de France Virus et maladies virales, thématiques Coordination par tête de réseau Ile de France Influenza aviaire, comprenant aussi réponses de l’hôte, programme agro vétérinaire DGAl INRA AFSSA CIRAD Lentivirus, CaeV, VmV, JSRV, IAEV. Herpes virus : Mareck VD, Aujesky Virus, simplex virus Maladies virales émergentes (FMD, Borna Virus, West Nile Virus, Hepatite E, avec AFSSA) Rotavirus, flavivirus Virologie structurale (rhabdovirus, bacteriophage, VSV, etc..) RSV, BTV : vaccinologie Adenovirus, pox virus, vectorologie Maladies virales des poissons : NHI (Rhabdovirose), SHV, Maladie du sommeil et maladie pancréatique Nat. Vet. Sch. Alfort JRU Virology (AFSSA,NVS, INRA) Adenovirus, vaccine vectors Emerging and zoonotic virus (Borna virus, hep E) National reference lab (SVD, FMDV, BTV, WNV, … Jouy en Josas, INRA RU VIM : Mol virology, immunology Respiratory Virus (RSVB, IA) Birnavirus, Viruses of fish, Integrative virology of PRV Structural biology of viruses Gif.Yvette, CNRS RU VMS (Univ) Structural virology (rhabdo, alph,a Phage) Rotavirus, herpes virus Methodology in structure Alfort Jouy Gif Animal Health Centre, Tours RU IASP Avian Virology (MDV, IA) Tours LYON, Gerland JRU RPC (Univ, INRA, NVS, EPHE): Lentivirus, WNV international network on Lentivirus Lyon Nat. Vet. Sch. Toulouse JRU IHAP (INRA, NVS): Pox virus, vaccine vectors Emerging viruses in web footed Montpellier Toulouse Montpellier CIRAD Virus from the souths IA, PPRV, paramyxovirus, ASF

Maintenir la vigilance Prions, maladies à prions Maintenir la vigilance BSE, tremblantes, cas atypique Déterminants structuraux et moléculaires Physiopathologie Épidémiologie Jouy en Josas, INRA RU VIM : Mol virology, immunology Cell models, transgenic animal models Physiopathology Strain diversity Biophysic and structural biology of PrP Nat. Vet. Sch. Alfort JRU Virology (AFSSA,NVS, INRA) Prions strain diversity Alfort Animal Health Centre, Tours RU IASPETIC Genetic basis and physiopathologic impact BSE, scrapies Animal experimentation Jouy Tours Theix, RU EpidA) Epidemiology Theix Nat. Vet. Sch. Toulouse JRU IHAP (INRA, NVS): Physiopathology Impact of Genetic selection Scrapies in sheep and goat Diagnostic Toulouse

Bactéries, maladies bactériennes, thématiques Résistance aux antibiotiques, génomique E coli (EPEC, EHEC, ..), E coli aviaires Mycobacterium avium paratuberculosis (réponse immune, diversité, virulence) Bartonella (virulence, diversité), Ehrlishia Salmonella (portage, virulence) Mammites (staphylococcus) Mycoplasmes (diversité, virulence, génomique) INRA CIRAD AFSSSA ENVs Maladies bactériennes des poissons, génomique Flavobacterium Listeria, Brucella, Coxiella, Chlamydia (historique) Animal Health Centre, Tours RU IASP: Salmonella (carriage), E coli (avian) Mycobacterium avium paratuberculosis Antibiotic resistance Mammites (staphylococcus) Coxiella, chlamydia, Brucella, Listeria Nat. Vet. Sch. Alfort JRU BIPAR (Univ,AFSSA,NVS,INRA) Bartonella Jouy en Josas RU VIM Flavobacterium, bactérioses des poissons Alfort Nat. Vet. Sch. Nantes JRU (INRA-NVS) BIOEPAR Antibiotic resistance, epidemiology JRU (INRA-NVS) SECALIM Campylobacger resistance Jouy-Gif Reims Nantes Tours Theix RU Mic (MICA): Dig. bacteria, E coli Montpellier CIRAD BCU-UR 5: Erhlischia, arthropod borne disease Bordeaux Theix Lyon Bordeaux JRU GDPP (BCU SA) Univ INRA Mycoplasms of man & animals Montpellier Nat. Vet. Sch. Toulouse Centre of toxicology JRU PTE (INRA NVS): antibiotic resisitance JRU IHAP (INRA, NVS): Infection & immunity, Mycoplasm, E coli Toulouse

Espèces cibles : ruminants, porcs, poule-palmipèdes, poisson Immunologie, immunopathologie Espèces cibles : ruminants, porcs, poule-palmipèdes, poisson Inflammation et immuno-pathologie Immunologie comparée et modèles (souris, Zebra) Immunologie des muqueuses (digestives et respiratoires) Immunologie de la mamelle Immunologie du jeune Immuno-modulation : probiotiques, arthropodes Vaccinologie, induction, vectorisation, délivrance Animal Health Centre, Tours RU IASP, JRU IPV Avian immunology ( IA) Swine immunology Immunology of the young Digestive mucosal immunity Immunopathology of mastitis Immunopathology of MAP Vaccine against Toxoplasma Vaccine against different bacteria (Brucella, Coxiella) Nat. Vet. Sch. Alfort JRU Virology (AFSSA,NVS, INRA), JRU BIPAR Vaccine responses (adenovirus vectors,BTV, Trichinella) … Jouy en Josas, INRA RU VIM : Mol virology, immunology Systemic response to virus Mucosal immunity (respiratory) Fish immunity Comparative immunity Alfort Jouy Tours Nat. Vet. Sch. Toulouse JRU IHAP (INRA, NVS): Pox virus, vaccine (BTV) Genetic variability of animal response to mastitis & nematodes Montpellier Toulouse Montpellier CIRAD Immunomodulation response to pathogen tansmitted by arthropod Vaccine PPCB, PPR

Thématique en « renaissance » limitation du nombre de modèles Parasites, maladies parasitaires, thématiques Thématique en « renaissance » limitation du nombre de modèles Protozoaires Coccidioses aviaires Toxoplasma gondii Histomonas (en fermeture) Protozoonoses hydriques et alimentaires : Gardia, Cryptosporidia, Trichinella, avec AFSSA Babesia (avec maladies transmises par les tiques) Trichostrongylidae : génomique, virulence, résistance génétique, résistance aux anthelminthiques Aspergillose aviaire Animal health Centre, Tours RU IASP, JRU IPV Ecology and genomics of nematodes, virulence, anthelmintic resistance Metabolism of anthelmintics in parasites Genomics of Eimeria Interactions Poultry - Eimeria and control Vaccine control of Toxopasma Nat Vet Sch. Alfort JRU BIPAR Diagnostic, diversity, virulence of parasites of interest for food and water safety (Trichinella, Toxoplasma, Cryptosporidum) Physiopathology of Aspergillosis Alfort Reims Tours Nantes Theix Lyon Toulouse Montpellier Toulouse, Nat. Vet. Sch. Toulouse JRU PTE (INRA, NVS), RU PT Pk/Pd, Metabolism of anthelmintics, and resistance

Maladies transmises par les arthropodes Thématique nouvelle, base essentielle des liens avec le CIRAD (réseau INRA ENVs, vectopôle Montpellier) Maladies transmise par les tiques Ixodes, amblyoma, Bartonella, Babesia, Ehrlishia Génomique vecteur, génomique agents pathogène transmis, écologie, épidémiologie Fièvre catharale ovine : Entomologie, épidémiologie, virologie, vaccinologie, insecticide, Phlébotomes Nat Vet Sch. Alfort JRU BIPAR Tick transmission competence Bartonella genomics Nat. Vet. Sch. Nantes, INRA JRU BIOEPAR (previously IHPM) Biology and genetics of Babesia Population dynamics and ecology of tick population (Ixodes Alfort Reims Tours Nantes Theix University of Strasbourg and Reims Phlebotoms ecology and populations dynamics INRA RU, Epi A Epidemiology of arthropod Borne disease (Ticks, Chik, BTV) Toulouse Montpellier Montpellier CIRAD (USC CIRA/INRA) Arthopod Borne disease (cowdriosis) BTV Immunomodulation of host responses Dynamics of arthropod populations Toulouse, Nat. Vet. Sch. Toulouse JRU PTE (INRA, NVS), RU PT Insecticides

INRA Human Nutrition Division Pharmacologie et toxicologie Pharmacologie vétérinaire (Pk/Pd) contaminant de la chaîne alimentaire, faibles doses, contamination chronique, contamination multiple Résistance aux antibiotiques et antiparasitaires, pharmacologie Endectocides : relation devenir / efficacité / résidus / déterminants de la pharmacocinétique (transporteurs, lipoprotéines) chez petits ruminants Fipronil : devenir et perturbation endocrinienne chez le rat et le mouton, transcriptomique chez la souris  Rodenticides : réponse du nuisible, résistance génétique Fumonisine B1, Penicillium, Zéaralénone : devenir et impacts chez le porc Trichothécènes (DON) : réponse immunitaire du porc, transports transmembranaires Patuline et toxines d’A. fumigatus : toxinogenèse moléculaire Perturbateurs endocriniens ou métaboliques contaminants de la chaîne alimentaire : mycotoxines, plastifiant, bisphénol A, polybromés Nat Vet Sch. Lyon JRU MTCX Mycotoxins transport in tissue and cell Ecotoxicology (rodenticides and genetic resistance of rodents to AVKs Nat. Vet. Sch. Nantes, INRA JRU BIOEPAR (previously CAE) Pk/Pd of antibiotics in fish .Spreading antibiotics in the environments Nantes INRA Toulouse UR PT Anthelmintics pharmacology and metabolism Mycotoxins : metabolism, distribution and impacts Food contaminants, endocrine disruptors Integrative toxicology : molecular and cellular impacts of contaminants Nat. Vet. Sch. Toulouse JRU PTE (INRA, NVS): Modelling in pharmacology, Pk Pd Pharmacology an antibiotics resistance Insecticides Food contaminants, endocrine metabolism, endocrine disruptors Lyon Toulouse INRA Human Nutrition Division

Epidemiologie Domaine en émergence depuis 6 ans Modélisation épidémiologique, vers l’économie Scrapie , BSE Arthropod borne diseases (Bartonella, WNV, BTV, CHIKV) Maldies d’élevage : BDVD, syndromes repiratoires Portage Salmonelles, Camplylobacter en filière porcine et aviaire Résistance aux antibiotiques, diffusion dans l'environnement Zoonoses (Inf Aviaire, Coxiella, Trichinelloses, MAP) Observatoires du vivants, maladies émergentes, liens avec faune sauvage Qualification sanitaire de région ou de filière Économie de la santé (en construction) Nat. Vet. Sch. Nantes, INRA JRU BIOEPAR (previously GSA) Assessment of health (food borne pathogen carriage) status and risk in farm animal populations. Modelling of transmissible pathogens spread and of health disorders occurrence in farm animal populations Economic evaluation of impacts of health disorders & economic assessment of control strategies in farm INRA Clermont - Theix RU EpiA Detection and analytical epidemiology of emerging diseases (EMERG) Epidemiology and modelling of TSE and arthropod borne diseases Methods in epidemiology and statistics Nantes Tours Theix LYON, Gerland, RTRA, Nat vet Sch. Lyon Wild animals and epidemiology Ecology and emerging diseases Lyon Nat. Vet. Sch. Toulouse JRU PTE (INRA, NVS): Skills in modelling & probability Toulouse Montpellier Montpellier CIRAD Spatio temporal modelling Emerging diseases from the Souths

Une politique d’ouverture des plateaux et plateformes, accès aux plateaux des «pôles» Plate forme d’expertise et de formation en anatomie pathologique Adossé à DTPTM à ENV Nantes et board européen Outils d’imagerie et de chirurgie des pôles et centres Outils « omic » des pôles INRA et génopôles (recrutement d’ingénieurs) Unités expérimentales

Dispositif expérimental: 4 UE, une connexion avec les dispositifs partenaires Centre Animal Health, Tours EU 1277 PFIE : A2, A3, isolators All size animals (from rodent to horses / cattle), except pets, fish & primates INPREST National shared plat form European Network of Experimental contained capacities Nat. Vet. Sch. Alfort JRUs Vir-BIPAR (AFSSA-NVS), rodent, cats, dogs, A3, A2 JRU BPLC, CIRALE, Exp facilities of AFSSA Spécialisation et professionnalisation des UE (lignées tous formats, infectiologie A2-A3-Isolateurs) Des investissements financiers (18 Meuros) et humains Restructuration et mise aux normes, INPREST, recrutement et redéploiement en cadres A Réseau national (Hub) pour les UE INRA de Tours Jouy Ouverture à la communauté nationale et européenne Ouverture public et privé, respect de la confidentialité Projet européen des « experimental capacities » associant l’AFSSA Jouy en Josas EU UEP: fish (trout) A2, (A3), SPF EU UEAR: rodents, SPF, A2, A3 GMO, transgenesis capacities Caen Nat. Vet. Sch. Nantes Centre of medical biotherapy A2, A3, dogs, cats, rodent primate Fish experimental facilities (medium-size fish) Alfort Jouy Tours Nat. Vet. Sch. Lyon JRU MTCX : wild rats, vivarium NVS Lyon “Institut Bourgelat” Mild size animals, A2 Nantes Magneraud Magneraud EU EASM (PHASE Div) Alternative farming, poultry, rabbit Bordeaux Theix Lyon Toulouse Nat. Vet. Sch. Toulouse JRU IHAP : Rodent, mild size animals, A2, A3, JRU PTE : A1, dogs, cats, horses, insectarium, Toulouse Tournefeuille RU PT : rodents, medium-sized animals, A2, SPF

Objectifs : partenariat filières recherche Directoire opérationnel GIS AGENAE : ean-François BAROILLER CIRAD-EMVT Patrick CHARDON INRA-GA Claude CHEVALET INRA-GA Catherine CHRISTOPHE INRA-MIA Madelaine DOUAIRE INRA-GA Yann GUIGUEN INRA PHASE François HATEY INRA-GA Patrice MARTIN INRA-GA Philippe MONGET INRA-PHASE Yves ROGER-MACHART INRA-PHASE Pierre SELLIER INRA-DSAPA Marine LEVADOUX CIPA Bernard COUDURIER SYSAAF Konenraad DUHEM CNIEL Bernard GUERIN UNCEIA Jacques LUCBERT IE Alain MALAFOSSE UNCEIA Jean-Claude MOCQUOT IE Michel SOURDIOUX GENE+ Anne LACOSTE ITP Jean CHAMPAGNE ITAVI Thierry SIMON UNCEIA Objectifs : partenariat filières recherche Exploiter les génomes et la génomique Mobiliser les ressources de Bioinformatique, génomique comparée, biotechnologie Soutiens aux programmes finalisés et génériques (ANR -Genanimal) Quelques programmes et projets Stress chronique et pathogène en aquaculture Sélection intense et émergence de nouveaux pathogènes (porcs) Résistance génétique au mammites Résistance aux maladies virales chez la truite Gene-aviflu : réponse au vaccins Vaccinologie contre la Blue Tongue

Le réseau AGRI-bien-être animal www.tours.inra.fr/bien-etre Créé par l'INRA en 1998, regroupe les chercheurs en bien-être animal, soit 78 INRA: dépts PHASE, GA, ALIMH, SA, SAE2 58 non INRA: universités, grandes écoles, Instituts techniques,,… Objectifs Construire une culture commune (3 séminaires/an) Harmoniser les approches, coordonner les recherches (au départ financement de projets). Thématiques prioritaires : comprendre les attentes sociétales, identifier les émotions des animaux, préciser les outils d'évaluation du bien-être, identifier les facteurs de variation (génétique, expérientiels), mettre au point des solutions permettant de concilier bien-être et production. Améliorer la visibilité des recherches françaises (projets européens) Renforcer la formation (interactions avec écoles/univ.), le transfert des connaissances (contribution à des expertises), le dialogue science-société (ouverture des séminaires)

Vet. Res. : A journal on animal infection & epidemiology Veterinary Research (3.152 ) Un journal soutenu par le Département Santé Animale 3.5 (2/128) 3.0 2.5 (4/123) (2/129) (4/129) 2.0 (6/120) (3/128) (10/127) Impact factor 1.5 1.0 0.5 (24/129) (33/139 (41/103) ) (59/87) 0.0 1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 Veterinary Research American Journal of Veterinary Research Veterinary Immunology and Immunopathology Veterinary Parasitology Veterinary Microbiology Vaccine Preventive Veterinary Medicine Vet. Res. : A journal on animal infection & epidemiology Un nouveau projet d’édition basée sur l’open access et un partenariat mixte en 2009

Un bureau de veille stratégique et scientifique Objectif Meilleure connaissance de la demande sociétale et formalisation des questions Développement du partenariat d’orientation Communication sur les produits scientifiques du Département SA (in WOS) Et autres produits de développement et de support technique Principes Définition de cibles, et construction d’outils Web spécifiques et dédiés (RSS flux) , élaboration et entretien de bases de données par des veilleurs et modérateurs Web Sites en production VERSA : veille réglementaire en expérimentation animale bio confinée, éthique Visa : outil intranet veille industrielle, l’intelligence économique et PI en santé animale et santé publique vétérinaire (brevets,, licences, entreprises, etc…) VeliSA : Littérature francophone technique en santé animale (internet) @genda : Veille événementielle pour la recherche en santé animale Free-Archives for Veterinary Research Web sites en développement Datanet : Références d’expertises du département Santé Animale (inranet) Produits du département Santé Animale (internet) PortSA: Portail de la santé animale en France pour le partenariat d’orientation