Gestion des exploitations agricoles. Travail de génétique Gestion des exploitations agricoles. Travail de génétique. 2ème doctorat DELAHAIE Thomas KABERGHS Julien SINDT Mathieu

I) Étude de texte / Actualité peste aviaire Résumé partiel d’éléments utiles du texte: « Pathogens and parasites: insights from evolutionary biology » -Prévalence du parasitisme: notion de niche écologique : Milieu terrestre, eau douce, eau de mer MAIS aussi et surtout organismes vivants!!!

-Perspective d’évolution: l’hypothèse de la reine rouge: Dans Alice au pays des merveilles, la reine rouge, une pièce d’échec, entraîne l’ héroïne dans une course effrénée : -Alice : « mais reine rouge, nous courons vite et le paysage autour de nous ne change pas ! » -la reine : « nous courons pour rester à la même place » Nécessité d’évoluer pour survivre (pour l’hôte ET pour le parasite)

-Diversité génétique des virus (et bactéries): « antigenic drift » « antigenic shift » Ex:Influenza A,B et C (peste aviaire=>A) A: HnNm (16H et 9N) 1) Antigenic drift (dérive): Accumulation de mutations (surtout H)=>épidémie 2) Antigenic shift (cassure): réassortiment des segments=> pandémies Le virus influenza a 8 segments d’ARN! Une cellule infectée simultanément par deux virus différents peut être à l’origine de réassortiments=> mélanges génomiques viraux=>Hybrides

PORC= « mixing vessels » entre les formes humaines et aviaires (possède les récepteurs pour les deux types de virus), l’hybride obtenu pourrait passer ainsi à l’homme. On a eu aussi le cas d’une transmission directe de peste aviaire à l’homme sans intermédiaire. (1997, Hong-Kong) Virus=> excréments porcs et canards en aquaculture=> poissons!!

-Perspectives historiques: Nouvel environnement pour les micro-organismes => contact hommes/animaux (10.000 ans) =>transmission inter-espèces plus aisée

-Grippe espagnole(1918) : ? +++meurtrière Provient entièrement d’un virus aviaire: H1N1 1889 1900 1918 1957 1968 1977 2005 H2N2 H3N8 H1N1 H2N2 H3N2 H1N1 H1N1 H2N2 H3N? H5N1 ? ?

Espèces touchées (virus de la grippe) : humains, chevaux, porcs,phoques, oiseaux => Attention migration!! 1er passage oiseau - homme: 1997 Difficilement éradicable car bcp de sous-types présents dans les réservoirs (oiseaux aquatiques)

B) Conclusion sur l’étude du texte: Thème du texte très (trop!) vaste (ensemble des micro-organismes) clarté scientifique- nombreuses explications virologiques Surtout données épidémiologiques (peu de génétique) Historique des grippes intéressant. Intérêt du texte: Montre avec clarté la façon d’évoluer des virus. Vue d’ensemble de la problématique des virus de la grippe => Texte destiné à un public large !

II) Mécanismes d’évolution et adaptation des virus influenza.

Propriétés des virus influenza A: Peu résistants dans le milieu extérieur Inactivés par les détergents Inactivés par la chaleur Conditions de transmission: Par voie aérogène Pathogène: digestif primaire, respi secondaire

Hémagglutinine et neuraminidase H=>récepteur d’acide sialique (site de liaison) Peptide de fusion (activé après clivage) Site de clivage par des protéases (déterminant de pathogénicité) N=>Site actif pour le clivage de l’acide sialique

Variabilité des virus influenza Virus influenza: orthomyxoviridae -Types A,B,C selon l’antigénicité de la nucléoprotéine -Sous-types (de A): HnNm, selon l’antigénicité de HA et NA HA: 16 sous-types (aviaires) NA: 9 sous-types (aviaires) Virus influenza A -aviaires; porcins;humains; (équins;mammifères marins)

Variabilité du virus influenza A humain Dérive antigénique -accumulation de mutations ponctuelles dans l’hémagglutinine -épidémies limitées de grippe saisonnière Cassure antigénique -Réassortiment de segments génomiques -Implication au moins d’un changement complet d’hémagglutinine - »Pandémies » 

Co -infection par deux virus différents Échanges de segments génomiques Apparition de nouveaux virus hybrides par réassortiment Intérêt de la vaccination contre grippe humaine

Origine d’un nouveau virus humain: -Adaptation par mutations d’un virus aviaire -Hypothèse du porc comme « mixing vessels »: ->Réassortiment entre virus influenza A aviaire et humain chez le porc ->En asie.

Bibliographie: -Gregory G. DIMIJIAN,The University of Texas Southwestern Medical Center at Dallas: Pathogens and parasites: insights from evolutionary biology  -La grippe aviaire: Actualités et mises à jour des connaissances, formation AFSCA, Liège, le 27/10/05 -Pr Etienne THIRY, FMV,Ulg : les virus influenza: les mécanismes de leur évolution au cours du temps et leur adaptation aux espèces domestiques

ET VIVE LES BELGES!!!