Comment écrire un article scientifique ?

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Transcription de la présentation:

Comment écrire un article scientifique ? Philippe Soyer Service de Radiologie Viscérale & Vasculaire Hôpital Lariboisière-APHP & Université Paris 7

Le fond

Pourquoi publier ? Mémoire (répertorié, e-banques de données) Information (connaissance nouvelle, utile) Rôle pédagogique (éducatif) Rôle promotionnel (renommée, reconnaissance, Impact Factor, SIGAPS)

Qu’écrire? (1) Cas clinique (case report) Petite série (> 3 cas) Article original (nombre important, technique nouvelle, nouveau signe) Note technique

Qu’écrire? (2) Question préliminaire: « Qu’apportera votre travail à la connaissance actuelle ? » Connaissance du sujet abordé Recherche bibliographique Recherche par mots-clés (in English) PubMed http://www4.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi

Y-a-t-il une étude idéale ? Descriptives vs. comparatives Recherche pure (modèle animal) Recherche clinique

Comment améliorer ses chances ? Problème large de santé publique (cancer du colon) Série importante d’une maladie rare (maladie celiaque, Peutz-Jeghers) Apport d’une nouvelle technique (IRM de diffusion) Etude qui ne prête pas à discussion Solidité (prospective, pas de biais, standard de référence solide) Statistiques solides Ecriture maitrisée

Où publier ? 90 revues radiologiques Idéalement, une « grande revue » Impact factor (Radiology) Rapidité du reviewing (Radiology, Eur Radiol) Rapidité de publication (online first) Ne pas négliger le Journal de Radiologie ni les revues de spécialités

La forme

Comment écrire ? Travail “littéraire”, prose scientifique Les règles de l’écriture scientifique (indications aux auteurs) La technique de l’écriture (clarté, ne pas traduire le français si l’on écrit en anglais) L’expérience Se soumettre aux règles du jeu : les “reviewers”

Règles de l’écriture médicale et scientifique Être lisible pour être lu et surtout compris Fond et forme sont indissociables Phrases courtes Annoncer le fait principal Respect des temps de conjugaison Des liaisons appropriées (logique, fluidité) La concision (le reviewer est débordé !) La clarté et la précision du style (mots choisis, éviter le verbiage consternant, la jargonophasie, les évidences, les paraphrases)

Les différentes catégories d’articles Article original Revue générale et mises au point Revues iconographiques Faits cliniques Notes techniques Editoriaux Lettres à l’éditeur

Les différentes catégories d’articles L’article original Objectif principal : rapporter un fait nouveau, non encore publié, ou apporter un nouvel éclairage Dans tous les domaines il existe des sujets inexploités (recrutement particulier, technique spécifique, expertises locales) Le savoir-faire : montrer (ou faire croire) en quoi le travail est novateur (se faire « mousser »), trouver un angle particulier, une niche Résultats fondés sur une série conséquente

Les différentes catégories d’articles La revue générale et la “mise au point” Fixe l’état de l’art d’un sujet mais devrait idéalement suggèrer des orientations nouvelles Rassemble les arguments critiques parus dans la littérature, en discute la pertinence et ajoute des commentaires suggérés par sa propre expérience (état des lieux) Nécessite une expérience importante sur le sujet, souvent sollicitée par le comité éditorial

Les différentes catégories d’articles La revue iconographique Pictorial essay Variante brève des revues générales publiées par les journaux radiologiques Illustre les principaux aspects iconographiques d’une pathologie ou d’une technique. Le message pédagogique est apporté par l’image Texte réduit à l’essentiel et les références au minimum (10 en général) Privilégier une forme originale de présentation (apport des reconstructions en MIP dans les hémorragies digestives)

Les différentes catégories d’articles Le fait clinique (Case report) Acceptable si et seulement si il apporte des éléments originaux Intense compétition Peu de revues les acceptent Idéalement, regrouper des cas similaires de plusieurs centres pour transformer des faits cliniques en petites séries plus facilement acceptées

Les différentes catégories d’articles La note technique Décrit brièvement une nouvelle technique (fusion d’image pour le staging TNM), la modification d’une technique existante (nouveau système d’ancrage plus simple pour gastrostomie) ou un nouvel équipement (Fluoro-TDM basse dose) Démarche scientifique moins exigeante L’innovation prime

Les différentes catégories d’articles L’éditorial Traite brièvement d’une question précise pour en faire le point et la critique Bref et souvent rédigé par un des membres du comité éditorial de la revue Apporte un éclairage particulier sur un des articles publiés dans le journal

Comment rédiger un article original ?

Article original Plan de base Le titre, les auteurs Le résumé et les mots clés L’introduction Matériel (patients) et Méthode Résultats Discussion Conclusion Références bibliographiques Tableaux Figures

Article original Titre & Auteurs Traduit clairement l’objet de la recherche Ouvert, court et attractif (doit être « sexy ») Auteurs et ordre des auteurs Ceux qui ont contribué à la recherche (acquisitions des données, lecture, statistiques, écriture) Premier auteur : celui qui écrit Dernier auteur : initiateur (en théorie) En fonction de l’importance de leur contribution (idéalement) Choix stratégique

Article original Introduction Contenu Décrit brièvement l’état du problème, les questions posées et le problème à résoudre Pose la question et annonce les moyens utilisés pour y répondre (Le but de notre étude a donc été de …) Forme Rôle majeur (accroche, le reviewer est débordé! Il faut le mettre de bonne humeur ) Courte, justification logique (pourquoi avez-vous fait cette étude?) Références appropriées

Article original Matériel & Méthode (1) Matériel (patients) et méthode Décrit dans un ordre logique et/ou chronologique le déroulement de l’étude Les détails permettent aux reviewers d’apprécier la rigueur du travail (il n’y a jamais trop de détails) Renseigne les reviewers sur les méthodes utilisées pour l’évaluation des résultats, les techniques de mesure, les critères de jugement

Article original Matériel & Méthode (2) Matériel (patients) et méthode Type d’étude (rétrospective ou prospective, cas-témoins) Critères d’inclusion et d’exclusion (comment avez-vous trouvé vos patients, chart flow diagram) Démographie (sex ratio; ages avec moy ± SD, extrêmes; pathologies associées) Techniques d’imageries, analyse des images (indépendante, consensuelle, aveugle) Standard de référence (vérité, exactitude, anapath ou consensus)

Article original Matériel & Méthode (3) Matériel (patients) et méthode Statistiques valides (petits effectifs) Test de puissance (si absence de différence significative) Comité d’éthique, consentement des patients Anonyme

Article original Résultats Brefs et clairs Tableaux et graphiques sont souvent indispensables mais ne doivent pas être redondants avec le texte Proportions, % et 95%IC Se, Sp, VPP, VPN, Ac Résultats statistiques bruts (c’est ou ce n’est pas significatif) avec le test utilisé et la valeur de p On ne discute pas!

Article original Discussion What’s new ? Compare les résultats de l’étude avec ceux de la littérature (convergents et divergents, et donne des explications) Limites de l’étude (biais, faiblesses, faible nombre). Coupe l’herbe sous le pied des reviewers qui sont là pour disséquer voire même « casser » votre travail  Conclusions fondées sur les résultats et seulement les résultats

Article original Conclusion Courte, précise, concise On évitera «notre étude démontre que» mais on écrira plutôt «notre étude suggère que» Reprend la question posée et donne la réponse mais en soulignant les limites Dont be arrogant, be modest ! Dont speculate !

Article original Résumé 200 à 250 mots (selon la revue) Objectifs (comme dans l’article) Matériels et méthodes Résultats (bruts) Conclusion (comme dans l’article) Abstract Mots clés (français & anglais, MeSH)

Références Se conformer aux recommendations de la revue (ne pas copier-coller PubMed) Limitées en nombre (30 pour certaines revues) Attention aux erreurs (auteurs, abbréviations, année, pages) Citer si possible le journal Citer le Journal de Radiologie

Les tableaux Conformes aux recommendations Détaillent les résultats Titre clair et appelés dans le texte Apportent de la lisibilité Ne doivent pas dupliquer le texte Ne pas mettre de lignes verticales Expliquer les abbréviations (notes)

Les figures Illustrent le texte et donnent du poids à l’étude Sélection rigoureuse, peuvent faire rejeter un article Imagerie, Anapath, Micro Qualité minimale indispensable (TIFF, niveaux de gris, 300 pixels/inch, 13 cm) Flèches limitées en nombre et en taille Légendes claires

Quelle chance, la deuxième version! Ne pas se laisser décourager ni démonter par les commentaires des lecteurs Les lecteurs sont par essence suspicieux et susceptibles. Certains sont même aggressifs Réponse sereine à tous les commentaires On ne peut pas répondre favorablement à tous Délai de renvoi du manuscript (1 à 2 mois) Quelquefois une 3ème version est demandée Les épreuves (PdF en ligne) la publication et son délai

Le secrétariat de rédaction Le rédacteur en chef (seul juge) Les rédacteurs adjoints (spécialités) Les membres du comité de rédaction Les membres du comité de lecture Chevauchement entre ces groupes

En conclusion Bonne méthodologie Respecter les recommendations Soigner la présentation Ne pas se décourager Etre modeste Ne pas être paranoïaque même si quelquefois il y a de bonnes raisons de l’être