1 Gestion des exploitations agricoles: partie génétique Sources of variation and genetic profile of spontaneous, out-of-season ovulatory activity in the.

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Transcription de la présentation:

1 Gestion des exploitations agricoles: partie génétique Sources of variation and genetic profile of spontaneous, out-of-season ovulatory activity in the Chios sheep Gr 19: Klein Amandine Lecarpentier Florence Ledeganck Frédérique Mathot Mélanie Avdi M., Banos G., Kouttos A., Bodin L., Chemineau P.

2 Sommaire 1.Objectif de l’étude 2.Matériel et méthodes 3.Modèles expérimentaux 4.Résultats de l’étude 5.Conclusions de l’étude 6.Utilité des résultats pour le vétérinaire d’exploitation 7.Critiques et ouvertures

3 1. Objectif de l’étude Cette étude a pour but de déterminer les sources de variation et le profil génétique de l’activité ovarienne spontanée des brebis de race Chios en contre saison.

4 2. Matériel et méthodes Population animale:  Élevage Chios de la station de recherche agricole du Chalkidiki dans le nord de la Grèce, appartenant à l’institut de recherche nationale grecque.  Alimentation: concentrés, trèfle, herbe  Élevage: stabulation libre  Brebis: prolificité  1,8 agneaux/brebis/an production laitière  200kg de lait/lactation (4-5mois)  Saison de reproduction: 21 mai jusqu’à fin novembre Début de la saison de reproduction par l’introduction d’un bélier  effet mâle Accouplement naturel Aucun traitement durant la période d’accouplement  Agnelage: fin octobre à avril  40% de naissances en novembre  Cheptel de remplacement sélectionné sur base du pédigré et des performances phénotypiques.

5 Procédure: Dosage de progestérone dans le sang  2 prises de sang à 10j d’intervalle, début mai (avant la période de reproduction)  Durant 2 années consécutives ( )  Dosage de la progestérone par radioimmunoessai: si > 1ng/ml  activité ovarienne Effectifs:  707 mesures exprimées en mesure binaire  435 brebis  1 bélier/15 brebis  Donc au total 1068 animaux 0=inactivité ovarienne 1=activité ovarienne 272 pendant 2 ans 92 la 1 ère année 71 la 2 ème année 1 ère année: ème année: 343  } brebis à la reproduction

6 3. Modèles expérimentaux Analyse de variance préliminaire: permet de fixer des facteurs ayant des effets significatifs sur la saison de reproduction. Âge et statut de la brebis: 7 groupes Poids vif: 6 groupes Mois de l’agnelage précédent les prises de sang: 6 groupes

7 Modèle animal: estimation de l’héritabilité et de la répétabilité Y ijklm = μ + âge i + poids j + mois k + animal l + pe lm + e ijklm Moyenne de la population Effet fixé de l’âge Effet fixé du poids Effet fixé du mois du dernier agnelage Effet aléatoire de la brebis Variance=Va Effet aléatoire de l’environnement permanent (m) sur la brebis (l) Variance=Vpe Effet aléatoire résiduel =« black box » Variance=Ve Mesure individuelle de l’activité ovarienne spontanée en contre saison Paramètres génétiques:  Héritabilité: h 2 = Va / (Va + Vpe + Ve)  Répétabilité: r = (Va + Vpe) / (Va + Vpe + Ve)

8 Modèle père: estimation de l’héritabilité Y ijklm = μ + âge i + poids j + mois k + bélier l + e ijklm Moyenne de la population Effet fixé de l’âge Effet fixé du poids Effet fixé du mois du dernier agnelage Effet aléatoire résiduel =« black box » Variance=Ve Mesure individuelle de l’activité ovarienne spontanée en contre saison Effet aléatoire du père (l) de la brebis (m) Variance = Vs Rq: 200 béliers pris en compte avec chacun au moins 2 filles dans l’étude ce qui fait en tout 615 observations Paramètre génétique: Héritabilité: h 1 2 = 4Vs / (Vs + Ve)

9 4. Résultats de l’étude Statistiques descriptives moyenne Nombre de mesures sur les brebis % ayant montré une activité ovarienne spontanée30,227,129,0  Nombre de mesures effectuées sur les brebis utilisées pour l’étude  Activité ovarienne spontanée chez les brebis observée sur 2 ans Nombre de brebis272100% Sans activité15456,6% Activité 1 ère année3713,6% Activité 2 ème année3713,6% Activité pendant les 2 ans4416,2%

10 Sources de variations Effet de l’âge des brebis sur l’activité ovarienne spontanée en contre saison Groupes d’animaux: 1: jeunes brebis n’ayant jamais agnelé 2: brebis plus âgées n’ayant pas agnelé la saison précédente 3: brebis ayant agnelé pour la 1 ère fois durant la saison précédente 4: brebis ayant agnelé pour la 2 ème fois durant la saison précédente 5: brebis ayant agnelé pour la 3 ème fois durant la saison précédente 6: brebis ayant agnelé pour la 4 ème fois durant la saison précédente 7: brebis ayant agnelé pour la 5 ème fois ou plus durant la saison précédente

11 Effet du mois du dernier agnelage sur l’activité ovarienne spontanée en contre saison

12 Effet du poids des brebis sur l’activité ovarienne spontanée en contre saison Groupes d’animaux: 1: ≤ 50 kg 2: 50 – 54 kg 3: 55 – 59 kg 4: 60 – 64 kg 5: 65 – 69 kg 6: ≥ 70kg

13 Modèle Nombre d’observations HéritabilitéRépétabilité Modèle animal 707 0,216 (+/-0,084) 0,230 (+/-0,095) Modèle père 6150,291 Paramètres génétiques

14 5. Conclusions de l’étude Variation significative de l’activité ovarienne spontanée en contre saison en fonction de âge de la brebis poids de la brebis mois du dernier agnelage  avec âge mais  après le 3ème agnelage  avec le poids  avec la longueur de l’intervalle agnelage - test Héritabilité obtenue par le modèle animal < modèle père Répétabilité: + de 50% des brebis ayant une activité ovarienne spontanée en contre saison durant la 1 ère année, en ont aussi durant la 2 ème année Étude sur les moutons mérinos d’Arles: résultats similaires  Sélection génétique sur ce caractère possible car il est héritable et comme la répétabilité est proche de l’héritabilité, l’effet de l’environnement permanent est presque nul  opportunité d’un meilleur management de la période de reproduction.

15 6. Utilité des résultats pour le vétérinaire d’exploitation Sélection des animaux sur base de ce caractère génétique et non par croisement Modèle animal et modèle père  même héritabilité donc sélection des brebis et des béliers VT et éleveurs  évolution du management du troupeau (ex: agnelages possibles durant toute l’année…)  adaptation nécessaire Plus d’utilisation de traitements pour induire une activité ovarienne spontanée en dehors de la saison de reproduction (lumière, hormones…)  répond aux attentes du consommateur

16 7. Critiques et ouvertures Critiques de l’étude: Parfois manque de précision dans les explications données (chiffres…) Intérêt de la comparaison avec l’autre étude sur les moutons mérinos d’Arles? Choix du protocole (dosage de progestérone, effectif de la population…) adéquat pour mesurer les paramètres génétiques de l’activité ovarienne spontanée en contre saison Ouvertures: Recherche d’un caractère de substitution plus pratique que le dosage de la progestérone pour la sélection Effets à long terme de cette sélection sur la fertilité et la fécondité des brebis?

17 Merci de votre attention

18 Bibliographie Melpomeni A. et al; Sources of variation and genetic profile of spontaneous, out-of-season ovulatory activity in the Chios sheep in Genet. Sel. Evol. 35 (2003) Cours de premier doctorat de génétique quantitative de Mme Detilleux et de M Leroy