NetBioDyn Et la modélisation multiagents Application à la modélisation de quelques phénomènes immunitaires Cette formation a pour objectif d'utiliser la modélisation multi-agents par  le logiciel NetBioDyn pour faire comprendre quelques aspects fondamentaux du fonctionnement du système immunitaire. Elle présente également un nouveau logiciel qui, par son caractère généraliste, peut être utilisé dans d’autres domaines.

Les ressources? Le logiciel: un applet Java en ligne ou en local http://acces.inrp.fr/acces/logiciels/externes/netbiodyn/logiciel-et-ressources Les modèles http://acces.inrp.fr/acces/ressources/sante/reponse-immunitaire/ressources/biodyn/ Les pistes d’exploitation pédagogique: http://acces.inrp.fr/acces/ressources/sante/reponse-immunitaire/enseigner/enseigner-avec-netbiodyn/ Des didacticiels

Pourquoi modéliser? Utiliser un modèle pour simuler une manipulation non réalisable in vivo Utiliser un modèle pour discuter d’un protocole à mettre en œuvre Utiliser un modèle pour synthétiser des connaissances Construire un modèle

Principe de la modélisation multiagents Créer un système biologique avec plusieurs agents évoluant au cours du temps Chaque agent est une entité informatique représentant une entité biologique possède des comportements est capable d'interactions avec d’autres entités

1. Simuler une expérience Le rôle des LT4 On sait: Les LT4 sont les pivots des réactions immunitaires acquises. On a mis en évidence la nécessité des LT4 pour la production d'anticorps.  Par quel moyen les LT4 interviennent-ils dans la différenciation des LB en plasmocytes sécréteurs d'anticorps.

Utilisation du dispositif de Marbrook On extrait des lymphocytes B et T de la rate d’une souris préalablement mise en contact avec un antigène Z soluble.

Tester une hypothèse L’activation des LB se fait par contact avec les LT4 Conditions exp / résultats attendus Modèle marbrook

Entités et comportements LT4a --------> LT4a + iL Lba + iL ------->Plasmocyte Lba + iL -------> Lba +LBa Contact ou pas

2. Simuler pour bâtir un protocole Comment mettre en évidence une séropositivité? (Test ELISA) Monter un protocole (avant de le mettre en œuvre)

3. Un modèle pour synthétiser des connaissances Humeur…

4. Créer son modèle  Montrer que la phagocytose est plus efficace si des anticorps spécifiques sont présents Définir ses entités Nom Image visible ou non dans le panel Donner un comportement à Chacune Pour enseigner Illustrer En évaluation… En MPS…