Bactéries d’origine animale ou transmises par les arthropodes Pr. A. PHILIPPON Service de Bactériologie, Hôpital Cochin Paris - France Saint-Roch le pestiféré et son bubon suite à une piqure de puce

Maladies en relation avec un réservoir animal maladie des dompteurs maladie des porchers maladie des griffes du chat maladie des animaliers maladie des lainiers maladie des tanneurs maladie des dockers maladie des femmes de chasseurs ...........  Anthropozoonose Hôte accidentel

HABITAT CONTAMINATION CONTACT DIRECT animal domestique léchage, soins griffade, morsure animal sauvage morsure, choc........ simple contact (mort) CONTACT INDIRECT Aliment contaminé, eau ingestion, baignade...... Objets, surfaces contaminés travaux Air Vecteurs tiques, puces............. Très nombreuses situations épidémiologiques différentes Interrogatoire approfondi du malade dont la profession......

* Réservoirs très variés, donc transfert spécifique * Pathogènes stricts (laborantins) * Maladies avec tableaux + caractéristiques DIAGNOSTIC ESSENTIEL 1/Traitement spécifique: Pénicilline, aminoglycosides, tétracyclines, FQ....... 2/ Maladie à déclaration obligatoire (MDO) 3/ Précocité du diagnostic : passage éventuel à la chronicité ....   4/ Aspect épidémique : le pire, une forme pulmonaire 5/ Agents éventuels du bioterrorisme: menace importante (CNR) AGENT BIOLOGIQUE CLASSE 3

Bacillus anthracis, Brucella, Chlamydia, Francisella, Yersinia pestis

MALADIES D’INOCULATION Pasteurelloses Bartonellose (maladie des griffes du chat) Haverhillose

PASTEURELLA Pasteurelloses Pourquoi ? Réservoir: Carnivores avec portage rhino-pharyngé, donc salive ++++ Clinique : morsure ou griffade très inflammatoire * France > 9 millions chiens, 8 millions chats. * Contexte clinique : consultation de chirurgie, centres antirabiques * Plaie très inflammatoire de type phlegmon ou panaris avec notion d'une violente douleur apparue qq heures après morsure. 500.000 plaintes annuelles pour morsure Le chien est un produit de consommation vendu sans mode d’emploi (Pr. Bourdin)

Diverses espèces de Pasteurella dont P. multocida P. aerogenes Histoire du promeneur en forêt renversé en juillet...........

* Aspect morphologique coccobacille G - * D. biochimique Diagnostic clinique/ épidémiologique +++++ Diagnostic bactériologique : Fait en routine 24 - 48 h , plaie avec sérosité * Aspect morphologique coccobacille G - * D. biochimique Antibiogramme: Très sensible, peu de résistance acquise: ß- lactamines, FQ, Tétracyclines

BARTONELLA Maladie des griffes du chat...... Bartonelloses Réservoir: variable Clinique : variable dont adénopathie +++++ Epidémiologie

Diagnostic sérologique: ++++ D. clinique/ épidémiologique +++++ adénopathie, sida, SDF....... D. anatomopathologique : intérêt historique D. bactériologique : long, peu utile en pratique D. moléculaire: PCR Diagnostic sérologique: ++++ Antibiogramme: ???? A pénétration intracellulaire

MALADIES D’ORIGINE ANIMALE TRANSMISES PAR CONTACT Brucellose Tularémie Rouget Charbon

BRUCELLA BRUCELLOSES... POURQUOI ? David Bruce à l’Ile de Malte RESERVOIR : animaux domestiques +++ ou sauvages B.abortus Bovins B.melitensis Caprins,Ovins B.suis Porcins B.canis Chiens B.»marines» Dauphin..... Maladie de la reproduction : Avortement CONTAMINATION: Directe (mains, conjonctive) ou indirecte (lait......) et Diffusion (voie lymphatique) CLINIQUE: fièvre ondulante, fièvre méditerranéenne.........

Diminution du nombre de cas en France grâce à la prophylaxie < 100 cas

DIAGNOSTIC (Agent classe 3) D. clinique/ épidémiologique +++++ maladie professionnelle (MDO) Commémoratifs: ++++++ D. bactériologique : sang, LCR, pus..... 5 jours à 37°C CO2 + (biovars) souvent 3 -5 jours CNR B. melitensis, B. abortus, B. suis.......... Intérêt épidémique D. moléculaire: PCR + Diagnostic sérologique: +++ Nombreuses techniques: Wright, Rose Bengale, FC, IFI.............. Antibiogramme: R.acquise très rare mais à pénétration intracellulaire TET, SM, RIF, SXT...........................

FRANCISELLA TULARENSIS TULAREMIE POURQUOI ? Comté de Tulare (1911) Francis: homme et lapins (1919) RESERVOIR : animaux domestiques, sauvages (rongeurs....) CONTAMINATION: Directe (mains, conjonctive) ou indirecte (tiques) et diffusion (voie lymphatique) CLINIQUE: Maladie des femmes de chasseur, 6 formes ......... lagomorphes Lièvres infectés France - 2004

DIAGNOSTIC (Agent classe 3) D. clinique/ épidémiologique +++++ contexte (MDO), adénopathie, chasseur... Commémoratifs: +++ Laboratoire ++ (hasard+++) D. bactériologique : sang, ganglion, pus..... Gélose chocolat en 3-4 jours à 37°C fin coccobacille à Gram - aérobie et exigeant en cystéine/cystine. Diagnostic sérologique: +++ Agglutination, Wright................. Antibiogramme: SM, G, TET, DOX, FQ................... - CNR : Intérêt épidémiologique F. tularensis subsp. tularensis (USA) F. tularensis subsp.holarctica (Europe) F. tularensis subsp.mediasiatica (Asie)

LE ROUGET DU PORC : Maladie animale rare (vaccin)  Germe tellurique, parasite des mammifères, des oiseaux, des poissons et d’autres animaux aquatiques. amygdales ou dans les nœuds lymphatiques ou au niveau de la valvule iléo-caecale

Maladie humaine devenue maintenant très rare en France transmission directe (porc) ou non (piqure d'arête de poissons, crustacés) Incubation 12-48h: lésion locale (main) d'érysipèle (Rosenbach-Baker)    Complications: arthrites, endocardites Maladie professionnelle Diagnostic clinique (bouchers, éleveurs, pécheurs),

Prélèvements: cutané, liquide d’arthrite, hémoculture Diagnostic bactériologique : Erysipelothrix insidiosa fin bacille à Gram + cultivant facilement sur la gélose au sang (24 h)  

Bacille Gram + fin pouvant présenter des filaments (thrix), non sporulé, immobile, aéro-anaérobie, catalase -, oxydase - . Cultive entre 5 et 44°C à pH neutre en atmosphère enrichie en CO2. Ses exigences métaboliques sont limitées. Aéro-anaérobie facultatif. Pousse sur divers milieux alpha-hémolytique Mueller-Hinton Gélose au sang cuit Bactérie rare à distinguer de Listeria et streptocoques

Caractères négatifs : catalase, oxydase, nitrate réductase, production d'indole, hydrolyse de l'esculine, acidification de l'arabinose, du dulcitol, du glycérol, de l'inuline, du mannitol, du raffinose, du rhamnose, du sorbitol, du tréhalose et du xylose. Caractères positifs : production d'hydrogène sulfuré (TSI ou Kligler), acidification du galactose, du glucose, du lactose et du lévulose. SH2 + API 32 Strepto http://www.bacterio.cict.fr/bacdico/ee/terysiplethrixbis.htm

Traitement : Très sensible aux antibiotiques dont la pénicilline G (10-20 MU) ou amoxicilline FQ (si allergie) - Traitement de 7 J Antibiogramme sur MH au sang frais

Borreliose de Lyme Leptospiroses Haverhillose MALADIES A BACTERIES SPIRALÉES Borreliose de Lyme Leptospiroses Haverhillose

Définition Les Spirochètes définissent une famille de bactéries comprenant trois genres différents (Borrelia, Leptospira, Treponema) comprenant diverses espèces en leur sein dont certaines sont commensales, d'autres pathogènes. Morphologie caractéristique de forme hélicoïdale/spiralée Mise en évidence au plan diagnostique différente *Examen à fonds noir (Treponema pallidum)(A) *Coloration par imprégnation argentique (Leptospira)(B) *Coloration cytologique (May-Grunewald-Giemsa)(B.recurrentis)(C)

Habitat - Pouvoir pathogène Leur habitat est très variable en raison de la multiplicité des réservoirs et des vecteurs possibles, l'homme pouvant être un hôte accidentel Espèce Réservoir Vecteur Maladies B. recurrentis Homme Poux Fièvres récurrentes B. burgdorferi Mammifères Maladie B. garinii sauvages Tiques de B. afzelii domestiques Lyme Leptospira Mammifères sauvages Leptospiroses domestiques Treponema Homme Syphilis, bejel, pian...

B. BURGDORFERI MALADIE DE LYME W. Burgdorfer (1980) découvrit des spirochètes dans tube digestif de tiques = maladie de Old Lyme HABITAT - EPIDEMIOLOGIE Morsure de tiques: Ixodes ricinus, Petit acarien de taille variable Répartition limitée < 1000 m. Foyers endémiques: Alsace, Sarthe Jardiniers, campeurs, marcheurs.... Rôle de la forêt broussailleuse Mammifères : rongeurs, cervidés, canidés, homme.

DIAGNOSTIC Diagnostic clinique +++ Evoqué chez un patient mordu par une tique en région d'endémie en été ou en automme avec érythème chronique migrant, signes neurologiques, troubles de la conduction cardiaque. Diagnostic bactériologique: Très rare Diagnostic sérologique: Très spécialisé . Immunofluorescence indirecte (IFI) . ELISA. MAIS spécificité médiocre (phase initiale). Western-blot ++++ réponse anticorps (OspC, flagelline....) de taille différente: 18 à 93 kDa (IgM, IgG). Technique plus sensible et spécifique donc indiquée lors d'un faux-négatif, ou pour confirmer un positif. Pas d’antibiogramme

LEPTOSPIRA LEPTOSPIROSES *Diversité extrême des réservoirs : - domestiques: bovins, porcins, chiens - sauvages: cervidés, rongeurs (+++) Plus de 230 sérovars, 23 sérogroupes (homme) *Hôtes préférentiels pour certains sérovars = faciès épidémiologique - rats : icterohaemorrhagiae - campagnol : grippotyphosa - chien : canicola - porcs, suidés sauvages et bovins : pomona. Professions particulièrement exposées (maladie professionnelle) Maladie des égoutiers Maladie des porchers.......

EPIDEMIOLOGIE Survie dans l’environnement jusqu’à 6 mois dans l'eau, les sols boueux Modes de transmission à l’homme Pénétration par les muqueuses intactes (conjonctives, muqueuse naso-pharyngée, poumons en cas d’inhalation d’eau) et par des plaies cutanées. Contact direct Avec le germe (personnel de laboratoire), ou avec des animaux infectés ou leurs organes (éleveurs, vétérinaires, employés d'abattoir, bouchers, employés de tanneries...) Morsure de rat

* Contact indirect (le plus fréquent) Travail en environnement contaminé par l'urine d’animaux infectés (égoutiers, agents de voirie, éboueurs, dératiseurs, agents de stations d'épuration, d'entreprises de travaux publics, agriculteurs travaillant en terrain humide ou en rizières, forestiers, ...) Pratique de loisirs aquatiques (baignades, planche à voile, canoë-kayak), de la chasse et de la pêche en eau douce. PLUSIEURS CAS GROUPES

5 sérogroupes identifiés, majoritairement Icterrohaemorrhagiae (62%). Leptospirose en France métropolitaine Été 2003 Enquête sur augmentation des leptospiroses en France (InVS, Ddass, CNR) du 1.6 au 31.8. 39 cas investigués. Premiers signes (maladie) : début juin - fin août , 50 % entre 11 - 24 août. 37 hospitalisés et 2 décès 5 sérogroupes identifiés, majoritairement Icterrohaemorrhagiae (62%). Cas groupés (Aube, Ardennes, Dordogne) Lieux de baignades communs ++++ Mesures de contrôle (interdiction de baignade) prises. Pas de recrudescence de la leptospirose au cours de l’été 2003.

Culture: milieux particuliers à 30°C à l'obscurité durant 2 mois. DIAGNOSTIC Difficile au début, car polymorphisme clinique. En zone tempérée, contexte épidémiologique et bilan biologique non spécifique pour exclure une hypothèse virale. Recherche spécialisée, demande selon la chronologie suivante: culture, PCR, sérologie (> J8) *Hémoculture (J1-J10) *LCR (J7-J14) *Urocultures > J14 ED : bactérie spiralée Culture: milieux particuliers à 30°C à l'obscurité durant 2 mois. Identification précise: espèce, sérogroupe et sérovar intérêt épidémiologique. PCR +++ Diagnostic sérologique ++++ Réservé J8-10 à 3-6 mois, cinétique indispensable (2 fois à 2 S) Pas d’antibiogramme : doxycycline, pénicilline G

Morsures de rat: Sodoku, Haverhillose, Streptobacillose, Fièvre spirillaire Contexte clinique simple: morsure de rat  qui se complique dans les 10 jours mais sécrétions nasales ou urines fièvre +++ , frissons, céphalées, myalgies, arthralgies (syndrome grippal) + rash  

  Diagnostic clinique +++++++ (animaliers, égoutiers......) Diagnostic bactérioscopique: sang, mais bactéries de culture difficile (Spirillum minus, Streptobacillus moniliformis) Traitement simple: plaie et pénicilline G

ou d’avenir................... bioterrorisme Maladies du passé.......................... Saint-Roch, le pestiféré avec son bubon La peste Le charbon ou d’avenir................... bioterrorisme

Yersinia pestis Famille des Entérobactéries. Y. enterocolitica (Inf Yersinia pestis Famille des Entérobactéries Y.enterocolitica (Inf. digestives) Yersin Alexandre 20 juin 1894 à Hong-Kong, isola le bacille de la peste des rongeurs

A quelques heures d'avion de Paris...... Bateau - rat

DIAGNOSTIC D. clinique : bubon Commémoratifs +++ D. bactériologique: = entérobactérie 24-72 h Cliché CDC Cliché CDC DO Classe biologique 3 Mesures Antibiogramme: S, G, T

UNE BACTERIE MEDIATIQUE

BACILLUS ANTHRACIS CHARBON (« ANTHRAX ») Bacille à Gram + sporulé cf Clostridium Maladie animale rare en France, car vaccin ++ sol (champs maudits) peaux laine eau guerre bactériologique bovin, ovin........

Situation en France 200 cas humains en 20 ans Maladie professionnelle MDO Historiquement maladie des lainiers maladie des tanneurs maladie des dockers....

DIAGNOSTIC Diagnostic clinique ++ (Forme cutanée) Forme pulmonaire: hémoculture, ecbc...... Diagnostic bactériologique: +++ 48-72 h BG + avec aspect en tige de bambou colonies R identification biochimique Diagnostic moléculaire: PCR Diagnostic sérologique: sans intérêt Antibiogramme: résistance acquise + (bioterrorisme) Péni G, FQ

Chlamydia, Rickettia, Coxiella Bactéries intracellulaires Culture: cf virologie Diagnostic bactériologique ? Diagnostic moléculaire Diagnostic sérologique +++ Chlamydophila Psittacose-ornithose

Cours sur la peste