J Gaudart 1, E Cloutman-Green 2, S Guillas 3, JC Hartley 2, N Klein 4. Variabilité spatiale de l’aérocontamination bactérienne au lit du patient (Londres,

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1 J Gaudart 1, E Cloutman-Green 2, S Guillas 3, JC Hartley 2, N Klein 4. Variabilité spatiale de l’aérocontamination bactérienne au lit du patient (Londres, UK) 1.Aix-Marseille Université, Faculté de Médecine, LERTIM EA3283, Marseille France. 2. Great Ormond Street Hospital NHS Trust, Camelia Botnar Laboratories, Dpt of Microbiology, London UK. 3. University College London, Dpt of Statistical Science, London UK. 4. University College London, Institute of Child Health, Infectious Diseases and Microbiology Unit, London UK.

2  Jean Gaudart, LERTIM Faculté de Médicine, Aix-Marseille Université EPICLIN2011 2 Introduction Environnement du patient => source d’infection nosocomiale Projet global d’évaluation d’environnements à risque => variabilité spatiale de l’aérocontamination bactérienne dans un service de soins intensifs Introduction Matériel et Méthode Résultats Discussion

3  Jean Gaudart, LERTIM Faculté de Médicine, Aix-Marseille Université EPICLIN2011 3 Matériel 3 unités de soins intensifs (National Hospital for Neurology, London) – Medical intensive treatment unit (MITU) – Surgical intensive treatment unit (SITU) – High dependency unit (HDU) Prélèvements d’air (standardisés) – 26 localisations (lits ou non), 3 temps (1 mois d’intervalle) (sauf HDU) – Mise en culture (37°C, gélose sang) – Comptage du nombre total de colonies (NTC) à 48h Facteurs étudiés – Localisation – Proximité d’un lit – Présence d’un patient – Type de service Introduction Matériel et Méthode Résultats Discussion Matériel Méthode

4  Jean Gaudart, LERTIM Faculté de Médicine, Aix-Marseille Université EPICLIN2011 4 SITU MITU HDU

5  Jean Gaudart, LERTIM Faculté de Médicine, Aix-Marseille Université EPICLIN2011 5 Méthode GLM: avec Loi de la famille exponentielle (ici Poisson) Modèle Additif Généralisé (GAM) où les f(.) sont des fonctions de lissage (splines) => modélise des relations non linéaires Si x 1 et x 2 sont les coordonnées de chaque localisation => modélise la variabilité spatiale des Y i Introduction Matériel et Méthode Résultats Discussion Matériel Méthode

6  Jean Gaudart, LERTIM Faculté de Médicine, Aix-Marseille Université EPICLIN2011 6 « Thin plate splines » : Splines à plaque mince – Estimer une fonction de plusieurs prédicteurs – Sans besoin de spécifier les nœuds ni la base – Recherche une surface lissée la moins déformée possible: =>minimiser le degré de courbure tout en passant à proximité des observations Logiciel R©2.10.1, package mgcv Introduction Matériel et Méthode Résultats Discussion Matériel Méthode

7  Jean Gaudart, LERTIM Faculté de Médicine, Aix-Marseille Université EPICLIN2011 7 Résultats Introduction Matériel et Méthode Résultats Discussion Estimation Prédiction Sampling Date (% explained deviance - n) CofacteurSIR [CI95%]p-value D1 (81.5% - n=19) Non Bedside*1- Non occupied Bedside0.74[0.56;0.97]0.007 Occupied Bedside1.11[0.88;1.4]0.26 HDU**NA MITU*1- SITU0.33[0.18;0.62]<0.0001 Spatial location***-<0.0001 D2 (82.2% - n=26) Non Bedside*1- Non occupied Bedside0.75 [0.6;0.92]0.001 Occupied Bedside0.59[0.51;0.68]<0.0001 HDU*1- MITU0.02 [0.01;0.04]<0.0001 SITU0.33 [0.25;0.45]<0.0001 Spatial location**-<0.0001 D3 (53% - n=26) Non Bedside*1- Non occupied Bedside0.93 [0.81;1.06]0.173 Occupied Bedside1.22 [1.04; 1.43]0.003 HDU*1- MITU3.95 [2.43;6.41]<0.0001 SITU1.29 [1.06;1.56]0.002 Spatial location**-<0.0001

8  Jean Gaudart, LERTIM Faculté de Médicine, Aix-Marseille Université EPICLIN2011 8 Introduction Matériel et Méthode Résultats Discussion Estimation Prédiction

9  Jean Gaudart, LERTIM Faculté de Médicine, Aix-Marseille Université EPICLIN2011 9 Discussion Aérocontamination variable dans un même service, en tenant compte de la proximité d’un lit, la présence d’un patient, le type d’unité de soins. Facteurs à l’origine de cette variabilité? – Type de patient, porteur ou non de germes résistants, – Matériel utilisé, – Type de soins, – Comportements du personnel. Effets « frontières » (murs, couloirs)? Autres méthodes de régression spatiale Introduction Matériel et Méthode Résultats Discussion

10  Jean Gaudart, LERTIM Faculté de Médicine, Aix-Marseille Université EPICLIN2011 10 Références Wood SN. Generalized Additive Models, An introduction with R. Ed. Chapman et Hall/CRC, Boca Raton, 2006. Waller LA, Gotway AC. Applied spatial statistics for public health data. Ed. Wiley, Hoboken, 2004

11  Jean Gaudart, LERTIM Faculté de Médicine, Aix-Marseille Université EPICLIN2011 11