La présentation est en train de télécharger. S'il vous plaît, attendez

La présentation est en train de télécharger. S'il vous plaît, attendez

Hypotheses on the role of the protistan rare biosphere in a changing world David A. Caron, Peter D. Countway Master docéanographie UE 106 Diversité des.

Présentations similaires


Présentation au sujet: "Hypotheses on the role of the protistan rare biosphere in a changing world David A. Caron, Peter D. Countway Master docéanographie UE 106 Diversité des."— Transcription de la présentation:

1 Hypotheses on the role of the protistan rare biosphere in a changing world David A. Caron, Peter D. Countway Master docéanographie UE 106 Diversité des organismes marins (DOM) Bazañez Tania et Pouget Lydie

2 Normalement, en écologie, la plus grande règle de la théorie des niches est le principe dexclusion compétitive (principe de Gause). « Paradoxe du plancton » ??? Objectifs de larticle = mise en évidence de la diversité des taxons de protistes dans la « biosphère rare ». IntroductionDéfinitionsExemplesConclusion

3 « Les protistes sont des eucaryotes, des organismes unicellulaires donc composé d'une seule cellule. Il y a des formes qui ont des chloroplastes donc qui fonctionnent comme des plantes, des autres qui sont des parasites (comme par exemple le Plasmodium de la malaria). Ils sont aussi le premier maillon dans la chaine alimentaire planctonique : des brouteurs des algues comme par exemple, les ciliés tintinnides. » John R. Dolan, CNRS Taxons Métazoaires Alvéolés Straménopiles Chlorobiontes Fungi Cryptobiontes Cercobiontes Peter Countway, BLOS Les protistes rassemblent lensembles des taxons ci-contre moins les Métazoaires. Les protistes rassemblent les algues et les protozoaires selon Haeckel (1866). Depuis les protistes sont un groupe polyphylétique qui na aucune validité phylogénétique. De même pour le groupe des protozoaires (groupe polyphylétique). Emmanuelle Renard-Deniel, COM IntroductionDéfinitionsExemplesConclusion

4 BIOSPHERE RARE Seulement 10% de l'ensemble des OTU ont plus de 10 membres. Redessiné Daprès Caron et al., Aquat Microb Ecol 57: IntroductionDéfinitionsExemplesConclusion

5 Les taxons jouent un rôle écologique majeur dans lenvironnement : Selon Dolan, les rôles écologiques sont diverses : « Les protistes, dans leur forme des algues microscopiques, sont responsables pour la quasi- totalité de la production primaire dans les océans. Dans leur forme de micro-brouteur, ils sont responsables, pour la consommation, de la majeur partie de la production primaire océanique ». Hypothèse 1 : Changements dans la composition taxonomique Modifications des voies spécifiques de lénergie et du flux des éléments Hypothèse 2 : Changements de la structure des communautés de taxons Fonction de la communauté inchangée. Notion despèce guilde = correspond à lensemble des espèces qui joue le même rôle écologique dans lécosystème. IntroductionDéfinitionsExemplesConclusion

6 Digestion enzymatique par des enzymes de restriction pendant une incubation de 3 jours par T-RFLP. Rang des phylotypes Abondance des phylotypes T0 = 0hT1 = 24hT2 = 72h 65% des phylotypes sont observés à un seul temps Les changements environnementaux ont un effet sur la composition taxonomique des taxons rares Daprès Caron et al., Aquat Microb Ecol 57: IntroductionDéfinitionsExemplesConclusion

7 2 µm Cellule entière de Paraphysomonas imperforata (Zoom = x 9 000). Daprès Lim et al., The Journal of Eukaryotic Microbiology 48: 3, Actinophryda Labyrinthulobiontes Oobiontes Chromobiontes Straménopiles IntroductionDéfinitionsExemplesConclusion

8 E 2 10 E 3 10 E 4 Abondance cellulaire (ml -1 ) Nanoplancton total Paraphysomonas imperforata E 6 10 E 5 10 E 4 10 E 3 10 E 2 Abondance cellulaire (ml -1 ) Température (°C) Faible détectabilité Milieu enrichi avec organismes < 5 µm préférence de Paraphysomonas imperforata pour ces organismes. Température Paraphysomonas imperforata sensible aux températures élevées donc variation de labondance Redessiné Daprès Lim et al., Limnol Oceanogr 44: IntroductionDéfinitionsExemplesConclusion

9 Etats-Unis Océan Pacifique Océan Atlantique Atlantique Nord, 3 stations différentes à lOuest des Bermudes Pacifique Nord, 1 station sur la côte ouest de la Californie IntroductionDéfinitionsExemplesConclusion

10 Zone euphotique de lAtlantique Pacifique (150 m) Pacifique (500 m) Pacifique (5 m) Pacifique (profondeur du maximum de fluorescence = CM) Pacifique (Echantillons dAvril = CM et 5 m) bloom printanier Atlantique profond (2500 m) Redessiné Daprès Caron et al., Aquat Microb Ecol 57: IntroductionDéfinitionsExemplesConclusion

11 Abondance Changement environnemental Abondance Temps 1 Abondance Temps 2 Abondance Temps 3 Temps Métabolisme de la communauté Redessiné Daprès Caron et al., Aquat Microb Ecol 57: IntroductionDéfinitionsExemplesConclusion

12 Références: Caron DA, Countway PD (2009) Hypotheses on the role of the protistan rare biosphere in a changing world. Aquatic Microbial Ecology 57: Caron DA, Worden AZ, et al. (2009) Protists are microbes too: a perspective. The ISME Journal 3: 4-12 Countway PD, Gast RJ, Dennett MR, Savai P, Rose JM, Caron DA (2007) Distinct protistan assemblages characterize the euphotic zone and deep sea (2500 m) of the western North Atlantic (Sargasso Sea and Gulf Stream). Environ Microbiol 9:1219–1232 Countway PD, Gast RJ, Savai P, Caron DA (2005) Protistan diversity estimates based on 18S rDNA from seawater incubations in the western North Atlantic. Journal of Eukaryotic Microbiology 52:95–106 Dolan JR (2007) Le paradoxe du plancton dans 'Voir l'Invisible' de Fox-Keller E, Gex JP (eds), Omniscience, pp Dolan JR, Ritchie ME, Tunin-Ley A, Pizay MD (2009) Dynamics of core and occasional species in the marine plankton: tintinnid ciliates of the N.W. Mediterranean Sea. Journal of Biogeography 36: Lim EL, Dennett MR, Caron DA (1999) The ecology of Paraphysomonas imperforata based on studies employing oligonucleotide probe identification in coastal water samples and enrichment culture. Limnology and Oceanography 44(1): Lim EL, Dennett MR, Caron DA (2001) Identification of heterotrophic nanoflagellates by restriction fragment length polymorphism analysis of small subunit ribosomal DNA. Journal of Eukaryotic Microbiology 48(3): Slack JM (2003) Phylotype and zootype, In, Hall, B. K., and Olson, W. M., eds. Keywords and concepts in evolutionary developmental biology, p Harvard Univ. Press, London Sogin ML, Morrison HG, Huber JA, Welch DM et al. (2006) Microbial diversity in the deep sea and the underexplored rare biosphere. Proc Natl Acad Sci USA 103:12115–12120 Vaulot D, Eikrem W, Viprey M, Moreau H (2008) The diversity of small eukaryotic phytoplankton (<3 μm) in marine ecosystems. FEMS Microbiol Rev 32:795–820 Vigil P, Countway PD, Rose JM, Gobler CJ, Lonsdale DJ, Caron DA (2009) Rapid shifts in dominant taxa among microbial eukaryotes in estuarine ecosystems. Aquatic Microbial Ecology 54:83–100


Télécharger ppt "Hypotheses on the role of the protistan rare biosphere in a changing world David A. Caron, Peter D. Countway Master docéanographie UE 106 Diversité des."

Présentations similaires


Annonces Google