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Le microbiote intestinal. Microbiote intestinal Composition Mise en place - Structure Biodiversité Stabilité Fonctions Conclusion.

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1 Le microbiote intestinal

2 Microbiote intestinal Composition Mise en place - Structure Biodiversité Stabilité Fonctions Conclusion

3 Composition

4 Naissance : tube digestif sterile acquisition dune microflore «adulte» (2-6 ans) Biodiversité Stabilité Fonctions (protection) Colonisation espèces bactériennes Environnement & Facteurs hôte

5 Estomac Streptococcus Lactobacillus Streptococcus E.coli Clostridium Bacteroides Eubacterium Veillonella Intestin grêle(ileum) Distribution des bactéries le long du tube digestif 10 14 bactéries (tube digestif) 10 13 cellules (corps humain) Bacteroides Eubacterium Clostridium Ruminococcus Bifidobacterium Streptococcus Lactobacillus E.coli non-E.colicoliformes Colon

6 Seulement 20 à 30 % du microbiote intestinal humain est cultivable à ce jour

7 Utilisation doutils moléculaires indépendants de la culture Seulement 20 à 30 % du microbiote intestinal humain est cultivable à ce jour

8 Cible moléculaire: ARNr 16S bactérien Structure de la molécule dARNr 16S: 5S Ribosome 23S 16S Bactérie Intérêts de cette molécule: Ubiquitaire Molécule naturellement amplifiée Structure primaire mosaïque Régions conservées domaine Bacteria Régions variables groupes bactériens Régions hypervariables espèces bactériennes

9 Le microbiote intestinal humain Actinobacteria Bacteroidetes Firmicutes Complexe Abondance : 10 14 bactéries Diversité : ~ 1000 espèces Niches écologiques (iléon /côlon) Trois phyla (divisions) majeurs

10 Le microbiote intestinal humain Abondance : 10 14 bactéries Diversité : ~ 1000 espèces Niches écologiques (iléon /côlon) Trois phyla (divisions) majeurs Métagénome (ADN bactériens) : ~10 8 gènes Fonctions bénéfiques pour lhôte Organe symbiotique Actinobacteria Bacteroidetes Firmicutes Complexe

11 COMPLEXITE Unique pour chaque individu « Code barre »

12 Microflore dominante profiles de TTGE - ADNr 16S code barre variabilité inter individuelle

13 Microflore dominante profiles de TTGE - ADNr 16S 100 95 90 S1 S2 S5 S4 S3 Healthysubjects:Stabilityof the dominant faecalfloraovertime Seksik P et al.Gut. 2003;52:237-42 % similarity stabilityover2years Thedominanthumanfaecalmicrobiotaisstable Stabilité chez un même individu code barre variabilité inter individuelle

14 Effet de lerythromycine sur diversité despeces dominantes (De la Cochetiere et al. JCM 2005) Ery. 500mg/day for 4 days

15 Effet de lerythromycine sur diversité despeces dominantes (De la Cochetiere et al. JCM 2005) La microflore fécale est résiliente Ery. 500mg/day for 4 days

16 Principal Coordinate Analysis

17 Fonctions

18 Fonctions de la microflore fermentation (sucres / protéines) métabolisme des acides biliaires, xénobiotiques… «effet de barrière» : s'oppose à la colonisation de lintestin par des micro-organismes pathogènes développement des réponses immunitaires immunité innée et adaptative

19 Fonctions Métaboliques Hydrolyse et fermentation H2, CO2, CH4, AGCC Putréfaction Amoniaque, phénols, amines, indoles Acides biliairesdéconjugaison, déshydroxylation Xénobiotiquesdégradation, (in)activation

20 151050 2 4 6 8 12 Microflore intestinale Clostridium difficile Temps (jours) Leffet de barrière Antibiotique Log

21 Microflore et immunité Naissance : tube digestif stérile Acquisition microflore Maturation du système immunitaire plasmocytes IgA Tolérance (vis-à-vis de notre propre microflore) Protection et intégrité de lépithélium intestinal

22 CONCLUSION Biodiversité +++ Fonctions « dorgane » = organe caché métaboliques protection : effet de barrière intégrité de lépithélium Rôle dans certaines maladies

23 CONCLUSION fermentation (sucres / protéines) métabolisme des acides biliaires, xénobiotiques… «effet de barrière» : s'oppose à la colonisation de lintestin par des micro-organismes pathogènes développement des réponses immunitaires immunité innée et adaptative OBESITE DIABETE

24 fermentation (sucres / protéines) métabolisme des acides biliaires, xénobiotiques… «effet de barrière» : s'oppose à la colonisation de lintestin par des micro-organismes pathogènes développement des réponses immunitaires immunité innée et adaptative OBESITE DIABETE ALLERGIEMICI CONCLUSION

25 Perspectives – nouvelle cible Moduler le microbiote Bactériothérapie Facteurs solubles MICROBIOTE Contrôler la physiologie de lhôte Hôte Approche thérapeutique physiologie eucaryote de lhôte


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