Les examens de laboratoire en pathologie infectieuse 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Introduction Une maladie infectieuse est la conséquence d’une agression de l’organisme par un ou plusieurs agents infectieux présents dans notre environnement  sol, air, eau, aliments, animaux, humains. La transmission est: directe par contact ou ingestion, indirecte par l’intermédiaire d’un vecteur. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Les agents infectieux Virus à ADN ou ARN, Bactéries: les cocci (sphèriques),bacilles (allongés), vibrions (vrillés), spirochètes (spiralés). Champignons: les levures(unicellulaires), les filaments… Parasites: protozoaires, métazoaires. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Moyens de défense de l’organisme 1. Anatomophysiologiques La peau  constitue une barrière aux germes, Les substances chimiques  l’acidité gastrique et buccale limitent le développement des micro-organismes, Les sécrétions biologiques  urines, bile, sécrétions bronchiques, larmes… permettent l’élimination par une évacuation régulière. L’aponévrose  cloisonne les divers secteurs de l’organisme évitant ainsi la propagation. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Moyens de défense de l’organisme 2. Immunitaires La réaction inflammatoire Première étape de la réponse immunitaire, elle permet de circonscrire le foyer infectieux grâce à une vasodilatation qui favorisera l’extravasation des globules blancs vers le foyer infectieux. L’immunité cellulaire (lymphocytes T) L’immunité humorale (lymphocytes B) 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Exploration des mécanismes de défense Face à une symptomatologie faisant évoquer une maladie infectieuse, on explorera ces divers mécanismes de défense grâce à un panel d’examens para cliniques. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Exploration des mécanismes de défense On distingue: Les examens d’orientation. Les examens diagnostics. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Cadre législatif Article R. 4311-7 L'infirmier ou l'infirmière est habilité à pratiquer les actes suivants: soit en application d'une prescription médicale…. soit en application d'un protocole écrit……..préalablement établi, daté et signé par un médecin : 35° Prélèvements de sang par ponction veineuse ou capillaire ou par cathéter veineux, 37° Prélèvements non sanglants effectués au niveau des téguments ou des muqueuses directement accessibles, 38° Prélèvements et collecte de sécrétions et d'excrétions, 39° Recueil aseptique des urines. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

1. Les examens d’orientation en pathologie infectieuse 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

1.1. L’hémogramme ou Numération Formule Sanguine NFS 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE L‘hémogramme Examen de base du bilan hématologique, il renseigne sur les éléments figurés du sang : érythrocytes ou globules rouges ou hématies leucocytes ou globules blancs thrombocytes ou plaquettes. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Numération érythrocytaire : nombre de globules rouges. C'est le nombre des globules rouges circulant dans un volume donné de sang. Le taux normal est : Chez l'homme  4,5 à 5,5 Tera/l (1012/l) ou 4,5 à 5,5 millions/mm3. Chez la femme  4 à 5 Tera/l (1012/l) ou 4 à 5 millions/mm3. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Dosage de l'hémoglobine (Hb) Le taux d'hémoglobine est obtenu par spectrophotométrie après lyse des globules rouges. Le taux normal : Chez l'homme  130 à 170 g/l (ou 13 à 17 g/dl ) Chez la femme  115 à 150 g/l (ou 11,5 à 15 g/dl) 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE L'hématocrite (Ht) C'est le volume occupé par les globules rouges (G.R) par rapport au volume du sang total (G.R + plasma). 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

La numération des réticulocytes Le taux des réticulocytes reflète le taux de production médullaire de l’érythropoïèse et donc le renouvellement érythrocytaire. Ce sont des érythrocytes jeunes qui contiennent encore quelques ribosomes et mitochondries leur permettant de poursuivre pendant 24 à 48 H une faible synthèse d'hémoglobine. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

La numération des réticulocytes Le résultat peut être exprimé : En pourcentage : taux normal 0,5 à 1,5 % des G.R. ou mieux en valeur absolue : 20 à 80 giga/l (109/l) Leur taux dans une anémie permet de préciser si celle-ci est: régénérative (réticulocytes élevés) ou arégénérative (réticulocytes bas). 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Anémie et infection L’anémie de l’adulte en lien avec une infection peut être associée à plusieurs mécanismes. Elle peut être en rapport avec: l’inflammation, l’hémolyse d’origine immunologique: CMV mycoplasme, l’hémolyse d’origine non immunologique: endocardite sur prothèse de valve cardiaque, septicémie à Clostridium perfringens, paludisme. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE LES LEUCOCYTES Ils sont analysés dans l'hémogramme de 2 manières obligatoirement complémentaires. 1) La numération leucocytaire C'est le décompte des G.B circulant dans un volume donné de sang. Le taux normal est de 4 à 10 giga/l (109/l) ou 4000 à 10 000/mm3 2) La formule leucocytaire Contrairement aux G.R, la population leucocytaire est très hétérogène: granulocytes, monocytes, lymphocytes. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

VALEURS DE LA FORMULE LEUCOCYTAIRE 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Modification du taux des leucocytes Hyperleucocytose G.B. augmentés > 10 giga/l Leucopénie G.B. diminués < 4 giga/l 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Modification du taux des polynucléaires neutrophiles Polynucléose P.N. augmentés > 7500/mm3  infections à bactéries pyogènes. Neutropénie P.N. diminués <1000/mm3  viroses, endocardite subaiguë, infections bactériennes sévères,…. Agranulocytose P.N. fortement diminués < 500/mm3. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Modification du taux des polynucléaires éosinophiles Hyper éosinophilie P.E. augmentés > 500/mm3  certaines parasitoses: helminthiases. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Modification du taux des lymphocytes Lymphopénie Lymphocytes diminués <1000/mm3  implique toujours un déficit en lymphocytes T puisqu'ils prédominent largement par rapport aux lymphocytes B dans le sang périphérique. On la retrouve dans l’infection VIH, la tuberculose, la légionellose, SRAS. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Modification du taux des lymphocytes Hyper lymphocytose Lymphocytes augmentés > 4000/mm3 chez l’adulte et > 7000/mm3 chez l’enfant. Elle oriente surtout vers une infection virale mais s’observe aussi dans la coqueluche.. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Les monocytes Monocytose Monocytes > 1000/mm3 Peut se voir au cours: d’infections bactériennes  endocardite infectieuse, brucellose, salmonellose, tuberculose, d’infections parasitaires  paludisme, d’infection virale  MNI 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Les plaquettes Un thrombocyte ou plaquette est un élément figuré du sang, formé dans la moelle osseuse. Leur durée de vie est d'environ 8 à 10 jours. Leur lieu de dégradation est la rate. Elles sont un des composants indispensables à l’hémostase.  Plaquettes : 150 000 à 400 000/mm3 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Les plaquettes Thrombopénie Plaquettes <150 000/mm3 Au cours des viroses  MNI, VIH, Typhoïde, paludisme. Thrombocytose ou hyperplaquettose Plaquettes > 450 000/mm3 observée dans les infections chroniques, elle témoigne d’un syndrome inflammatoire chronique. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

1.2. La Vitesse de Sédimentation VS 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE La VS Est un marqueur de l’inflammation. La vitesse de sédimentation (VS) des érythrocytes reste encore un test communément utilisé pour déceler et surveiller les maladies s'accompagnant d'un syndrome inflammatoire. Mesure la rapidité avec laquelle les hématies se déposent, sous l'impulsion de la gravité, dans une colonne de sang (tube gradué) rendue incoagulable. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE La VS Elle est influencée par le nombre de globules rouges, leur volume et la concentration de certaines protéines plasmatiques impliquées dans l'inflammation et responsables de sa viscosité. Cet examen, sans aucune spécificité, est un excellent examen d'orientation. Un résultat anormal vérifié impose des recherches complémentaires. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE La VS Prélèvement de sang veineux (en général au pli du coude) sur tube de prélèvement contenant un anticoagulant. Le prélèvement est réalisé de préférence à jeun. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE La VS Résultats normaux 1ère heure: 3 à 10mm chez l'homme 5 à 20mm chez la femme 2ème heure < 20mm A l'état normal, la VS s'accélère avec l'âge, la grossesse... 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE VS La VS s’accroît de manière franche dans les infections à pyogènes. Cependant, elle peut rester normale ou peu élevée dans la plupart des infections virales et dans certaines infections bactériennes (Brucellose et Salmonellose). 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE VS Une VS > à 100 mm/1ère heure est un facteur de gravité dans 95 % des cas. Une élévation modérée (> 50 mm/ h) doit faire recontrôler la VS tous les 15 jours-1 mois. Les bactéries augmentent plus la VS que les virus, sauf pour Brucella et Salmonella. Lors d'une virose, une VS > à 100 mm/h évoque une surinfection bactérienne. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

1.3. La CRP ou Protéine C Réactive 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE CRP Est une protéine de l’inflammation plus précoce et plus sensible que la VS. La C Reactive Protein (CRP) est une protéine sérique spécifique de la réaction inflammatoire, synthétisée par le foie, précocement au cours de la réponse inflammatoire. Elle a pour rôle de mobiliser les défenses immunitaires de l'organisme, avec des mécanismes encore mal connus. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE CRP Sa valeur normale est inférieure à 10-12 mg/l. Son taux peut être multiplié par 500 à 1000 lors d'inflammations aiguës. Elle s'élève dès la 6e heure de l'inflammation (y compris lors de nécroses tissulaires, de traumatismes,...). En moyenne, elle est franchement pathologique 24 heures après le début de l'inflammation, Elle se normalise rapidement après sa disparition (en 7 à 14 jours). 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE CRP Dans le cadre des infections La CRP reste normale en cas de virose. Elle ne s'élève qu'en cas d'infection bactérienne et diminue rapidement dans les 48 heures d'une antibiothérapie bien conduite. L'élévation du taux de CRP est également un facteur pronostic: plus l'élévation est rapide et importante, plus l'inflammation est sévère. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE 1.4. La Fibrinémie 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE La Fibrinémie C’est le dosage de la fibrine dans le sang. La fibrine est activée lors du processus de réaction inflammatoire. Elle s’agglutine autour du corps étranger, son taux augmente alors. Norme : 2 à 4,5 g/l 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

2. Les examens spécifiques du diagnostic en pathologie infectieuse 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Généralités Les examens spécifiques du diagnostic permettent d’identifier l’agent infectieux. Cette identification sera réalisée à partir d’un prélèvement de: Sang, Liquides biologiques  urines, selles, sécrétions de la sphère ORL, génitale, broncho-pulmonaires, LCR, pus et liquide d’épanchement… 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Techniques d’identification -1- Plusieurs techniques permettent l’identification d’un agent infectieux: Examen direct: Sans coloration, Avec coloration: Gram pour les bactéries, Ziehl pour les mycobactéries, Giemsa pour le Plasmodium, Par immunofluorescence, Par culture des bactéries ou champignons sur des milieux nutritifs spécifiques (bouillon de culture). 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Techniques d’identification -2- Examen indirect: Mise en évidence d’anticorps dirigés contre l’agent infectieux  sérodiagnostic. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

2.1. Le sérodiagnostic ou dosage des anticorps 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Le sérodiagnostic Le sérodiagnostic dépiste les Ac et en mesure le taux. C’est un examen sanguin qui recherche des anticorps spécifiques à un antigène suspecté. L’existence d’une séropositivité peut témoigner:  d’une primo-infection,  d’une infection ancienne (IgG),  d’une vaccination (Ac résiduels détectables)  son interprétation nécessite de connaître le statut sérologique antérieur 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Le sérodiagnostic Compte tenu du temps de latence nécessaire à la fabrication d’anticorps, le 1er dépistage sanguin peut être négatif, il faudra donc un second prélèvement 2 à 3 semaines après le début de l’infection pour pouvoir confirmer ou infirmer le diagnostic. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Sérologies: quelques exemples Sérologie bactérienne Sérologie virale Sérologie parasitaire Sérologie mycosique Brucellose Hépatite Toxoplasmose Aspergillose Chlamydia VIH Amibiase Candidose Rickettsie CMV Leishmaniose Syphilis Rubéole Filariose Typhoïde Légionellose 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Principes généraux 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE A toujours respecter Réalisation avant toute antibiothérapie (dans la mesure du possible). Respecter les techniques de prélèvement afin de ne pas contaminer l’échantillon prélevé. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE A toujours respecter Etiqueter: tubes, pots, flacons, bons de demande d’examen Remplir le bon: penser à le renseigner avec les éléments cliniques en lien, Acheminement du prélèvement le plus rapidement possible vers le laboratoire. Transmissions 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE 2.2. Hémoculture 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Hémoculture Définition Technique de laboratoire dont le but est de mettre en évidence la présence ou l'absence de micro-organismes dans le sang. L’hémoculture est un prélèvement sanguin stérile, pour mise en culture immédiate. Prescription médicale. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Hémoculture Intérêt de l'examen La réalisation d'une hémoculture est faite dans le but d'affirmer une infection sanguine généralisée. La présence d'une seule hémoculture positive affirme la bactériémie. La présence de plusieurs hémocultures positives définit la septicémie. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Hémoculture Conditions de prélèvement Le prélèvement sanguin s'effectue par une ponction veineuse en général au pli du coude. Ce prélèvement est à faire au mieux au moment d'un pic fébrile. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Hémoculture Souvent plusieurs hémocultures sont nécessaires et sont prélevées à plusieurs heures de distance, pour affirmer le caractère continu ou intermittent de la bactériémie. Deux types de flacons devront être ensemencés: un flacon aérobie, un flacon anaérobie (sans oxygène). Ces flacons seront ensuite disposés dans une étuve en général à 37°C, et l'aspect des cultures sera régulièrement vérifié. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Hémoculture infection du sang  faible quantité de micro-organismes d’emblée leur détection par examen microscopique. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Hémoculture Recours à méthode d’enrichissement par culture  Prolifération agent infectieux Identification agent infectieux 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Hémoculture Résultats normaux Une hémoculture chez un sujet en bonne santé doit demeurer stérile. Résultats anormaux Quand la culture est positive (en général au bout de 13 à 72 heures), il faut ensuite faire des repiquages sur le milieu de culture pour identifier avec précision le germe. Une fois le germe isolé, il faut alors tester sa sensibilité aux différents antibiotiques, c'est l'antibiogramme. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

2.3. Frottis sanguin et goutte épaisse 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Frottis sanguin et goutte épaisse Le frottis et la goutte épaisse consistent à étaler du sang prélevé chez le patient sur une lame. Réalisé à partir d’une goutte de sang prélevée par piqûre au bout d’un doigt. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Frottis sanguin et goutte épaisse La technique d'étalement est différente pour les deux analyses, mais dans les deux cas, elle permet d'observer au microscope la présence des parasites en cas d'infection. C’est une technique rapide qui permet l’isolement du Plasmodium dans le paludisme. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Frottis sanguin Goutte épaisse 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Réalisation frottis sanguin 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Frottis sanguin et goutte épaisse Résultats Sur le frottis sanguin On observe, en cas d'infection, la présence de Plasmodium dans les globules rouges visualisés au microscope. Selon l'espèce en cause, les globules rouges parasités seront plus ou moins déformés. Les parasites apparaissent généralement sous la forme d'une petite bague. L'observation de leur morphologie fine permet de reconnaître l'espèce en cause. Sur la goutte épaisse Les globules rouges sont détruits. Les parasites apparaissent alors isolés, sous différentes formes qui permettent d'en faire le diagnostic. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE 2.4. La coproculture 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Coproculture DEFINITION Prélèvement de selles dans un tube stérile en vue d’un examen cytobactériologique. La finalité de la coproculture consiste à tenter d'isoler au sein d'une flore complexe un nombre limité d'espèces réputées pathogènes. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Coproculture Intérêt de l'examen Il vise à rechercher des bactéries responsables d'une diarrhée. La coproculture peut aussi être réalisée pour rechercher la présence d'une bactérie résistante dans le tube digestif d'un patient asymptomatique, ou dans le bilan d'une intoxication alimentaire isolée ou collective. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

 plus de 400 espèces différentes (++++flore anaérobie stricte). L'objectif principal consiste à rechercher le(s) micro-organisme(s) pathogène(s) responsable(s) de la diarrhée. La flore colique de l'adulte se caractérise par une grande densité et une extraordinaire diversité:  109 à 1010 bactéries/gr  plus de 400 espèces différentes (++++flore anaérobie stricte). Entérobactéries seulement 5 à 10 % de cette flore et parmi lesquelles Escherichia coli prédomine. Entérocoques, streptocoques, staphylocoques, lactobacilles et levures sont aussi présents mais en moins grande quantité. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE normale   17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Coproculture Conditions de prélèvement Le prélèvement de selles doit être réalisé sans prise préalable de mucilage, de lubrifiant ou de charbon Il doit être mis dans un pot stérile fermé et doit être rapidement transporté au laboratoire (conservation maxi: 24H à +4°). Il faut bien préciser: les signes accompagnateurs, si un voyage à l'étranger a été effectué (en particulier en zone tropicale) si un traitement antibiotique est administré. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Coproculture Résultats normaux Dans une coproculture il existe une flore abondante. Un résultat négatif de coproculture n'exclut pas une cause infectieuse à une diarrhée, car seules les bactéries sont recherchées. En cas de voyage en pays tropical ou de persistance de la diarrhée, un examen parasitologique des selles doit être également réalisé. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Coproculture Résultats anormaux On peut retrouver: des germes anormalement présents des germes normalement présents mais en concentration excessive.  Salmonelles, Shigelles, Campylobacter, Vibrion cholérique, Yersinia enterocolitica,  Aeromonas hydrophila, Clostridium. Au cours d'intoxications alimentaires, on peut retrouver dans les selles différents germes : B. cereus, Staphylocoque, Salmonelles, Yersinia enterocolitica. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Examen parasitologique des selles Intérêt de l'examen Il permet d'affirmer l'existence d'une parasitose intestinale Cet examen qui ne recherche que des parasites, ne permet pas le diagnostic des infections bactériennes qui seront identifiées par l'examen bactériologique ou coproculture. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Examen parasitologique des selles Conditions de prélèvement Les selles devront être recueillies dans un pot stérile et être rapidement transmise au laboratoire. Pour certaines recherches particulières, les selles doivent être très fraîches et être émises au laboratoire. Parfois cet examen doit être renouvelé, les parasites pouvant être émis par intermittence. Pour être bien orienté, il faut préciser les différents voyages en particulier tropicaux effectués et les traitements déjà ou actuellement suivis. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Examen parasitologique des selles Résultats normaux A l'état normal, il ne doit pas exister de parasites dans les selles. Résultats anormaux Présence de parasites Amibes, Oxyure, Taenia ou apparentés (taenia, tricocéphales, hymenolepis), Larves d'anguillules, Ankylostomes. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

2.5. Examen Cyto Bactériologique des Urines ECBU 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE ECBU Définition L’ECBU consiste à recueillir des urines afin d’analyser leur composition cytologique et bactériologique. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE ECBU Intérêt de l'examen Cet examen est réalisé pour affirmer ou infirmer une infection urinaire, isoler le germe et guider le traitement antibiotique. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE ECBU Conditions de prélèvement Les urines doivent être prélevées de la façon la plus aseptique possible. Le prélèvement est effectué après un lavage au savon doux puis une désinfection de la région du méat urinaire (au niveau du gland ou de la région vulvaire). Le premier jet d'urines est éliminé, puis les 20 ml suivants sont recueillis. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE ECBU Résultats normaux En l'absence d'infection (ou de contamination), les urines sont normalement stériles. Elles contiennent : Moins de 10.000 leucocytes/ml, Moins de 5.000 hématies/ml, Absence de germe. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE ECBU Résultats anormaux L’infection urinaire se caractérise par la présence de germes et de globules blancs (et parfois de globules rouges) dans les urines. L’infection urinaire peut être:  basse (cystite, urétrite, prostatite)  haute (pyélonéphrite) 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

2.6. Examen cytobactériologique des crachats ECBC 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE ECBC Définition Recueil de mucus bronchique en vue d’en analyser sa composition cytologique et bactériologique. Recueil d'expectorations du tractus respiratoire inférieur. Risque de contamination du prélèvement lors du passage dans l'oropharynx. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Examen cytobactériologique des crachats Intérêt de l'examen Cet examen a pour but de rechercher une infection pulmonaire en effectuant un prélèvement de crachat. Cet examen est facile en théorie, mais risque de ne pas apporter toutes les données si le crachat est de mauvaise qualité (mélangé à la salive qui va le contaminer ou le diluer). 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE ECBC Conditions de prélèvement Patient assis, à jeun. Expliquer l'effort de toux. Rinçage de la bouche avec un antiseptique et de l'eau stérile. Faire cracher et recueillir dans un flacon en fin de toux. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE ECBC 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE ECBC En cas de difficulté à l'expectoration, une kinésithérapie peut aider à expectorer. Dès que le prélèvement est obtenu, il doit être rapidement transféré dans le laboratoire de microbiologie, en précisant les recherches bactériologiques demandées. Si un germe réputé pathogène est isolé en grande quantité, un antibiogramme sera effectué. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Examen cytobactériologique des crachats Résultats normaux Pour être interprétable, le crachat doit être issu de l'arbre respiratoire profond. Il existe certaines constantes qui permettent de juger la qualité du prélèvement. doit contenir plus de 25 polynucléaires, moins de 10 cellules épithéliales. D'autre part, ce type de prélèvement étant souvent contaminé au passage des voies aériennes supérieures, seules les concentrations importantes soit supérieures à 107 germes/ml seront prises en compte. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Examen cytobactériologique des crachats Résultats anormaux Les germes habituellement retrouvés dans les pneumonies sont le pneumocoque, l'haemophilus influenzae, les streptocoques. Ces germes sont facilement mis en évidence lors des cultures. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

2.7. Examen du liquide céphalorachidien 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Examen du liquide céphalorachidien Définition L’examen du liquide céphalorachidien est rendu possible grâce à un recueil de celui-ci par ponction lombaire. L'analyse du LCR comporte plusieurs aspects : cytologique :recherche de cellules, en particulier globules blancs ; chimique : dosage du glucose, des protéines, des ions chlorure ; bactériologique : mise en culture pour identifier un éventuel germe en cause et réaliser un antibiogramme (voir ce terme) pour savoir quels antibiotiques seront efficaces sur ce germe. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Examen du liquide céphalorachidien Intérêt de l'examen Un examen cytobactériologique et biochimique du LCR est pratiqué devant une suspicion de méningite, d'encéphalite. Cet examen peut aussi être réalisé dans le cadre d'une maladie neurologique démyélinisante (sclérose en plaques). 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Examen du liquide céphalorachidien Conditions de prélèvement Le prélèvement s'effectue par une ponction lombaire chez un patient en milieu hospitalier. Le patient est assis penché en avant ou couché sur le côté en chien de fusil. La ponction est faite avec une aiguille spéciale entre 2 vertèbres lombaires après une désinfection rigoureuse de la peau. Une analgésie superficielle peut être réalisée. Dès la fin de la ponction, les prélèvements seront acheminés sans aucun retard au laboratoire pour être examiné au microscope et être mis en culture. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Examen du liquide céphalorachidien Résultats normaux LCR d'aspect clair. 0 - 2 cellules / mm3. Protéines : 0.20 - 0.40 g /l. Glucose : 50 % de la glycémie (taux de glucose dans le sang). Examen direct bactériologique négatif et culture négative. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Examen du liquide céphalorachidien Résultats anormaux Il y a une méningite ou une méningo-encéphalites si plus de 5 cellules sont retrouvées dans le LCR et qu’un agent infectieux est identifié. Elles sont différenciées selon le type de cellules qui sont retrouvées dans le LCR : Méningite purulente si ce sont des polynucléaires (en faveur d'une méningite bactérienne).  Méningite lymphocytaire (en faveur d'une méningite virale). Méningite panachée avec un mélange des 2 types de cellules C'est une hémorragie méningée si le liquide est hémorragique (avec des globules rouges). 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Méningite tuberculeuse ou fongique (champignon) Aspect Cellules /mm3 Protéines (g/l) Glucose LCR Glucose sang Culture bactérienne Interprétation Clair 5 - 300 lymphocytes < 1 = 0.5 ou Listeria ou spirochète Méningite virale Méningite à Listeria 100 - 200 lymphocytes > 1 < 0.5 0 ou bacille tuberculeux ou cryptocoque Méningite tuberculeuse ou fongique (champignon)   Trouble purulent > 200 neutrophiles + (méningocoque, pneumocoque, Haemophilus…) Méningite bactérienne Jaune /rouge Hématies nombreuses Tuberculose 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE 2.8. Prélèvements locaux 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Prélèvement génital Définition Nous considérerons comme prélèvement génital :      - chez la femme : les prélèvements de vulve, vagin, col utérin.      - chez l'homme et la femme : les prélèvements d'urètre antérieure, ganglions para génitaux, anus, gorge. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Prélèvement génital Intérêt de l'examen Un prélèvement génital est utile quand on recherche des bactéries pouvant être responsables d'infections génitales ou de infections sexuellement transmises (IST). Ces prélèvements sont en particulier à effectuer en cas d'ulcérations génitales, de ganglion inflammatoire inguinal, d'urétrites, de vulvo-vaginites, ou d'orchi-épididymites. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Prélèvement génital Conditions de prélèvement Le prélèvement sera effectué au laboratoire ou lors de la consultation du médecin. Le prélèvement urétral chez les hommes se fait par recueil de l'écoulement urétral et éventuellement par un écouvillonnage. Chez la femme les prélèvements vaginaux (au niveau des culs de sacs) et de l'endocol se font après examen au spéculum. Ce prélèvement sera fait après 24 heures d'abstinence et au moins à 48 heures de l'utilisation de spermicides, crème ou ovules. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Prélèvement génital Résultats normaux Dans les prélèvements urétraux normaux il existe moins de 1000 germes banaux. Dans la flore vaginale normale, on retrouve des anaérobies et des bacilles de Döderlein. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE Prélèvement génital Résultats anormaux En cas d'ulcérations génitales, on recherche des infections causées par l'herpès, la syphilis (T. pallidum), le chancre mou (H. ducreyi), la lymphogranulomatose vénérienne, ou plus rarement du candida. En cas d'urétrite, on recherche le gonocoque (N. gonorrhae), et les chlamydioses (C. trachomatis). De façon plus rare, on peut retrouver des mycoplasmes, des trichomonas, de l'herpès ou une syphilis. En cas de vulvo-vaginite, on recherche une infection à candida, à trichomonas, une gonococcie, une infection à chlamydia. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Prélèvements sphère ORL Définition Recherche au niveau des orifices naturels de la sphère ORL: nez, gorge, oreille (pouvant constituer des portes d’entrée potentielles) de la présence d’un agent infectieux. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Prélèvements sphère ORL Intérêt Recherche d'une infection locale, identification du germe, adaptation d'un traitement à visée curative et préventive. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Prélèvements sphère ORL Conditions de prélèvement Ecouvillon stérile passé sur la muqueuse nasale, pharyngée (attention au réflexe nauséeux, loin des repas) ou au niveau du conduit auditif. Penser à spécifier: côté concerné droit ou gauche. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Prélèvements sphère ORL Résultats A l’état normal, ces cavités sont peuplées de germes commensaux. Les résultats seront considérés comme pathologiques, si on retrouve: des germes anormalement présents, des germes normalement présents mais en concentration excessive. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Prélèvement de pus et liquide d’épanchement 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Prélèvement de pus et liquide d’épanchement Définition Prélever au niveau d’une plaie de la peau, de la plèvre ou d’une articulation des sécrétions purulentes ou non en vue d’en analyser sa composition cytologique et bactériologique. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Prélèvement de pus et liquide d’épanchement Intérêt Recherche d'une infection locale, identification du germe, adaptation d'un traitement. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Prélèvement de pus et liquide d’épanchement Conditions de prélèvement Dans le cas d’un épanchement articulaire, le prélèvement doit être réalisé préférentiellement au bloc opératoire dans des conditions d’asepsie rigoureuses. Il sera récolté dans des tubes stériles tout comme pour l’épanchement pleural. Pour un prélèvement de plaie cutanée, il sera réalisé à l’aide d’un écouvillon stérile lors de la réfection du pansement avant toute désinfection. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Prélèvement de pus et liquide d’épanchement Résultats A l’état normal, absence de germes. Si germe identifié, il signe une contamination du prélèvement ou une infection. 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE

Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE FIN 17/09/2018 Mireille PELLETIER IFSI Sainte MARGUERITE