Peptides Structure et propriétés générales CHMI 2227F Biochimie I Peptides Structure et propriétés générales CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Peptides 1 2 CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D. Un dipeptide

Peptides CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Peptides - polarité CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Peptides - nomenclature CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Peptide: hydrolyse CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Chromatographie liquide à haute pression (HPLC) PITC = phenylisothiocyanate PTC = phenylthiocarbamyl http://www.protein.iastate.edu/aaa.html CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Chromatographie liquide à haute pression (HPLC) http://www.protein.iastate.edu/aaa_figure3.html CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Peptide - ionisation CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Exemples de peptides 1. Aspartame: sucre artificiel H3N+-CH-C-NH-CH-C-OCH3 COO- CH2 O Asp-Phe-methyl ester 2. Ocytocine: stimule les contractions utérines Cys-Tyr-Ile-Gln-Asn-Cys-Pro-Leu-Gly-NH2 Résidu de glycinamide: 2HN-CH2-CONH2 S Pont disulfure CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Exemples de peptides 3.Insuline Pont disulfure intrachaîne Pont disulfure interchaîne CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Exemples de peptides 4.Cystic Fibrosis Transductance Regulator CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Propriétés générales des protéines 1 Propriétés générales des protéines 1. Les protéines varient beaucoup selon leur Mr. Protéine Mr (kDa) # résidus # chaînes Insuline 5.7 51 2 Cytochrome c 13 104 1 Ribonucléase A 13.7 124 Lysozyme 13.9 129 Myoglobine 16.9 153 Chymotrypsine 21.6 241 3 Chymotrypsinogène 22 245 Hémoglobine 64.5 574 4 Albumine sérique 68.5 550 Hexokinase 102 800 Immunoglobuline G 145 1,320 RNA polymérase 450 4,100 5 Apolipoproteine B 513 4,536 Glutamate déshydrogenase 1,000 8,300 40 Source: Biochemistry. Lehninger. CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Protéines multimériques Monomère/sous-unité Homodimère 1 Hétérodimère 2 Liaisons hydrogène: N-H ----- O-H N-H ----- N O-H ----- O=C N-H ----- O=C Interactions hydrophobes: -CH3 CH3- CH3 Interactions électrostatiques: COO- ----- H3+N CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Importance des protéines multimériques- polarité planaire des cellules CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Importance des protéines multimériques- polarité planaire des cellules Nature Genetics 38, 21 - 23 (2006) CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Propriétés générales des protéines 2 Propriétés générales des protéines 2. Les protéines varient beaucoup selon leur pI. Protéine pI Pepsine 1 Albumin de l’œuf 4.6 Albumine sérique 4.9 Uréase 5 b-lactoglobuline 5.2 Hémoglobine 6.8 Myoglobine 7 Chymotrypsinogène 9.5 Cytochrome c 10.7 Lysozyme 11 Source: Biochemistry. Lehninger. CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Propriétés générales des protéines 3 Propriétés générales des protéines 3. Fréquence de la composition en acides aminés Nombre de résidus par molécule de protéine Acide aminé Cytochrome c humain Chymotrypsinogène bovine Leu 6 19 Lys 18 14 Met 3 2 Phe Pro 4 9 Ser 28 Thr 7 23 Trp 1 8 Tyr 5 Val Total 104 245 Nombre de résidus par molécule de protéine Acide aminé Cytochrome c humain Chymotrypsinogène bovine Ala 6 22 Arg 2 4 Asn 5 15 Asp 3 8 Cys 10 Gln Glu Gly 13 23 His Ile CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Propriétés générales des protéines 3 Propriétés générales des protéines 3. Fréquence de la composition en acides aminés CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Propriétés générales des protéines 4 Propriétés générales des protéines 4. Les protéines peuvent inclure d’autres groupements que des acides aminés. Classe Groupe prosthétique Exemple Lipoprotéine Lipides b1-lipoprotéine (sang) Glycoprotéine Carbohydrates (sucres) Immunoglobuline G (sang) Phosphoprotéine Groupement phosphate Caséine (lait) Hémoprotéine Hème (porphyrine à atome de Fer) Hémoglobine Flavoprotéine Nucléotides flavines Succinate déshydrogénase Métalloprotéine Fe Zn Ca Cu Ferritine Alcool déshydrogénase Calmoduline Plastocyanine CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.

Propriétés générales des protéines 5 Propriétés générales des protéines 5. Les protéines adoptent une forme bien précise. Protéine globulaire Protéine filamenteuse (ou en bâtonnets) CHMI 2227 - E.R. Gauthier, Ph.D.