Cours de Bactériologie Faculté de Médecine de Fès Dr. Sylvestre Tigaud Laboratoire de Bactériologie Centre de Biologie Nord Hôpital de la Croix-Rousse CHU de LYON

Hôpital de la Croix-Rousse Introduction Dr. Sylvestre Tigaud sylvestre.tigaud@chu-lyon.fr Tel : +33 4 72 07 18 44 Fax : +33 4 72 07 18 42 Hôpital de la Croix-Rousse

Bactériologie médicale 1) 1ère partie La bactérie : structure, croissance, taxonomie, génétique,….. Les agents antibactériens : désinfectants, antiseptiques et antibiotiques Le rôle du laboratoire

Bactériologie médicale 2) 2ème partie : Les bactéries Notions simples de bactériologie Habitat et épidémiologie Facteurs de virulence Infections Diagnostic biologique Traitements Moyens de préventions

Programme bactériologie 2ème année de médecine – Faculté de FES Partie 1 : Généralités : la bactérie et les agents antibactériens Etude de la bactérie Structure Croissance Classification Génétique Relation hôte bactérie, la maladie infectieuse Facteurs de pathogénicité Les antibiotiques : généralités et résistances

Programme bactériologie 2ème année de médecine – Faculté de FES Partie 1 : Généralités : la bactérie et les agents antibactériens Le rôle du laboratoire de microbiologie diagnostic direct et indirect les conditions de prélèvements Les familles d’antibiotiques  Bétalactamines, Aminosides, Quinolones, Fosfomycine, Acide fucidique, Tetracyclines, Glycopeptides, Phénicolés, Rifamycine ; Imidazolés, Macrolides Critères de choix d’un traitement antibiotique

Programme bactériologie 2ème année de médecine – Faculté de FES Partie 2 : Etude systématique des bactéries-A Les staphylocoques Staphylococcus aureus staphylocoques à coagulase négative Les streptocoques Streptococcus pyogenes Streptococcus agalactiae Streptococcus pneumoniae Streptocoques oraux Entérocoques Les corynébactéries Listeria monocytogenes Bactéries Gram positif Culture relativement aisée Diagnostic accessible à la plupart des laboratoires

Programme bactériologie 2ème année de médecine – Faculté de FES Partie 2 : Etude systématique des bactéries-B Les entérobactéries généralités Salmonella Shigella Yersinia Escherichia coli Les bacilles à Gram négatif de l’environnement peu exigeants Pseudomonas aeruginosa Les autres Bactéries Gram négatif Culture relativement aisée Diagnostic accessible à la plupart des laboratoires

Programme bactériologie 2ème année de médecine – Faculté de FES Partie 2 : Etude systématique des bactéries-C Legionella pneumophila Vibrion cholerae Bordetella pertusis Hemophillus influenzae Neisseriae meningitidis Neisseria gonorrhoeae Brucella Pasteurella multocida Campylobacter Helicobacter pylori Bactéries Gram négatif Culture moins aisée Diagnostic accessible à la plupart des laboratoires à condition d’avoir une bonne expérience

Programme bactériologie 2ème année de médecine – Faculté de FES Partie 2 : Etude systématique des bactéries-D Mycobactéries Mycobacterium tuberculosis Mycobacterium bovis Mycobacteries atypiques Mycobacterium leprae Bactéries anaérobies flore exogène : Clostridium flore endogène : flore de Veillon Culture très particulière Diagnostic accessible à la plupart des laboratoires, mais à condition de spécialiser un secteur entier du laboratoire

Programme bactériologie 2ème année de médecine – Faculté de FES Partie 2 : Etude systématique des bactéries-E Spirochètes Treponema pallidum Leptospira Chlamydia Chlamydia trachomatis Chlamydia psittaci Chlamydia pneumoniae Mycoplasmes Rickettsia Coxiella Culture très particulière ou impossible. Diagnostic réservé à des laboratoires hautement spécialisés. Place majeure de la Biologie Moléculaire